MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	AATTT	2	10	1672	1681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	TTAAA	2	10	2247	2256	60 %	40 %	0 %	0 %	117621747
3	NC_008567	CCATC	2	10	3609	3618	20 %	20 %	0 %	60 %	117621750
4	NC_008567	AAAGG	2	10	3980	3989	60 %	0 %	40 %	0 %	117621751
5	NC_008567	AGAAA	2	10	4190	4199	80 %	0 %	20 %	0 %	117621752
6	NC_008567	AAAAT	2	10	4335	4344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008567	TATTT	2	10	4687	4696	20 %	80 %	0 %	0 %	117621753
8	NC_008567	TTTCA	2	10	4913	4922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008567	AATTA	2	10	5045	5054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008567	TAAAA	2	10	5150	5159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008567	AGCAA	2	10	5388	5397	60 %	0 %	20 %	20 %	117621754
12	NC_008567	TAATT	2	10	5844	5853	40 %	60 %	0 %	0 %	117621755
13	NC_008567	ATTTA	2	10	6011	6020	40 %	60 %	0 %	0 %	117621755
14	NC_008567	AAAAT	2	10	6545	6554	80 %	20 %	0 %	0 %	117621756
15	NC_008567	TAGAT	2	10	7474	7483	40 %	40 %	20 %	0 %	117621757
16	NC_008567	AAATA	2	10	8716	8725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	CAAAT	2	10	8742	8751	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008567	TATTT	2	10	10031	10040	20 %	80 %	0 %	0 %	117621762
19	NC_008567	TTAAT	2	10	11467	11476	40 %	60 %	0 %	0 %	117621762
20	NC_008567	TACAG	2	10	12235	12244	40 %	20 %	20 %	20 %	117621762
21	NC_008567	TATAC	2	10	13360	13369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008567	TTACA	2	10	13511	13520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008567	TGTAG	2	10	13583	13592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008567	TTTTA	2	10	14305	14314	20 %	80 %	0 %	0 %	117621764
25	NC_008567	AATTG	2	10	14617	14626	40 %	40 %	20 %	0 %	117621764
26	NC_008567	AAAAC	2	10	14962	14971	80 %	0 %	0 %	20 %	117621766
27	NC_008567	CAAAC	2	10	16115	16124	60 %	0 %	0 %	40 %	117621769
28	NC_008567	TATGT	2	10	16182	16191	20 %	60 %	20 %	0 %	117621769
29	NC_008567	ACAAA	2	10	16339	16348	80 %	0 %	0 %	20 %	117621769
30	NC_008567	TAAAA	2	10	17550	17559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008567	CACTT	2	10	18310	18319	20 %	40 %	0 %	40 %	117621775
32	NC_008567	AATTT	2	10	18701	18710	40 %	60 %	0 %	0 %	117621776
33	NC_008567	TTACA	2	10	18933	18942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008567	TGTAG	2	10	19005	19014	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008567	TTAAA	2	10	19359	19368	60 %	40 %	0 %	0 %	117621777
36	NC_008567	TTTTA	2	10	19723	19732	20 %	80 %	0 %	0 %	117621777
37	NC_008567	AAAAG	2	10	20116	20125	80 %	0 %	20 %	0 %	117621777
38	NC_008567	CAAAA	2	10	22011	22020	80 %	0 %	0 %	20 %	117621780
39	NC_008567	TTATT	2	10	22822	22831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008567	TTTTG	2	10	24505	24514	0 %	80 %	20 %	0 %	117621785
41	NC_008567	AGGGA	2	10	24853	24862	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008567	TTAAT	2	10	25796	25805	40 %	60 %	0 %	0 %	117621786
43	NC_008567	ATAAA	2	10	26152	26161	80 %	20 %	0 %	0 %	117621787
44	NC_008567	TTTTG	2	10	26770	26779	0 %	80 %	20 %	0 %	117621789
45	NC_008567	TCAAA	2	10	27310	27319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008567	GAATA	2	10	27499	27508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008567	AAATT	2	10	27981	27990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008567	TAAAT	2	10	28110	28119	60 %	40 %	0 %	0 %	117621791
49	NC_008567	TCAAA	2	10	28354	28363	60 %	20 %	0 %	20 %	117621791
50	NC_008567	AAAAC	2	10	28788	28797	80 %	0 %	0 %	20 %	117621791
51	NC_008567	AAATT	2	10	29044	29053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	TTAAA	2	10	29085	29094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008567	CTTTT	2	10	29558	29567	0 %	80 %	0 %	20 %	117621792
54	NC_008567	TTATC	2	10	29768	29777	20 %	60 %	0 %	20 %	117621792
55	NC_008567	GATTG	2	10	30166	30175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008567	TATAA	2	10	31187	31196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.