MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	TGGGG	2	10	2781	2790	0 %	20 %	80 %	0 %	117621837
2	NC_008569	CAATC	2	10	3723	3732	40 %	20 %	0 %	40 %	117621838
3	NC_008569	TGTGG	2	10	4842	4851	0 %	40 %	60 %	0 %	117621839
4	NC_008569	GTACG	2	10	4971	4980	20 %	20 %	40 %	20 %	117621839
5	NC_008569	TCCTC	2	10	5397	5406	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_008569	CAAAT	2	10	6193	6202	60 %	20 %	0 %	20 %	117621841
7	NC_008569	TCAAG	2	10	6860	6869	40 %	20 %	20 %	20 %	117621843
8	NC_008569	CAAAG	2	10	7763	7772	60 %	0 %	20 %	20 %	117621843
9	NC_008569	TCAGT	2	10	9298	9307	20 %	40 %	20 %	20 %	117621843
10	NC_008569	ATCTA	2	10	9858	9867	40 %	40 %	0 %	20 %	117621844
11	NC_008569	CTATA	2	10	10199	10208	40 %	40 %	0 %	20 %	117621844
12	NC_008569	CCAAG	2	10	12262	12271	40 %	0 %	20 %	40 %	117621848
13	NC_008569	ACAAA	2	10	15683	15692	80 %	0 %	0 %	20 %	117621854
14	NC_008569	TCTAA	2	10	16940	16949	40 %	40 %	0 %	20 %	117621855
15	NC_008569	AAAAT	2	10	18702	18711	80 %	20 %	0 %	0 %	117621858
16	NC_008569	TAAAA	2	10	18733	18742	80 %	20 %	0 %	0 %	117621858
17	NC_008569	AATTA	2	10	19698	19707	60 %	40 %	0 %	0 %	117621859
18	NC_008569	CATAT	2	10	19836	19845	40 %	40 %	0 %	20 %	117621859
19	NC_008569	CAAAG	2	10	20724	20733	60 %	0 %	20 %	20 %	117621861
20	NC_008569	AACTT	2	10	22522	22531	40 %	40 %	0 %	20 %	117621861
21	NC_008569	TCAAA	2	10	22823	22832	60 %	20 %	0 %	20 %	117621862
22	NC_008569	TTTAC	2	10	23507	23516	20 %	60 %	0 %	20 %	117621862

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.