MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gramella forsetii KT0803 chromosome

Total Repeats: 1529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008571	TTTCAG	2	12	409	420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120434373
2	NC_008571	ATTAAA	2	12	2046	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434376
3	NC_008571	AAATAA	2	12	2548	2559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	120434376
4	NC_008571	GCTTCA	2	12	3245	3256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008571	ATGGCG	2	12	6538	6549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120434380
6	NC_008571	ATTTCA	2	12	7717	7728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434380
7	NC_008571	AACTAA	2	12	9342	9353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	120434381
8	NC_008571	GTCACT	2	12	12980	12991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120434383
9	NC_008571	TTTGAA	2	12	14277	14288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008571	AAATAT	2	12	17017	17028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434387
11	NC_008571	ATAGAG	2	12	17971	17982	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120434387
12	NC_008571	ATAATT	2	12	21412	21423	50 %	50 %	0 %	0 %	120434391
13	NC_008571	TGGATC	2	12	25994	26005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434395
14	NC_008571	TCCATC	2	12	26057	26068	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	120434395
15	NC_008571	GCCATC	2	12	26462	26473	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120434395
16	NC_008571	TGGGTC	2	12	26672	26683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	120434395
17	NC_008571	TGGATC	2	12	27335	27346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434395
18	NC_008571	TGGATC	2	12	27497	27508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434395
19	NC_008571	TCCATC	2	12	27560	27571	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	120434395
20	NC_008571	GCCATC	2	12	27626	27637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120434395
21	NC_008571	CCATCG	2	12	28062	28073	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120434395
22	NC_008571	TTTCAA	2	12	30971	30982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434396
23	NC_008571	ATGCAA	2	12	33121	33132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120434399
24	NC_008571	CTCCTT	2	12	33477	33488	0 %	50 %	0 %	50 %	120434400
25	NC_008571	TTCCTT	2	12	34225	34236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120434400
26	NC_008571	ATCGCG	2	12	36490	36501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120434401
27	NC_008571	CATGGG	2	12	37126	37137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120434401
28	NC_008571	TGATAG	2	12	39514	39525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120434403
29	NC_008571	AAACGA	2	12	39936	39947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	120434403
30	NC_008571	CCGTGA	2	12	40980	40991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120434403
31	NC_008571	TTCCTC	2	12	45059	45070	0 %	50 %	0 %	50 %	120434405
32	NC_008571	TGGCAT	2	12	48627	48638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434407
33	NC_008571	GGTTTC	2	12	50367	50378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120434408
34	NC_008571	TTCCAG	2	12	51328	51339	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120434408
35	NC_008571	CTTTAT	2	12	54234	54245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008571	GAAAAA	2	12	54973	54984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	120434409
37	NC_008571	AATTTT	2	12	55349	55360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120434409
38	NC_008571	ATTTTT	2	12	61256	61267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	120434416
39	NC_008571	AAACTC	2	12	63424	63435	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120434418
40	NC_008571	CCCAGG	3	18	64286	64303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120434419
41	NC_008571	AAATAA	2	12	65018	65029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	120434419
42	NC_008571	AGGCGA	2	12	65843	65854	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120434421
43	NC_008571	CATTTC	2	12	66264	66275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120434421
44	NC_008571	TTTTAT	2	12	66846	66857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	120434421
45	NC_008571	TATCTG	2	12	73195	73206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120434426
46	NC_008571	CATCAG	2	12	73660	73671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120434426
47	NC_008571	GAATCT	2	12	73746	73757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120434426
48	NC_008571	CATCAG	2	12	75634	75645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120434426
49	NC_008571	CATCAG	2	12	77608	77619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120434426
50	NC_008571	TTACAC	2	12	80407	80418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120434426
51	NC_008571	GTATCT	2	12	82989	83000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120434426
52	NC_008571	CTATTA	2	12	83236	83247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434426
53	NC_008571	TCCAAA	2	12	85169	85180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120434426
54	NC_008571	TGAAAA	2	12	89877	89888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	120434428
55	NC_008571	GCAGAA	2	12	91147	91158	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	120434428
56	NC_008571	TTTTTG	2	12	95127	95138	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	120434433
57	NC_008571	GTCGCG	2	12	98336	98347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120434435
58	NC_008571	ATTCCG	2	12	99294	99305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008571	AAGCTC	2	12	102883	102894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120434442
60	NC_008571	CCAGAT	2	12	106684	106695	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120434446
61	NC_008571	TTTGAA	2	12	111687	111698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120434452
62	NC_008571	TAAGGA	2	12	111893	111904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120434452
63	NC_008571	GAAAAA	2	12	115343	115354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	120434456
64	NC_008571	TCTATT	2	12	122372	122383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120434465
65	NC_008571	AGTTAT	2	12	124468	124479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120434467
66	NC_008571	ATTTTC	2	12	129201	129212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120434468
67	NC_008571	GCCGCA	2	12	131238	131249	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120434471
68	NC_008571	ATGCTT	2	12	134630	134641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120434475
69	NC_008571	AATTTC	2	12	142917	142928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434484
