MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	ACT	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621835
2	NC_008569	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
3	NC_008569	ATT	3	9	770	778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621835
4	NC_008569	ATA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
5	NC_008569	TTC	2	6	941	946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621835
6	NC_008569	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
7	NC_008569	GTT	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621835
8	NC_008569	TGT	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621835
9	NC_008569	CTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621836
10	NC_008569	TTG	4	12	1477	1488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
11	NC_008569	TCA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
12	NC_008569	TTG	2	6	1501	1506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
13	NC_008569	TTC	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621836
14	NC_008569	CAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
15	NC_008569	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
16	NC_008569	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
17	NC_008569	AAT	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
18	NC_008569	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
19	NC_008569	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
20	NC_008569	GTA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621836
21	NC_008569	TTG	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
22	NC_008569	AAG	2	6	2046	2051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621836
23	NC_008569	CAA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
24	NC_008569	CTA	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
25	NC_008569	ATC	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
26	NC_008569	ATG	2	6	2375	2380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621836
27	NC_008569	CTA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
28	NC_008569	ACA	2	6	2654	2659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
29	NC_008569	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
30	NC_008569	TTG	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621837
31	NC_008569	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621837
32	NC_008569	TCC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621838
33	NC_008569	AAT	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621838
34	NC_008569	TCT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621838
35	NC_008569	TCT	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621838
36	NC_008569	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621839
37	NC_008569	TTG	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
38	NC_008569	TAC	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
39	NC_008569	CTA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
40	NC_008569	TTC	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621839
41	NC_008569	CAT	2	6	4284	4289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
42	NC_008569	TAA	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
43	NC_008569	TCA	3	9	4317	4325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
44	NC_008569	TTA	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
45	NC_008569	ATT	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
46	NC_008569	TAA	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
47	NC_008569	GGC	3	9	4634	4642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621839
48	NC_008569	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
49	NC_008569	CAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621839
50	NC_008569	TGT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
51	NC_008569	TTG	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
52	NC_008569	TAA	2	6	5244	5249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
53	NC_008569	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
54	NC_008569	ATT	2	6	5694	5699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621840
55	NC_008569	TAC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621840
56	NC_008569	GAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
57	NC_008569	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
58	NC_008569	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
59	NC_008569	GTA	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
60	NC_008569	TGA	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
61	NC_008569	TGA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
62	NC_008569	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621842
63	NC_008569	TGA	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621842
64	NC_008569	TAC	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621842
65	NC_008569	CAG	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621842
66	NC_008569	ACT	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621843
67	NC_008569	GAA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
68	NC_008569	AGA	2	6	6997	7002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
69	NC_008569	ACA	2	6	7004	7009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
70	NC_008569	CTT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621843
71	NC_008569	AGA	2	6	7108	7113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
72	NC_008569	CAG	2	6	7140	7145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621843
73	NC_008569	AGA	2	6	7180	7185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
74	NC_008569	TTC	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621843
75	NC_008569	ATA	2	6	7236	7241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
76	NC_008569	CCT	2	6	7342	7347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621843
77	NC_008569	TAA	2	6	7449	7454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
78	NC_008569	TGA	3	9	7483	7491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621843
79	NC_008569	ATT	2	6	7529	7534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621843
80	NC_008569	ATG	2	6	7830	7835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621843
81	NC_008569	TTC	2	6	7854	7859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621843
82	NC_008569	GCA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621843
83	NC_008569	AAT	2	6	8011	8016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
84	NC_008569	CAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
85	NC_008569	TGA	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621843
86	NC_008569	GTT	2	6	8564	8569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621843
87	NC_008569	AAT	2	6	8735	8740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
88	NC_008569	AAG	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
89	NC_008569	CAA	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
90	NC_008569	GGA	2	6	8876	8881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621843
91	NC_008569	AAG	2	6	8892	8897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
92	NC_008569	GTC	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621843
93	NC_008569	TCA	2	6	8957	8962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621843
94	NC_008569	AAG	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
95	NC_008569	ATC	2	6	8986	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621843
96	NC_008569	AAT	2	6	9217	9222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
97	NC_008569	CAA	2	6	9241	9246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
98	NC_008569	AAC	2	6	9362	9367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
99	NC_008569	AGG	2	6	9531	9536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621843
100	NC_008569	TGA	2	6	9542	9547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621843
101	NC_008569	TGA	3	9	9552	9560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621844
102	NC_008569	GAA	2	6	9628	9633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621844
103	NC_008569	TTG	2	6	9668	9673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621844
104	NC_008569	ATT	2	6	9687	9692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621844
105	NC_008569	TAC	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621844
106	NC_008569	AGA	2	6	9843	9848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621844
107	NC_008569	ATT	2	6	9901	9906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621844
108	NC_008569	TTA	2	6	9980	9985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621844
109	NC_008569	GTT	2	6	10068	10073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621844
110	NC_008569	AAG	2	6	10139	10144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621844
111	NC_008569	CAG	2	6	10310	10315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621844
112	NC_008569	AAG	2	6	10337	10342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621844
113	NC_008569	TTG	2	6	10343	10348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621844
114	NC_008569	CTT	2	6	10367	10372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621844
115	NC_008569	AAG	2	6	10456	10461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621845
116	NC_008569	ATA	2	6	10561	10566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621845
117	NC_008569	AGA	2	6	10875	10880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621846
118	NC_008569	CTT	2	6	10883	10888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621846
119	NC_008569	GCA	2	6	11002	11007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621846
120	NC_008569	GTA	2	6	11029	11034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621846
121	NC_008569	GAA	2	6	11052	11057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621846
122	NC_008569	AGA	2	6	11138	11143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621847
123	NC_008569	ACT	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621847
124	NC_008569	ATT	2	6	11311	11316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621847
125	NC_008569	ATT	2	6	11419	11424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621847
126	NC_008569	AAT	2	6	11659	11664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621848
127	NC_008569	CTA	2	6	11684	11689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621848
128	NC_008569	GCA	2	6	11822	11827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621848
129	NC_008569	CTA	2	6	11832	11837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621848
130	NC_008569	CCG	2	6	11864	11869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621848
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.