MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	TCAT	2	8	1892	1899	25 %	50 %	0 %	25 %	117621836
2	NC_008569	AATT	2	8	1938	1945	50 %	50 %	0 %	0 %	117621836
3	NC_008569	CAAA	2	8	2280	2287	75 %	0 %	0 %	25 %	117621836
4	NC_008569	GCAA	2	8	2551	2558	50 %	0 %	25 %	25 %	117621836
5	NC_008569	TCTT	2	8	2819	2826	0 %	75 %	0 %	25 %	117621837
6	NC_008569	AGCA	2	8	4207	4214	50 %	0 %	25 %	25 %	117621839
7	NC_008569	TATT	2	8	4506	4513	25 %	75 %	0 %	0 %	117621839
8	NC_008569	AAAG	2	8	5952	5959	75 %	0 %	25 %	0 %	117621840
9	NC_008569	AACA	2	8	6547	6554	75 %	0 %	0 %	25 %	117621842
10	NC_008569	GCAA	2	8	6647	6654	50 %	0 %	25 %	25 %	117621842
11	NC_008569	CAAT	2	8	7380	7387	50 %	25 %	0 %	25 %	117621843
12	NC_008569	CAAT	2	8	7812	7819	50 %	25 %	0 %	25 %	117621843
13	NC_008569	GAGC	2	8	8857	8864	25 %	0 %	50 %	25 %	117621843
14	NC_008569	TAAT	2	8	9159	9166	50 %	50 %	0 %	0 %	117621843
15	NC_008569	CCAA	2	8	9971	9978	50 %	0 %	0 %	50 %	117621844
16	NC_008569	TGTT	2	8	10229	10236	0 %	75 %	25 %	0 %	117621844
17	NC_008569	AAGA	2	8	10632	10639	75 %	0 %	25 %	0 %	117621845
18	NC_008569	GATT	2	8	10866	10873	25 %	50 %	25 %	0 %	117621846
19	NC_008569	ACTT	2	8	11175	11182	25 %	50 %	0 %	25 %	117621847
20	NC_008569	AAAC	2	8	11193	11200	75 %	0 %	0 %	25 %	117621847
21	NC_008569	GATT	2	8	11775	11782	25 %	50 %	25 %	0 %	117621848
22	NC_008569	TAAT	2	8	12403	12410	50 %	50 %	0 %	0 %	117621849
23	NC_008569	AATT	2	8	12776	12783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621849
24	NC_008569	GTTT	2	8	13045	13052	0 %	75 %	25 %	0 %	117621850
25	NC_008569	TGAA	2	8	13059	13066	50 %	25 %	25 %	0 %	117621850
26	NC_008569	CAAA	2	8	13433	13440	75 %	0 %	0 %	25 %	117621851
27	NC_008569	GAAA	2	8	14746	14753	75 %	0 %	25 %	0 %	117621851
28	NC_008569	GATC	2	8	14941	14948	25 %	25 %	25 %	25 %	117621851
29	NC_008569	AAAG	2	8	15021	15028	75 %	0 %	25 %	0 %	117621852
30	NC_008569	AAAT	2	8	15759	15766	75 %	25 %	0 %	0 %	117621854
31	NC_008569	GTTT	2	8	15960	15967	0 %	75 %	25 %	0 %	117621854
32	NC_008569	CAAA	2	8	15968	15975	75 %	0 %	0 %	25 %	117621854
33	NC_008569	AAAC	2	8	16518	16525	75 %	0 %	0 %	25 %	117621855
34	NC_008569	GGGA	2	8	16770	16777	25 %	0 %	75 %	0 %	117621855
35	NC_008569	AATA	2	8	16805	16812	75 %	25 %	0 %	0 %	117621855
36	NC_008569	ACAA	2	8	17018	17025	75 %	0 %	0 %	25 %	117621855
37	NC_008569	ATTT	2	8	17390	17397	25 %	75 %	0 %	0 %	117621856
38	NC_008569	TTTG	2	8	17424	17431	0 %	75 %	25 %	0 %	117621856
39	NC_008569	AGAA	2	8	17673	17680	75 %	0 %	25 %	0 %	117621856
40	NC_008569	TAAT	2	8	17681	17688	50 %	50 %	0 %	0 %	117621856
41	NC_008569	TTAT	2	8	18823	18830	25 %	75 %	0 %	0 %	117621858
42	NC_008569	TATT	2	8	19037	19044	25 %	75 %	0 %	0 %	117621858
43	NC_008569	GTAA	2	8	19134	19141	50 %	25 %	25 %	0 %	117621858
44	NC_008569	AAGT	2	8	19320	19327	50 %	25 %	25 %	0 %	117621859
45	NC_008569	TGTT	2	8	19347	19354	0 %	75 %	25 %	0 %	117621859
46	NC_008569	TATT	2	8	19919	19926	25 %	75 %	0 %	0 %	117621860
47	NC_008569	ATTT	2	8	20105	20112	25 %	75 %	0 %	0 %	117621860
48	NC_008569	TAGC	2	8	20759	20766	25 %	25 %	25 %	25 %	117621861
49	NC_008569	ACTT	2	8	21241	21248	25 %	50 %	0 %	25 %	117621861
50	NC_008569	AGAA	2	8	21343	21350	75 %	0 %	25 %	0 %	117621861
51	NC_008569	TATC	2	8	21897	21904	25 %	50 %	0 %	25 %	117621861
52	NC_008569	TAAT	2	8	22085	22092	50 %	50 %	0 %	0 %	117621861
53	NC_008569	GATA	2	8	23105	23112	50 %	25 %	25 %	0 %	117621862
54	NC_008569	TTAT	2	8	23298	23305	25 %	75 %	0 %	0 %	117621862
55	NC_008569	TCCT	2	8	24050	24057	0 %	50 %	0 %	50 %	117621863
56	NC_008569	AAAT	2	8	24189	24196	75 %	25 %	0 %	0 %	117621863

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.