70	NC_008571	GTATCG	2	12	146125	146136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434486
71	NC_008571	AAGAAA	2	12	149563	149574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	120434488
72	NC_008571	ATAAAG	2	12	150562	150573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	120434489
73	NC_008571	TTTTGA	2	12	150773	150784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434489
74	NC_008571	CCTTTA	2	12	153428	153439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120434491
75	NC_008571	AAAGCT	2	12	156335	156346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120434495
76	NC_008571	ATATGA	2	12	156662	156673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434496
77	NC_008571	CGATCT	2	12	161673	161684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120434503
78	NC_008571	TGCTTT	2	12	162403	162414	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	120434504
79	NC_008571	TTTCCT	2	12	163764	163775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120434505
80	NC_008571	TTAAAA	2	12	164660	164671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434507
81	NC_008571	TTTTGA	2	12	167144	167155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434508
82	NC_008571	AATTCT	2	12	170532	170543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434510
83	NC_008571	GAACAT	2	12	178785	178796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120434515
84	NC_008571	TTACTT	2	12	179567	179578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008571	TTTTGA	2	12	187322	187333	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434524
86	NC_008571	GGAAGA	2	12	188205	188216	50 %	0 %	50 %	0 %	120434525
87	NC_008571	AAAGAA	2	12	190171	190182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	120434527
88	NC_008571	AATGTT	2	12	192960	192971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120434528
89	NC_008571	ATTTAC	2	12	193343	193354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434529
90	NC_008571	AAGCTG	2	12	193402	193413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120434529
91	NC_008571	TGATCA	2	12	198691	198702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120434531
92	NC_008571	GCAGGT	2	12	199200	199211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120434531
93	NC_008571	AAATTA	2	12	200859	200870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434534
94	NC_008571	ATTTAC	2	12	204549	204560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434536
95	NC_008571	ATGTGA	2	12	204998	205009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120434536
96	NC_008571	TGTATT	2	12	206642	206653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434538
97	NC_008571	TATAAG	2	12	206935	206946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434538
98	NC_008571	ACAATT	2	12	208515	208526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008571	ATGGAA	2	12	212584	212595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120434544
100	NC_008571	GATCTG	2	12	213229	213240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434545
101	NC_008571	TGATGC	2	12	216551	216562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434548
102	NC_008571	ATTAAA	2	12	225763	225774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434552
103	NC_008571	ACCTCC	2	12	226627	226638	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	120434554
104	NC_008571	AATGAT	2	12	226850	226861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434554
105	NC_008571	ATATAG	2	12	227390	227401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434555
106	NC_008571	GTAGAA	2	12	227578	227589	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120434555
107	NC_008571	CCGTAT	2	12	229280	229291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120434556
108	NC_008571	AATGAT	2	12	229475	229486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434556
109	NC_008571	ATTTCA	2	12	231517	231528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434558
110	NC_008571	GTATTT	2	12	232787	232798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434559
111	NC_008571	AATAAA	2	12	235546	235557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	120434564
112	NC_008571	TCAAAT	2	12	240712	240723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120434569
113	NC_008571	TGGAAG	2	12	242224	242235	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	120434570
114	NC_008571	AAATGA	2	12	242243	242254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	120434570
115	NC_008571	TTATTT	2	12	244384	244395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008571	TATTGA	2	12	249994	250005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120434576
117	NC_008571	GGATCT	2	12	254838	254849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434581
118	NC_008571	TATTTC	2	12	256952	256963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120434583
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231	NC_008571	TTTTTC	2	12	574173	574184	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
232	NC_008571	TTCTAT	2	12	574284	574295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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234	NC_008571	TGAAGA	2	12	587897	587908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120434884
235	NC_008571	AAATAT	2	12	587976	587987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434884
236	NC_008571	ATTCCA	2	12	589788	589799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120434886
237	NC_008571	ATTAAA	2	12	593087	593098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120434892
238	NC_008571	TTCAAA	2	12	595002	595013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120434894
239	NC_008571	CTTTTA	2	12	597167	597178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120434894
240	NC_008571	TTGGAA	2	12	602574	602585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120434902
241	NC_008571	GGATTT	2	12	603362	603373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120434902
242	NC_008571	ATGGTT	3	18	607902	607919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120434904
243	NC_008571	ATGGCT	2	12	607920	607931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120434904
244	NC_008571	GGTTAT	2	12	607934	607945	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120434904
245	NC_008571	ATTTTG	2	12	610773	610784	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120434908
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261	NC_008571	CGAAAT	2	12	666744	666755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120434961
262	NC_008571	CAGGGA	2	12	669843	669854	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120434963
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264	NC_008571	TACCTG	2	12	672681	672692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120434967
265	NC_008571	TGGCTT	2	12	673057	673068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120434968
