MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 4697

< Previous12345678910Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008570	GC	3	6	4574790	4574795	0 %	0 %	50 %	50 %	117620918
4502	NC_008570	GC	3	6	4574998	4575003	0 %	0 %	50 %	50 %	117620918
4503	NC_008570	CG	3	6	4575307	4575312	0 %	0 %	50 %	50 %	117620918
4504	NC_008570	GC	3	6	4576639	4576644	0 %	0 %	50 %	50 %	117621322
4505	NC_008570	GC	3	6	4578010	4578015	0 %	0 %	50 %	50 %	117621322
4506	NC_008570	GA	3	6	4578053	4578058	50 %	0 %	50 %	0 %	117621322
4507	NC_008570	CT	4	8	4579120	4579127	0 %	50 %	0 %	50 %	117619296
4508	NC_008570	GA	3	6	4581190	4581195	50 %	0 %	50 %	0 %	117619602
4509	NC_008570	GA	3	6	4581337	4581342	50 %	0 %	50 %	0 %	117619602
4510	NC_008570	CG	3	6	4583860	4583865	0 %	0 %	50 %	50 %	117621460
4511	NC_008570	TG	3	6	4584886	4584891	0 %	50 %	50 %	0 %	117621460
4512	NC_008570	TG	3	6	4589514	4589519	0 %	50 %	50 %	0 %	117618292
4513	NC_008570	AG	3	6	4590065	4590070	50 %	0 %	50 %	0 %	117617945
4514	NC_008570	GC	3	6	4592761	4592766	0 %	0 %	50 %	50 %	117619573
4515	NC_008570	AG	3	6	4593588	4593593	50 %	0 %	50 %	0 %	117619633
4516	NC_008570	GC	3	6	4594074	4594079	0 %	0 %	50 %	50 %	117619633
4517	NC_008570	GC	3	6	4594107	4594112	0 %	0 %	50 %	50 %	117619633
4518	NC_008570	GC	3	6	4594572	4594577	0 %	0 %	50 %	50 %	117621206
4519	NC_008570	TC	3	6	4596536	4596541	0 %	50 %	0 %	50 %	117618904
4520	NC_008570	GC	3	6	4597015	4597020	0 %	0 %	50 %	50 %	117618904
4521	NC_008570	CT	3	6	4597412	4597417	0 %	50 %	0 %	50 %	117618904
4522	NC_008570	CG	3	6	4598526	4598531	0 %	0 %	50 %	50 %	117619495
4523	NC_008570	CT	3	6	4600085	4600090	0 %	50 %	0 %	50 %	117618895
4524	NC_008570	AT	3	6	4600528	4600533	50 %	50 %	0 %	0 %	117618315
4525	NC_008570	GT	3	6	4601926	4601931	0 %	50 %	50 %	0 %	117620556
4526	NC_008570	AT	3	6	4602157	4602162	50 %	50 %	0 %	0 %	117620556
4527	NC_008570	CT	3	6	4602266	4602271	0 %	50 %	0 %	50 %	117620556
4528	NC_008570	AG	3	6	4603213	4603218	50 %	0 %	50 %	0 %	117620556
4529	NC_008570	TC	3	6	4603735	4603740	0 %	50 %	0 %	50 %	117620556
4530	NC_008570	AG	3	6	4604501	4604506	50 %	0 %	50 %	0 %	117619686
4531	NC_008570	AC	3	6	4604551	4604556	50 %	0 %	0 %	50 %	117619686
4532	NC_008570	GA	4	8	4604960	4604967	50 %	0 %	50 %	0 %	117621125
4533	NC_008570	AT	3	6	4605399	4605404	50 %	50 %	0 %	0 %	117620151
4534	NC_008570	TC	3	6	4605577	4605582	0 %	50 %	0 %	50 %	117620151
4535	NC_008570	AT	3	6	4606143	4606148	50 %	50 %	0 %	0 %	117620557
4536	NC_008570	AT	4	8	4606666	4606673	50 %	50 %	0 %	0 %	117620557
4537	NC_008570	AT	3	6	4607018	4607023	50 %	50 %	0 %	0 %	117619932
4538	NC_008570	AT	3	6	4607301	4607306	50 %	50 %	0 %	0 %	117619932
