MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TA	3	6	546	551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	AT	3	6	891	896	50 %	50 %	0 %	0 %	117621801
3	NC_008568	CA	3	6	968	973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008568	AT	3	6	1087	1092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	TA	3	6	1416	1421	50 %	50 %	0 %	0 %	117621802
6	NC_008568	CA	3	6	1981	1986	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
7	NC_008568	CA	3	6	2147	2152	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
8	NC_008568	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008568	AT	3	6	2556	2561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	AT	3	6	2577	2582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	AT	3	6	2598	2603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008568	AT	3	6	2619	2624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008568	AT	3	6	2640	2645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	AT	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008568	AT	3	6	2724	2729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	AT	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	TA	3	6	3309	3314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008568	TA	3	6	3496	3501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	AT	3	6	4065	4070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008568	CA	3	6	4146	4151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008568	AT	3	6	4272	4277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008568	AT	3	6	4835	4840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	AT	3	6	4872	4877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008568	TA	3	6	5643	5648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008568	TA	3	6	6146	6151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008568	TA	3	6	6301	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008568	TA	3	6	6390	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008568	AT	3	6	6447	6452	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
31	NC_008568	AT	3	6	6731	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
32	NC_008568	TC	3	6	6836	6841	0 %	50 %	0 %	50 %	117621805
33	NC_008568	AT	3	6	7171	7176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008568	TA	3	6	8002	8007	50 %	50 %	0 %	0 %	117621807
35	NC_008568	AT	3	6	9005	9010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008568	AT	3	6	9028	9033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008568	AT	3	6	9108	9113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008568	AT	3	6	9189	9194	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
39	NC_008568	AT	3	6	9456	9461	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
40	NC_008568	AT	3	6	9871	9876	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
41	NC_008568	AT	3	6	9941	9946	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
42	NC_008568	TA	3	6	10021	10026	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
43	NC_008568	AT	3	6	10305	10310	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
44	NC_008568	TA	3	6	10624	10629	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
45	NC_008568	GT	3	6	10670	10675	0 %	50 %	50 %	0 %	117621809
46	NC_008568	AT	3	6	11685	11690	50 %	50 %	0 %	0 %	117621811
47	NC_008568	TG	3	6	11790	11795	0 %	50 %	50 %	0 %	117621811
48	NC_008568	GA	3	6	11906	11911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008568	TG	3	6	12016	12021	0 %	50 %	50 %	0 %	117621812
50	NC_008568	AT	3	6	12597	12602	50 %	50 %	0 %	0 %	117621812
51	NC_008568	AT	3	6	12795	12800	50 %	50 %	0 %	0 %	117621812
52	NC_008568	AT	3	6	13145	13150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008568	TA	3	6	13184	13189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008568	TA	3	6	13211	13216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008568	TG	3	6	13346	13351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008568	AT	3	6	15725	15730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008568	GC	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008568	TA	3	6	15902	15907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008568	AT	3	6	16164	16169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008568	AT	4	8	16210	16217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008568	AT	3	6	16368	16373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008568	CT	3	6	16738	16743	0 %	50 %	0 %	50 %	117621815
63	NC_008568	AT	3	6	17716	17721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008568	AT	3	6	17950	17955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008568	AT	3	6	18322	18327	50 %	50 %	0 %	0 %	117621817
66	NC_008568	TA	3	6	18614	18619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008568	TA	3	6	18640	18645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008568	AT	3	6	18822	18827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008568	TA	3	6	18830	18835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008568	AT	3	6	18889	18894	50 %	50 %	0 %	0 %	117621818
71	NC_008568	AG	3	6	19570	19575	50 %	0 %	50 %	0 %	117621820
72	NC_008568	TA	3	6	19994	19999	50 %	50 %	0 %	0 %	117621820
73	NC_008568	AT	3	6	20269	20274	50 %	50 %	0 %	0 %	117621821
74	NC_008568	TA	3	6	20459	20464	50 %	50 %	0 %	0 %	117621821
75	NC_008568	TA	3	6	20683	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008568	TG	3	6	20730	20735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008568	AT	3	6	20879	20884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008568	AT	3	6	20935	20940	50 %	50 %	0 %	0 %	117621822
79	NC_008568	TA	3	6	21283	21288	50 %	50 %	0 %	0 %	117621822
80	NC_008568	TA	3	6	22551	22556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008568	AT	3	6	22745	22750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008568	TA	4	8	23528	23535	50 %	50 %	0 %	0 %	117621827
83	NC_008568	TA	4	8	23754	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008568	CA	3	6	24296	24301	50 %	0 %	0 %	50 %	117621828
85	NC_008568	TA	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	117621828
86	NC_008568	AC	3	6	25587	25592	50 %	0 %	0 %	50 %	117621830
87	NC_008568	AT	3	6	26403	26408	50 %	50 %	0 %	0 %	117621830
88	NC_008568	TG	3	6	27506	27511	0 %	50 %	50 %	0 %	117621831
89	NC_008568	GC	3	6	28097	28102	0 %	0 %	50 %	50 %	117621832
90	NC_008568	AT	3	6	28183	28188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.