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267	NC_008571	TGGTAG	2	12	679087	679098	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008571	CGTTGA	2	12	679167	679178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
269	NC_008571	AATTTC	2	12	682507	682518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120434973
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272	NC_008571	GTATAA	2	12	697603	697614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120434985
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281	NC_008571	TCCAGA	2	12	728583	728594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120435018
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283	NC_008571	TTTTAA	2	12	734485	734496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120435021
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286	NC_008571	GAGAAT	2	12	742789	742800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008571	GTATCT	2	12	747825	747836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120435034
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294	NC_008571	TGAATC	2	12	775766	775777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120435057
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300	NC_008571	GGAAAA	2	12	781111	781122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120435061
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303	NC_008571	TCCAGT	2	12	786719	786730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120435066
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313	NC_008571	ATGAAT	2	12	807489	807500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_008571	ATTCCA	2	12	836919	836930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120435108
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323	NC_008571	TATTTC	2	12	839786	839797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435111
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328	NC_008571	ATCTTC	2	12	852106	852117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120435123
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332	NC_008571	TAATTT	2	12	873436	873447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120435140
333	NC_008571	AGCTTC	2	12	876693	876704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120435143
334	NC_008571	TACTGC	2	12	877317	877328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120435143
335	NC_008571	TTTATC	2	12	877542	877553	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435144
336	NC_008571	TTTCTA	2	12	881485	881496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435149
337	NC_008571	TATATT	2	12	882979	882990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120435151
338	NC_008571	ATTTTG	2	12	884039	884050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120435152
339	NC_008571	TTTGAA	2	12	895195	895206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120435164
340	NC_008571	CCAAGA	2	12	896890	896901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120435164
341	NC_008571	TGCCAG	2	12	899126	899137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120435166
342	NC_008571	AATACT	2	12	899996	900007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	120435166
343	NC_008571	ATTTCT	2	12	900579	900590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435166
344	NC_008571	TAAACC	2	12	902410	902421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120435168
345	NC_008571	TTCCTT	2	12	903724	903735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120435171
346	NC_008571	GTTTTT	2	12	905262	905273	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_008571	TATGAT	2	12	912146	912157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120435181
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349	NC_008571	TTTCCA	2	12	916253	916264	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120435186
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465	NC_008571	TTTTCT	2	12	1153965	1153976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	120435438
466	NC_008571	ATGATT	2	12	1157030	1157041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	120435440
467	NC_008571	ACCGGT	2	12	1160509	1160520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120435442
468	NC_008571	TTCCAG	2	12	1160758	1160769	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120435442
469	NC_008571	AAATTG	2	12	1163143	1163154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	120435446
470	NC_008571	TTCAAC	2	12	1164472	1164483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120435447
471	NC_008571	CTTTTA	2	12	1164592	1164603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
472	NC_008571	TTTCAG	2	12	1167458	1167469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120435451
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479	NC_008571	TTTTCA	2	12	1181106	1181117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435467
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482	NC_008571	GAGATC	2	12	1188308	1188319	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120435477
483	NC_008571	TAAAAA	2	12	1188939	1188950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_008571	TTCTAT	2	12	1194740	1194751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
485	NC_008571	TCCAGA	2	12	1195303	1195314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120435482
486	NC_008571	GAAATA	2	12	1199414	1199425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	120435490
487	NC_008571	GATAGA	2	12	1202545	1202556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120435496
488	NC_008571	CTTTTA	2	12	1202988	1202999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	120435497
489	NC_008571	TTTTGA	2	12	1208388	1208399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120435502
490	NC_008571	CATATT	2	12	1209375	1209386	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	120435503
491	NC_008571	TGAAGA	2	12	1209546	1209557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	120435503
492	NC_008571	ACTGAA	2	12	1209568	1209579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120435503
493	NC_008571	CCGATG	2	12	1211824	1211835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120435506
494	NC_008571	AAATAA	2	12	1213007	1213018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	120435506
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497	NC_008571	TACGAA	2	12	1218461	1218472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120435510
498	NC_008571	GAGAAA	2	12	1229516	1229527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120435520
499	NC_008571	AATAAC	2	12	1231037	1231048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	120435522
500	NC_008571	ATAGCA	2	12	1234887	1234898	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120435526

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