MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	T	6	6	101	106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008568	A	6	6	155	160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008568	T	7	7	241	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	T	6	6	284	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008568	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	T	7	7	574	580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008568	T	6	6	651	656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008568	A	7	7	666	672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	A	6	6	1230	1235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	A	6	6	1332	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008568	A	6	6	1390	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008568	A	7	7	3045	3051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	T	6	6	3298	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	T	7	7	3673	3679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008568	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	T	9	9	4043	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	A	6	6	4415	4420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008568	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008568	C	6	6	4614	4619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_008568	T	6	6	4684	4689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008568	A	8	8	4785	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	T	7	7	4807	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008568	T	6	6	4894	4899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008568	A	7	7	5628	5634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008568	T	8	8	5731	5738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008568	A	8	8	5788	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008568	A	7	7	5896	5902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008568	A	8	8	5986	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008568	A	6	6	5997	6002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008568	T	6	6	6055	6060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008568	T	6	6	6313	6318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008568	A	8	8	7087	7094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008568	A	7	7	7141	7147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008568	A	6	6	7846	7851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008568	A	6	6	7929	7934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008568	T	6	6	8992	8997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008568	A	7	7	10904	10910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008568	T	6	6	10988	10993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008568	T	6	6	11188	11193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008568	T	8	8	11639	11646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008568	T	6	6	12993	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008568	A	7	7	13039	13045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008568	T	6	6	13247	13252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008568	T	7	7	13451	13457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008568	A	6	6	13764	13769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008568	A	6	6	13782	13787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008568	A	7	7	14230	14236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008568	A	7	7	15681	15687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008568	T	10	10	15948	15957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008568	A	7	7	16008	16014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008568	T	7	7	16021	16027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008568	T	7	7	16098	16104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008568	C	6	6	16157	16162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_008568	A	6	6	16259	16264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008568	T	7	7	16373	16379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008568	A	6	6	16394	16399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008568	A	7	7	17435	17441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008568	T	6	6	17793	17798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008568	A	9	9	17836	17844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008568	G	8	8	18049	18056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008568	A	6	6	18970	18975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008568	A	6	6	19331	19336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008568	T	6	6	20192	20197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008568	T	7	7	20691	20697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008568	A	7	7	20701	20707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008568	A	7	7	22543	22549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008568	A	6	6	22769	22774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008568	T	7	7	22813	22819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008568	T	6	6	23857	23862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008568	A	7	7	23863	23869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008568	A	6	6	23906	23911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008568	A	6	6	24737	24742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008568	T	6	6	27900	27905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008568	A	8	8	28217	28224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008568	T	6	6	28371	28376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.