MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	TTAAA	2	10	2247	2256	60 %	40 %	0 %	0 %	117621747
2	NC_008567	CCATC	2	10	3609	3618	20 %	20 %	0 %	60 %	117621750
3	NC_008567	AAAGG	2	10	3980	3989	60 %	0 %	40 %	0 %	117621751
4	NC_008567	AGAAA	2	10	4190	4199	80 %	0 %	20 %	0 %	117621752
5	NC_008567	TATTT	2	10	4687	4696	20 %	80 %	0 %	0 %	117621753
6	NC_008567	AGCAA	2	10	5388	5397	60 %	0 %	20 %	20 %	117621754
7	NC_008567	TAATT	2	10	5844	5853	40 %	60 %	0 %	0 %	117621755
8	NC_008567	ATTTA	2	10	6011	6020	40 %	60 %	0 %	0 %	117621755
9	NC_008567	AAAAT	2	10	6545	6554	80 %	20 %	0 %	0 %	117621756
10	NC_008567	TAGAT	2	10	7474	7483	40 %	40 %	20 %	0 %	117621757
11	NC_008567	TATTT	2	10	10031	10040	20 %	80 %	0 %	0 %	117621762
12	NC_008567	TTAAT	2	10	11467	11476	40 %	60 %	0 %	0 %	117621762
13	NC_008567	TACAG	2	10	12235	12244	40 %	20 %	20 %	20 %	117621762
14	NC_008567	TTTTA	2	10	14305	14314	20 %	80 %	0 %	0 %	117621764
15	NC_008567	AATTG	2	10	14617	14626	40 %	40 %	20 %	0 %	117621764
16	NC_008567	AAAAC	2	10	14962	14971	80 %	0 %	0 %	20 %	117621766
17	NC_008567	CAAAC	2	10	16115	16124	60 %	0 %	0 %	40 %	117621769
18	NC_008567	TATGT	2	10	16182	16191	20 %	60 %	20 %	0 %	117621769
19	NC_008567	ACAAA	2	10	16339	16348	80 %	0 %	0 %	20 %	117621769
20	NC_008567	CACTT	2	10	18310	18319	20 %	40 %	0 %	40 %	117621775
21	NC_008567	AATTT	2	10	18701	18710	40 %	60 %	0 %	0 %	117621776
22	NC_008567	TTAAA	2	10	19359	19368	60 %	40 %	0 %	0 %	117621777
23	NC_008567	TTTTA	2	10	19723	19732	20 %	80 %	0 %	0 %	117621777
24	NC_008567	AAAAG	2	10	20116	20125	80 %	0 %	20 %	0 %	117621777
25	NC_008567	CAAAA	2	10	22011	22020	80 %	0 %	0 %	20 %	117621780
26	NC_008567	TTTTG	2	10	24505	24514	0 %	80 %	20 %	0 %	117621785
27	NC_008567	TTAAT	2	10	25796	25805	40 %	60 %	0 %	0 %	117621786
28	NC_008567	ATAAA	2	10	26152	26161	80 %	20 %	0 %	0 %	117621787
29	NC_008567	TTTTG	2	10	26770	26779	0 %	80 %	20 %	0 %	117621789
30	NC_008567	TAAAT	2	10	28110	28119	60 %	40 %	0 %	0 %	117621791
31	NC_008567	TCAAA	2	10	28354	28363	60 %	20 %	0 %	20 %	117621791
32	NC_008567	AAAAC	2	10	28788	28797	80 %	0 %	0 %	20 %	117621791
33	NC_008567	CTTTT	2	10	29558	29567	0 %	80 %	0 %	20 %	117621792
34	NC_008567	TTATC	2	10	29768	29777	20 %	60 %	0 %	20 %	117621792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.