4539	NC_008570	TA	3	6	4607781	4607786	50 %	50 %	0 %	0 %	117619932
4540	NC_008570	CT	3	6	4607946	4607951	0 %	50 %	0 %	50 %	117619932
4541	NC_008570	TA	3	6	4608098	4608103	50 %	50 %	0 %	0 %	117619932
4542	NC_008570	CA	4	8	4608362	4608369	50 %	0 %	0 %	50 %	117619932
4543	NC_008570	GA	3	6	4608560	4608565	50 %	0 %	50 %	0 %	117619932
4544	NC_008570	TA	4	8	4608635	4608642	50 %	50 %	0 %	0 %	117619932
4545	NC_008570	AG	3	6	4609428	4609433	50 %	0 %	50 %	0 %	117619041
4546	NC_008570	TA	3	6	4609484	4609489	50 %	50 %	0 %	0 %	117619041
4547	NC_008570	CT	3	6	4609829	4609834	0 %	50 %	0 %	50 %	117619041
4548	NC_008570	AT	4	8	4610062	4610069	50 %	50 %	0 %	0 %	117619041
4549	NC_008570	CT	3	6	4610572	4610577	0 %	50 %	0 %	50 %	117619944
4550	NC_008570	AT	3	6	4610965	4610970	50 %	50 %	0 %	0 %	117619944
4551	NC_008570	TA	3	6	4612071	4612076	50 %	50 %	0 %	0 %	117620016
4552	NC_008570	CA	3	6	4613174	4613179	50 %	0 %	0 %	50 %	117619297
4553	NC_008570	GA	4	8	4613213	4613220	50 %	0 %	50 %	0 %	117619297
4554	NC_008570	AG	3	6	4613552	4613557	50 %	0 %	50 %	0 %	117621524
4555	NC_008570	CA	3	6	4613904	4613909	50 %	0 %	0 %	50 %	117620829
4556	NC_008570	AT	3	6	4615584	4615589	50 %	50 %	0 %	0 %	117620191
4557	NC_008570	AT	3	6	4616290	4616295	50 %	50 %	0 %	0 %	117619181
4558	NC_008570	CT	3	6	4616336	4616341	0 %	50 %	0 %	50 %	117619181
4559	NC_008570	TA	3	6	4616389	4616394	50 %	50 %	0 %	0 %	117619181
4560	NC_008570	CT	4	8	4616879	4616886	0 %	50 %	0 %	50 %	117618739
4561	NC_008570	AT	3	6	4617177	4617182	50 %	50 %	0 %	0 %	117618739
4562	NC_008570	CA	3	6	4617366	4617371	50 %	0 %	0 %	50 %	117618739
4563	NC_008570	GA	3	6	4617426	4617431	50 %	0 %	50 %	0 %	117618739
4564	NC_008570	AT	3	6	4617591	4617596	50 %	50 %	0 %	0 %	117618739
4565	NC_008570	AT	3	6	4618023	4618028	50 %	50 %	0 %	0 %	117618046
4566	NC_008570	AT	3	6	4618041	4618046	50 %	50 %	0 %	0 %	117618046
4567	NC_008570	AT	3	6	4618068	4618073	50 %	50 %	0 %	0 %	117618046
4568	NC_008570	TA	3	6	4618795	4618800	50 %	50 %	0 %	0 %	117618046
4569	NC_008570	TC	3	6	4618907	4618912	0 %	50 %	0 %	50 %	117618046
4570	NC_008570	AT	3	6	4619067	4619072	50 %	50 %	0 %	0 %	117618046
4571	NC_008570	AT	3	6	4620298	4620303	50 %	50 %	0 %	0 %	117617842
4572	NC_008570	TC	3	6	4620634	4620639	0 %	50 %	0 %	50 %	117617842
4573	NC_008570	AT	4	8	4620680	4620687	50 %	50 %	0 %	0 %	117617842
4574	NC_008570	AT	3	6	4621947	4621952	50 %	50 %	0 %	0 %	117620068
4575	NC_008570	GC	3	6	4622336	4622341	0 %	0 %	50 %	50 %	117620068
4576	NC_008570	GC	3	6	4623229	4623234	0 %	0 %	50 %	50 %	117619522
4577	NC_008570	GC	3	6	4624352	4624357	0 %	0 %	50 %	50 %	117621278
4578	NC_008570	GC	3	6	4624769	4624774	0 %	0 %	50 %	50 %	117621278
