MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008570	CAAACC	2	12	29958	29969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008570	AAATAA	2	12	33123	33134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008570	GTTGCC	2	12	46825	46836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008570	TGATTT	2	12	68028	68039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008570	GGCTGG	2	12	105099	105110	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008570	ACTTTC	2	12	290770	290781	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008570	ATAGAG	2	12	292036	292047	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008570	TGATCC	2	12	302147	302158	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008570	CCCGCT	2	12	322997	323008	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008570	ATCCAT	2	12	365933	365944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008570	CCCAGC	2	12	418233	418244	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008570	AGCCAT	2	12	468256	468267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008570	CGGTGG	2	12	479115	479126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008570	GCTCAA	2	12	499921	499932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008570	CCCAGA	2	12	503978	503989	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008570	GGTCGG	2	12	578750	578761	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008570	AGCCGG	2	12	610133	610144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008570	TTGAAA	2	12	718677	718688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008570	GAAGAG	2	12	757303	757314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008570	TGCCGA	2	12	773435	773446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008570	CCCTCT	2	12	780299	780310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008570	ATCAAT	2	12	791240	791251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008570	GCAGGA	2	12	848335	848346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008570	CCTCTT	2	12	870964	870975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008570	GAGCGG	2	12	876330	876341	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008570	GAGGGG	2	12	877979	877990	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008570	ATAGAG	2	12	914877	914888	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008570	GAGCTG	2	12	1009505	1009516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008570	AGAATA	2	12	1157371	1157382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008570	TCATTT	2	12	1163334	1163345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008570	ATTCTT	2	12	1163967	1163978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008570	GTCGAG	2	12	1166045	1166056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008570	AGTGAT	2	12	1177932	1177943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008570	AGAGGG	2	12	1191798	1191809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008570	ATCCCA	2	12	1292770	1292781	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008570	TTTTCC	2	12	1294770	1294781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008570	GAGCTG	2	12	1329974	1329985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008570	TTGCGT	2	12	1379299	1379310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008570	GCGCGG	2	12	1410360	1410371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008570	CCTGAA	2	12	1462355	1462366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008570	CTGCCG	2	12	1504711	1504722	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008570	TTGAGA	2	12	1512446	1512457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008570	CCGCTG	2	12	1540730	1540741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008570	TTTGTC	2	12	1547099	1547110	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008570	TTGGAG	2	12	1553054	1553065	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008570	ATGATA	2	12	1584903	1584914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008570	TGTGAG	2	12	1675243	1675254	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008570	TGTTTT	2	12	1675279	1675290	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008570	ATTCCC	2	12	1708636	1708647	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008570	CAAAAG	2	12	1805626	1805637	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008570	CTTTTG	2	12	1805652	1805663	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008570	ATCATT	2	12	1816695	1816706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008570	GAGATA	2	12	1829799	1829810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008570	CTGGTT	2	12	1872822	1872833	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008570	GCAGCG	2	12	1876896	1876907	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008570	CGGCTT	2	12	1897317	1897328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008570	GAGGGG	2	12	1897414	1897425	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008570	AAGCGT	2	12	1904434	1904445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008570	AAATAG	2	12	1984251	1984262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008570	TGTCGA	5	30	1989881	1989910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008570	TAAAAT	2	12	2025173	2025184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008570	GCTGGC	2	12	2033673	2033684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008570	GCCGAC	2	12	2097942	2097953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008570	CAGGGC	2	12	2103105	2103116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008570	AGTGAA	2	12	2107429	2107440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008570	GAAAAA	2	12	2110031	2110042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008570	CGTGAC	2	12	2117490	2117501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008570	TTTGTG	2	12	2157456	2157467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008570	ACGTAA	2	12	2169445	2169456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008570	GGGGGC	2	12	2180119	2180130	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008570	TTCATA	2	12	2183267	2183278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008570	CAGGCA	2	12	2185407	2185418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008570	CCTACA	2	12	2190163	2190174	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008570	GTTGTA	2	12	2191183	2191194	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008570	CAAAAA	2	12	2202769	2202780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008570	CCCTCT	2	12	2203984	2203995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008570	CGTTCA	2	12	2231323	2231334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008570	AGGTGG	2	12	2237034	2237045	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008570	TTTGTC	2	12	2240673	2240684	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008570	TATCAT	3	18	2241309	2241326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008570	TGAGGA	2	12	2258137	2258148	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008570	CGTAAA	2	12	2287372	2287383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008570	GGCTCC	2	12	2335280	2335291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008570	GTTATT	2	12	2337695	2337706	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008570	CAGTAA	2	12	2366826	2366837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008570	AAAAAG	2	12	2398284	2398295	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008570	ATAAAA	2	12	2447963	2447974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008570	GCCGGC	2	12	2475535	2475546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008570	GCCAGC	2	12	2498519	2498530	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008570	CATCAC	2	12	2513492	2513503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008570	CTGTTG	2	12	2549780	2549791	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008570	AGGCCT	2	12	2570518	2570529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008570	GCCATC	2	12	2662506	2662517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008570	TGCCCT	2	12	2667442	2667453	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008570	CATTAA	2	12	2685528	2685539	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008570	ACGTAA	2	12	2691161	2691172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008570	AATGAT	2	12	2757504	2757515	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008570	CTCCTT	2	12	2766742	2766753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008570	GCTGAC	2	12	2770942	2770953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008570	CCCCAT	2	12	2774877	2774888	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008570	AAAGCC	2	12	2778711	2778722	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008570	CTTTTT	2	12	2858757	2858768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008570	GGCAGG	2	12	2864022	2864033	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008570	CACAGC	2	12	2874791	2874802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008570	ATAACA	2	12	2903642	2903653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008570	GGCAGG	2	12	2943998	2944009	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008570	GGCCTG	2	12	2945873	2945884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008570	CATAAA	2	12	2948399	2948410	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008570	GGCCAT	2	12	2979088	2979099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008570	TCAGAA	2	12	2999371	2999382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008570	CAAAAA	2	12	3035647	3035658	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008570	CTGGCC	2	12	3060300	3060311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008570	CAAAAA	2	12	3111097	3111108	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008570	AGGAGA	2	12	3126833	3126844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008570	GATGGC	2	12	3149794	3149805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008570	ATCAAA	2	12	3204294	3204305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008570	TGCCAT	2	12	3217462	3217473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008570	ACAGCA	2	12	3230891	3230902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008570	GCGGCT	2	12	3230921	3230932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008570	ATATGT	2	12	3268673	3268684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008570	TGCTAT	2	12	3293244	3293255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008570	TTGCCC	2	12	3316186	3316197	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008570	GCTTTT	2	12	3349575	3349586	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008570	GATAAT	2	12	3371565	3371576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008570	GAAACT	2	12	3376334	3376345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008570	GGCTCT	2	12	3388571	3388582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008570	CTCGCC	2	12	3388630	3388641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_008570	GCGCCT	2	12	3418576	3418587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008570	TGCCCC	2	12	3453035	3453046	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008570	TGGCCA	2	12	3454784	3454795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008570	TGCAAG	2	12	3454808	3454819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008570	CGGCAC	2	12	3528490	3528501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008570	CCCGGC	2	12	3588629	3588640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.