MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TGA	2	6	94	99	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	TAA	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008568	AAT	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008568	GAT	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	ACT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008568	ATT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	ATT	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008568	TAT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008568	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008568	TAA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008568	TAC	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008568	AAT	2	6	1194	1199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	ATT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	ATC	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008568	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008568	ATA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	TAG	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	CTA	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008568	AGT	3	9	2879	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	TTA	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008568	TAT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008568	ACA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008568	CTT	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008568	TAT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008568	ACT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008568	CAA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008568	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008568	CTA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008568	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008568	TTA	3	9	3512	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008568	ATC	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008568	CAA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008568	AGT	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008568	TAA	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008568	TAT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008568	TAC	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008568	TTA	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008568	CTT	2	6	3985	3990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008568	TTA	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008568	TAT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008568	TAA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008568	TCT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008568	TAC	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008568	AAT	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008568	ATT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008568	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008568	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008568	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008568	ACA	2	6	4773	4778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008568	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008568	ATT	3	9	5600	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008568	ATA	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008568	CTT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008568	TAA	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008568	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008568	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008568	AAT	2	6	5948	5953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008568	ATT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008568	ATT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008568	TAA	2	6	6029	6034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008568	TAT	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008568	AAT	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008568	ATT	2	6	6360	6365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008568	ATA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008568	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008568	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008568	TAA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008568	ATT	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008568	ATA	2	6	7874	7879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008568	TAT	3	9	7936	7944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008568	GTT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008568	ATT	2	6	9043	9048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008568	CTA	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008568	ATT	2	6	9519	9524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008568	AAT	2	6	9562	9567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008568	ACA	2	6	9587	9592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008568	TAA	2	6	10834	10839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008568	ATA	2	6	10939	10944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008568	AAT	2	6	10964	10969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008568	TAT	2	6	11027	11032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008568	TAA	2	6	11111	11116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008568	CAT	2	6	11123	11128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008568	CTT	2	6	11147	11152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008568	ATT	2	6	11306	11311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008568	TAA	2	6	11322	11327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008568	AGA	2	6	11394	11399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008568	ACA	2	6	11435	11440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008568	TAA	2	6	11476	11481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008568	ATA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008568	TAA	2	6	11618	11623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008568	ATA	2	6	11670	11675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008568	ATT	2	6	13012	13017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008568	TAT	2	6	13063	13068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008568	TAT	2	6	13225	13230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008568	AGT	2	6	13335	13340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008568	ATA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008568	TAA	3	9	13403	13411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008568	GAT	2	6	13432	13437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008568	ATA	2	6	13473	13478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008568	CAG	2	6	13748	13753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008568	GTA	2	6	13814	13819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008568	TAA	2	6	14359	14364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008568	ATT	2	6	14394	14399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008568	GGA	2	6	14414	14419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008568	AAG	2	6	14438	14443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008568	TTA	2	6	14550	14555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008568	TAT	2	6	14567	14572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008568	ATT	2	6	14576	14581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008568	ATT	2	6	15471	15476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008568	TAA	2	6	15527	15532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008568	ATA	3	9	15535	15543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008568	TAA	2	6	15594	15599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008568	ATA	2	6	15635	15640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008568	GAA	2	6	15647	15652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008568	TAA	2	6	15654	15659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008568	ATA	2	6	15752	15757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008568	TGC	2	6	15844	15849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008568	GTA	2	6	15924	15929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008568	GGT	2	6	15931	15936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008568	ATT	2	6	16017	16022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008568	TAA	2	6	16083	16088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008568	TAA	2	6	16148	16153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008568	AGT	2	6	16219	16224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008568	ATT	2	6	16297	16302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008568	TTA	2	6	16361	16366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008568	TCT	2	6	17340	17345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008568	TCT	2	6	17422	17427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008568	TTA	2	6	17458	17463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008568	AAT	2	6	17593	17598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008568	TAA	2	6	17700	17705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008568	TTA	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008568	AAG	2	6	17764	17769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008568	CTT	2	6	17861	17866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008568	TTC	2	6	17912	17917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008568	AGC	2	6	17925	17930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008568	CAC	2	6	18029	18034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008568	TAG	2	6	18038	18043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008568	GAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008568	TTA	2	6	18660	18665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008568	TTA	2	6	19000	19005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008568	AAT	2	6	19218	19223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008568	TCT	2	6	19283	19288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008568	AAT	2	6	19315	19320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008568	AAT	2	6	19387	19392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008568	ATG	2	6	20075	20080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008568	TAC	2	6	20115	20120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008568	TAA	2	6	20133	20138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.