4579	NC_008570	CG	4	8	4624880	4624887	0 %	0 %	50 %	50 %	117620690
4580	NC_008570	GC	4	8	4625248	4625255	0 %	0 %	50 %	50 %	117620690
4581	NC_008570	GC	3	6	4628187	4628192	0 %	0 %	50 %	50 %	117617781
4582	NC_008570	CG	3	6	4628386	4628391	0 %	0 %	50 %	50 %	117617781
4583	NC_008570	AG	3	6	4629156	4629161	50 %	0 %	50 %	0 %	117618544
4584	NC_008570	CA	3	6	4630038	4630043	50 %	0 %	0 %	50 %	117617730
4585	NC_008570	CG	3	6	4631080	4631085	0 %	0 %	50 %	50 %	117618321
4586	NC_008570	GC	3	6	4632033	4632038	0 %	0 %	50 %	50 %	117618321
4587	NC_008570	AG	3	6	4633482	4633487	50 %	0 %	50 %	0 %	117618317
4588	NC_008570	TG	3	6	4633973	4633978	0 %	50 %	50 %	0 %	117619031
4589	NC_008570	CT	3	6	4634072	4634077	0 %	50 %	0 %	50 %	117619031
4590	NC_008570	GA	3	6	4635257	4635262	50 %	0 %	50 %	0 %	117621329
4591	NC_008570	AG	3	6	4635264	4635269	50 %	0 %	50 %	0 %	117621329
4592	NC_008570	CT	3	6	4637137	4637142	0 %	50 %	0 %	50 %	117621199
4593	NC_008570	GC	3	6	4639105	4639110	0 %	0 %	50 %	50 %	117621352
4594	NC_008570	TC	3	6	4640491	4640496	0 %	50 %	0 %	50 %	117617624
4595	NC_008570	TC	3	6	4641519	4641524	0 %	50 %	0 %	50 %	117618142
4596	NC_008570	TC	3	6	4641576	4641581	0 %	50 %	0 %	50 %	117618142
4597	NC_008570	TC	3	6	4641672	4641677	0 %	50 %	0 %	50 %	117618142
4598	NC_008570	GC	3	6	4641899	4641904	0 %	0 %	50 %	50 %	117618142
4599	NC_008570	CG	3	6	4642858	4642863	0 %	0 %	50 %	50 %	117617965
4600	NC_008570	GC	3	6	4643674	4643679	0 %	0 %	50 %	50 %	117617965
4601	NC_008570	AG	4	8	4644778	4644785	50 %	0 %	50 %	0 %	117621228
4602	NC_008570	GC	3	6	4645234	4645239	0 %	0 %	50 %	50 %	117621228
4603	NC_008570	TC	3	6	4646251	4646256	0 %	50 %	0 %	50 %	117621138
4604	NC_008570	GC	3	6	4647873	4647878	0 %	0 %	50 %	50 %	117621138
4605	NC_008570	GC	3	6	4652406	4652411	0 %	0 %	50 %	50 %	117619375
4606	NC_008570	GA	3	6	4652576	4652581	50 %	0 %	50 %	0 %	117619375
4607	NC_008570	GC	3	6	4652689	4652694	0 %	0 %	50 %	50 %	117617937
4608	NC_008570	GA	3	6	4652893	4652898	50 %	0 %	50 %	0 %	117617937
4609	NC_008570	GA	3	6	4653823	4653828	50 %	0 %	50 %	0 %	117617937
4610	NC_008570	CG	3	6	4654172	4654177	0 %	0 %	50 %	50 %	117617937
4611	NC_008570	GC	3	6	4654393	4654398	0 %	0 %	50 %	50 %	117617937
4612	NC_008570	AG	3	6	4654796	4654801	50 %	0 %	50 %	0 %	117618429
4613	NC_008570	AG	3	6	4655037	4655042	50 %	0 %	50 %	0 %	117618429
4614	NC_008570	GC	3	6	4655413	4655418	0 %	0 %	50 %	50 %	117618429
4615	NC_008570	AG	3	6	4656374	4656379	50 %	0 %	50 %	0 %	117618813
4616	NC_008570	GC	3	6	4657447	4657452	0 %	0 %	50 %	50 %	117618813
4617	NC_008570	CG	3	6	4658609	4658614	0 %	0 %	50 %	50 %	117619376
4618	NC_008570	GC	3	6	4662055	4662060	0 %	0 %	50 %	50 %	117617825
