MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	TTAATT	2	12	4788	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	TAAAAA	2	12	5942	5953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621755
3	NC_008567	AAATAA	2	12	6925	6936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008567	TGATAA	2	12	7033	7044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008567	ATTACT	2	12	8729	8740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008567	AAAACC	2	12	10328	10339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621762
7	NC_008567	ACTGGT	2	12	11064	11075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	117621762
8	NC_008567	AAAGAA	2	12	11805	11816	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	117621762
9	NC_008567	AAAATA	2	12	12817	12828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621762
10	NC_008567	TATGAA	2	12	12918	12929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	117621762
11	NC_008567	TTAATT	2	12	13160	13171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008567	TAAAAT	2	12	13600	13611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008567	AAAAGT	2	12	16217	16228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	117621769
14	NC_008567	TAATGA	2	12	17333	17344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	117621773
15	NC_008567	TAAAAT	2	12	19022	19033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008567	TAAAAA	2	12	21338	21349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621779
17	NC_008567	TTTTCT	2	12	23951	23962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	117621784
18	NC_008567	TTTATA	2	12	25165	25176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008567	TCTGAT	2	12	26016	26027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	117621786
20	NC_008567	AGTAAA	2	12	26096	26107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008567	CAATAT	2	12	26780	26791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	117621789
22	NC_008567	TTCAAT	2	12	27635	27646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	117621790

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.