MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	ATTAT	2	10	2417	2426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	ATTAA	2	10	2782	2791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008568	CTTAT	2	10	2947	2956	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008568	TCTTT	2	10	3655	3664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008568	ATTAT	2	10	4856	4865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008568	TTAAA	2	10	5574	5583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	TATTT	2	10	5590	5599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008568	CATAC	2	10	6094	6103	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008568	TTTAT	2	10	7821	7830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	AGATT	2	10	7976	7985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	AATAA	2	10	9114	9123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008568	ATTTT	2	10	11240	11249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008568	TAAAG	2	10	11539	11548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	AAATA	2	10	11624	11633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	TGCTT	2	10	13363	13372	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008568	TTTGC	2	10	13547	13556	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008568	TTTAA	2	10	14274	14283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	TAATA	3	15	15456	15470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	TAATA	2	10	15490	15499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008568	AAATT	2	10	15771	15780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	ATTTC	2	10	17390	17399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008568	TATCT	2	10	17448	17457	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008568	ATAAA	2	10	17623	17632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008568	TATTT	2	10	20588	20597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	TTAAA	2	10	27912	27921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008568	TCTAT	2	10	27957	27966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008568	ATATA	2	10	28232	28241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.