4619	NC_008570	GA	3	6	4662070	4662075	50 %	0 %	50 %	0 %	117617825
4620	NC_008570	GT	3	6	4665568	4665573	0 %	50 %	50 %	0 %	117620050
4621	NC_008570	GC	3	6	4666560	4666565	0 %	0 %	50 %	50 %	117618474
4622	NC_008570	CT	3	6	4666825	4666830	0 %	50 %	0 %	50 %	117618474
4623	NC_008570	GC	3	6	4666860	4666865	0 %	0 %	50 %	50 %	117618474
4624	NC_008570	CG	3	6	4668828	4668833	0 %	0 %	50 %	50 %	117618985
4625	NC_008570	CG	3	6	4669882	4669887	0 %	0 %	50 %	50 %	117619471
4626	NC_008570	GC	3	6	4670475	4670480	0 %	0 %	50 %	50 %	117619471
4627	NC_008570	CG	3	6	4672464	4672469	0 %	0 %	50 %	50 %	117620240
4628	NC_008570	GC	3	6	4673041	4673046	0 %	0 %	50 %	50 %	117621501
4629	NC_008570	GC	3	6	4674322	4674327	0 %	0 %	50 %	50 %	117620940
4630	NC_008570	TG	3	6	4674884	4674889	0 %	50 %	50 %	0 %	117620940
4631	NC_008570	GA	4	8	4674922	4674929	50 %	0 %	50 %	0 %	117620940
4632	NC_008570	CG	3	6	4677072	4677077	0 %	0 %	50 %	50 %	117617491
4633	NC_008570	GC	3	6	4681473	4681478	0 %	0 %	50 %	50 %	117619890
4634	NC_008570	TC	3	6	4681490	4681495	0 %	50 %	0 %	50 %	117619890
4635	NC_008570	AG	3	6	4681951	4681956	50 %	0 %	50 %	0 %	117620908
4636	NC_008570	CA	3	6	4682241	4682246	50 %	0 %	0 %	50 %	117620908
4637	NC_008570	AT	3	6	4682659	4682664	50 %	50 %	0 %	0 %	117621311
4638	NC_008570	GA	3	6	4683046	4683051	50 %	0 %	50 %	0 %	117621311
4639	NC_008570	CG	3	6	4685925	4685930	0 %	0 %	50 %	50 %	117617563
4640	NC_008570	GC	3	6	4686817	4686822	0 %	0 %	50 %	50 %	117619886
4641	NC_008570	GC	3	6	4686975	4686980	0 %	0 %	50 %	50 %	117619886
4642	NC_008570	TC	3	6	4689543	4689548	0 %	50 %	0 %	50 %	117618178
4643	NC_008570	CG	3	6	4690057	4690062	0 %	0 %	50 %	50 %	117617816
4644	NC_008570	GA	3	6	4693362	4693367	50 %	0 %	50 %	0 %	117618529
4645	NC_008570	TC	4	8	4694512	4694519	0 %	50 %	0 %	50 %	117618529
4646	NC_008570	GC	3	6	4694555	4694560	0 %	0 %	50 %	50 %	117618529
4647	NC_008570	GC	3	6	4695843	4695848	0 %	0 %	50 %	50 %	117619566
4648	NC_008570	GC	3	6	4695987	4695992	0 %	0 %	50 %	50 %	117619566
4649	NC_008570	AC	3	6	4696775	4696780	50 %	0 %	0 %	50 %	117621498
4650	NC_008570	GC	3	6	4696795	4696800	0 %	0 %	50 %	50 %	117621498
4651	NC_008570	CA	3	6	4697281	4697286	50 %	0 %	0 %	50 %	117621498
4652	NC_008570	TG	3	6	4703420	4703425	0 %	50 %	50 %	0 %	117620883
4653	NC_008570	CG	3	6	4703612	4703617	0 %	0 %	50 %	50 %	117620883
4654	NC_008570	CT	3	6	4703869	4703874	0 %	50 %	0 %	50 %	117620883
4655	NC_008570	GC	3	6	4704283	4704288	0 %	0 %	50 %	50 %	117620883
4656	NC_008570	CG	3	6	4705849	4705854	0 %	0 %	50 %	50 %	117620189
4657	NC_008570	AG	4	8	4707309	4707316	50 %	0 %	50 %	0 %	117621306
4658	NC_008570	GA	3	6	4707450	4707455	50 %	0 %	50 %	0 %	117617716
