MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 3054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008570	CCGGGC	2	12	4657003	4657014	0 %	0 %	50 %	50 %	117618813
3002	NC_008570	TGGCGA	2	12	4657024	4657035	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117618813
3003	NC_008570	GCCATC	2	12	4658092	4658103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117619376
3004	NC_008570	ACTGCC	2	12	4658358	4658369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117619376
3005	NC_008570	CCGGCA	2	12	4658498	4658509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117619376
3006	NC_008570	CTCCCG	2	12	4660964	4660975	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	117621190
3007	NC_008570	GATCCC	2	12	4662377	4662388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117617825
3008	NC_008570	CGACTT	2	12	4664125	4664136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117620733
3009	NC_008570	TCGGCA	2	12	4664331	4664342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117620733
3010	NC_008570	CAAGGT	2	12	4665245	4665256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	117619638
3011	NC_008570	GCCTCG	2	12	4665873	4665884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	117620050
3012	NC_008570	CCCTGA	2	12	4666406	4666417	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117618474
3013	NC_008570	GCGTCA	2	12	4668636	4668647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117618985
3014	NC_008570	CCCCAG	2	12	4670327	4670338	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	117619471
3015	NC_008570	GCCCGG	2	12	4672075	4672086	0 %	0 %	50 %	50 %	117620240
3016	NC_008570	CGGAGC	2	12	4673619	4673630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	117620940
3017	NC_008570	GCCAGC	2	12	4674137	4674148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117620940
3018	NC_008570	GCCCTT	2	12	4676098	4676109	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	117618078
3019	NC_008570	CACGTC	2	12	4676305	4676316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117618078
3020	NC_008570	AGCATG	2	12	4681671	4681682	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3021	NC_008570	TGTGCA	2	12	4682115	4682126	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	117620908
3022	NC_008570	ATGGGC	2	12	4682670	4682681	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117621311
3023	NC_008570	TGGCCT	2	12	4684598	4684609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619185
3024	NC_008570	CTTGTC	2	12	4694306	4694317	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	117618529
3025	NC_008570	CGATCT	2	12	4695303	4695314	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117619566
3026	NC_008570	CCCTGA	2	12	4695437	4695448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117619566
3027	NC_008570	TTGGTG	2	12	4697174	4697185	0 %	50 %	50 %	0 %	117621498
3028	NC_008570	CGCAGC	2	12	4704151	4704162	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117620883
3029	NC_008570	CTCGGC	2	12	4705815	4705826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	117620189
3030	NC_008570	ATGCCG	2	12	4706352	4706363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117621306
3031	NC_008570	CGGCAT	2	12	4709172	4709183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117618062
3032	NC_008570	CTTGAG	2	12	4709365	4709376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	117618062
3033	NC_008570	TTCGGC	2	12	4709530	4709541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618062
3034	NC_008570	CGGCAC	2	12	4709643	4709654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117618062
3035	NC_008570	TCGGTG	2	12	4710455	4710466	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	117618062
3036	NC_008570	CTCTCC	2	12	4715221	4715232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117619394
3037	NC_008570	CTTCCA	2	12	4716983	4716994	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	117619655
3038	NC_008570	CAGCAC	2	12	4717350	4717361	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117619655
3039	NC_008570	ACGGGC	2	12	4718386	4718397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	117619208
3040	NC_008570	CCCGTT	2	12	4722614	4722625	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	117618536
3041	NC_008570	TTGGCC	2	12	4722916	4722927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618536
3042	NC_008570	CAGACC	2	12	4723174	4723185	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117619430
3043	NC_008570	GATACC	2	12	4723300	4723311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	117619430
3044	NC_008570	GTGCTG	2	12	4725690	4725701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	117617774
3045	NC_008570	CTGCAC	2	12	4728143	4728154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117619063
3046	NC_008570	GGGCGA	2	12	4728559	4728570	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	117619063
3047	NC_008570	CGCAAC	2	12	4731303	4731314	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117620411
3048	NC_008570	CTCTCC	2	12	4731840	4731851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117620411
3049	NC_008570	CGCCAT	2	12	4735069	4735080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117621312
3050	NC_008570	GCTGGA	2	12	4736673	4736684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117617612
3051	NC_008570	GCTGGC	2	12	4737243	4737254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117617612
3052	NC_008570	CCTTCT	2	12	4739939	4739950	0 %	50 %	0 %	50 %	117617478
3053	NC_008570	GCGCTT	2	12	4741872	4741883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619703
3054	NC_008570	TGCCGG	2	12	4742800	4742811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117621102

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.