MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	CTCATA	2	12	344	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
2	NC_008568	TCAAAA	2	12	1343	1354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008568	ATTACG	2	12	5184	5195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	117621804
4	NC_008568	ACAAAA	2	12	5207	5218	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	117621804
5	NC_008568	AGCTTA	2	12	7200	7211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008568	AATTAA	2	12	7919	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	AAGTTT	2	12	12308	12319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	117621812
8	NC_008568	CAAAAT	2	12	14205	14216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	117621813
9	NC_008568	TAAAAA	2	12	15365	15376	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621814
10	NC_008568	TTTAAA	2	12	16341	16352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	TAATAT	2	12	17300	17311	50 %	50 %	0 %	0 %	117621815
12	NC_008568	TAAAAT	2	12	17555	17566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621816
13	NC_008568	ATTAAT	2	12	17676	17687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	GAGGGG	2	12	18098	18109	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	117621817
15	NC_008568	AAATTA	2	12	18620	18631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	AAAGAA	2	12	19475	19486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	117621820
17	NC_008568	ATTATG	2	12	19551	19562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	117621820
18	NC_008568	AAATTA	2	12	22563	22574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	ATATTA	2	12	23509	23520	50 %	50 %	0 %	0 %	117621827
20	NC_008568	AGTTTT	2	12	23655	23666	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117621827
21	NC_008568	TCAAAA	2	12	26295	26306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	117621830
22	NC_008568	TACTTT	2	12	27995	28006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	117621832
23	NC_008568	TATTTC	2	12	28194	28205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.