4659	NC_008570	CT	3	6	4709486	4709491	0 %	50 %	0 %	50 %	117618062
4660	NC_008570	GA	3	6	4709789	4709794	50 %	0 %	50 %	0 %	117618062
4661	NC_008570	CA	3	6	4710825	4710830	50 %	0 %	0 %	50 %	117618062
4662	NC_008570	AG	3	6	4711791	4711796	50 %	0 %	50 %	0 %	117617885
4663	NC_008570	GT	3	6	4712111	4712116	0 %	50 %	50 %	0 %	117617885
4664	NC_008570	AG	3	6	4712332	4712337	50 %	0 %	50 %	0 %	117617885
4665	NC_008570	GC	3	6	4713527	4713532	0 %	0 %	50 %	50 %	117618476
4666	NC_008570	TC	3	6	4713602	4713607	0 %	50 %	0 %	50 %	117618476
4667	NC_008570	GC	3	6	4713842	4713847	0 %	0 %	50 %	50 %	117618476
4668	NC_008570	TC	3	6	4713974	4713979	0 %	50 %	0 %	50 %	117618786
4669	NC_008570	CT	3	6	4714066	4714071	0 %	50 %	0 %	50 %	117618786
4670	NC_008570	TC	3	6	4714352	4714357	0 %	50 %	0 %	50 %	117618786
4671	NC_008570	AG	3	6	4717588	4717593	50 %	0 %	50 %	0 %	117619655
4672	NC_008570	GA	3	6	4717638	4717643	50 %	0 %	50 %	0 %	117619655
4673	NC_008570	CG	3	6	4717861	4717866	0 %	0 %	50 %	50 %	117620223
4674	NC_008570	CG	3	6	4719232	4719237	0 %	0 %	50 %	50 %	117619208
4675	NC_008570	CA	3	6	4720212	4720217	50 %	0 %	0 %	50 %	117620323
4676	NC_008570	AG	3	6	4720643	4720648	50 %	0 %	50 %	0 %	117619857
4677	NC_008570	GA	3	6	4720692	4720697	50 %	0 %	50 %	0 %	117619857
4678	NC_008570	AC	3	6	4721481	4721486	50 %	0 %	0 %	50 %	117619857
4679	NC_008570	GC	3	6	4722206	4722211	0 %	0 %	50 %	50 %	117619177
4680	NC_008570	AG	3	6	4722960	4722965	50 %	0 %	50 %	0 %	117618536
4681	NC_008570	AT	3	6	4724190	4724195	50 %	50 %	0 %	0 %	117618969
4682	NC_008570	GC	3	6	4725680	4725685	0 %	0 %	50 %	50 %	117617774
4683	NC_008570	CT	3	6	4725752	4725757	0 %	50 %	0 %	50 %	117619690
4684	NC_008570	GA	3	6	4726159	4726164	50 %	0 %	50 %	0 %	117619690
4685	NC_008570	CA	3	6	4726486	4726491	50 %	0 %	0 %	50 %	117619690
4686	NC_008570	GA	3	6	4727859	4727864	50 %	0 %	50 %	0 %	117619063
4687	NC_008570	GC	3	6	4728831	4728836	0 %	0 %	50 %	50 %	117619063
4688	NC_008570	AG	3	6	4730494	4730499	50 %	0 %	50 %	0 %	117620411
4689	NC_008570	TC	4	8	4731881	4731888	0 %	50 %	0 %	50 %	117620411
4690	NC_008570	TC	3	6	4732756	4732761	0 %	50 %	0 %	50 %	117619977
4691	NC_008570	TC	3	6	4733163	4733168	0 %	50 %	0 %	50 %	117619977
4692	NC_008570	CG	3	6	4734531	4734536	0 %	0 %	50 %	50 %	117621312
4693	NC_008570	GC	3	6	4735369	4735374	0 %	0 %	50 %	50 %	117620874
4694	NC_008570	GC	3	6	4735961	4735966	0 %	0 %	50 %	50 %	117620874
4695	NC_008570	CG	3	6	4738504	4738509	0 %	0 %	50 %	50 %	117619237
4696	NC_008570	GA	3	6	4738893	4738898	50 %	0 %	50 %	0 %	117619237
4697	NC_008570	GA	3	6	4742895	4742900	50 %	0 %	50 %	0 %	117621102

< Previous12345678910Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.