MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	AGAT	2	8	214	221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	AGAT	2	8	231	238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008567	ATCA	2	8	469	476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008567	ATAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008567	ATTT	2	8	1348	1355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008567	TATT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008567	TAAA	2	8	1630	1637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008567	TAAT	2	8	1909	1916	50 %	50 %	0 %	0 %	117621746
9	NC_008567	TTGA	2	8	1965	1972	25 %	50 %	25 %	0 %	117621746
10	NC_008567	ATTA	2	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	117621746
11	NC_008567	AATT	2	8	2153	2160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008567	AGAT	2	8	2190	2197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008567	TTAA	2	8	2441	2448	50 %	50 %	0 %	0 %	117621748
14	NC_008567	ATTT	2	8	2719	2726	25 %	75 %	0 %	0 %	117621748
15	NC_008567	ATTA	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008567	TTTA	2	8	3200	3207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	GTTA	2	8	3666	3673	25 %	50 %	25 %	0 %	117621750
18	NC_008567	TGAT	2	8	3723	3730	25 %	50 %	25 %	0 %	117621751
19	NC_008567	ATAA	2	8	4019	4026	75 %	25 %	0 %	0 %	117621751
20	NC_008567	AAAT	2	8	4147	4154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008567	TTAT	2	8	4455	4462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008567	TAAA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008567	AGAA	2	8	5232	5239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008567	ATAA	2	8	5773	5780	75 %	25 %	0 %	0 %	117621755
25	NC_008567	AATA	2	8	6051	6058	75 %	25 %	0 %	0 %	117621755
26	NC_008567	ATTT	2	8	6229	6236	25 %	75 %	0 %	0 %	117621755
27	NC_008567	TTTA	2	8	6344	6351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008567	ATAA	2	8	6730	6737	75 %	25 %	0 %	0 %	117621756
29	NC_008567	TAAA	2	8	6761	6768	75 %	25 %	0 %	0 %	117621756
30	NC_008567	TAAA	2	8	7143	7150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008567	TTAA	2	8	7246	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008567	TAAA	2	8	7521	7528	75 %	25 %	0 %	0 %	117621757
33	NC_008567	ATTT	2	8	7655	7662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008567	GGGT	2	8	8677	8684	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008567	TAAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008567	ATTT	2	8	9005	9012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008567	TCTT	2	8	9119	9126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008567	TAAA	2	8	9255	9262	75 %	25 %	0 %	0 %	117621761
39	NC_008567	ATAA	2	8	9821	9828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008567	TAAA	2	8	10132	10139	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
41	NC_008567	AAAT	2	8	10357	10364	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
42	NC_008567	CTTT	2	8	10439	10446	0 %	75 %	0 %	25 %	117621762
43	NC_008567	AATT	2	8	10471	10478	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
44	NC_008567	TATT	2	8	10624	10631	25 %	75 %	0 %	0 %	117621762
45	NC_008567	ATAC	2	8	11459	11466	50 %	25 %	0 %	25 %	117621762
46	NC_008567	CTAG	2	8	11829	11836	25 %	25 %	25 %	25 %	117621762
47	NC_008567	AAAC	2	8	12089	12096	75 %	0 %	0 %	25 %	117621762
48	NC_008567	AAAT	2	8	12134	12141	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
49	NC_008567	TTTA	2	8	12261	12268	25 %	75 %	0 %	0 %	117621762
50	NC_008567	AGGC	2	8	12448	12455	25 %	0 %	50 %	25 %	117621762
51	NC_008567	TAAA	2	8	13213	13220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	TTAT	2	8	13233	13240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008567	TATT	2	8	13300	13307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008567	AATT	2	8	13350	13357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008567	ATTT	2	8	13614	13621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008567	CTAG	2	8	13750	13757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008567	AAAT	2	8	14434	14441	75 %	25 %	0 %	0 %	117621764
58	NC_008567	ACTA	2	8	14796	14803	50 %	25 %	0 %	25 %	117621765
59	NC_008567	ATTT	2	8	15155	15162	25 %	75 %	0 %	0 %	117621766
60	NC_008567	TTAC	2	8	15342	15349	25 %	50 %	0 %	25 %	117621766
61	NC_008567	ACTT	2	8	15447	15454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008567	TAAT	2	8	15629	15636	50 %	50 %	0 %	0 %	117621767
63	NC_008567	ACCT	2	8	15692	15699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008567	AAAC	2	8	15785	15792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008567	ATTA	2	8	16067	16074	50 %	50 %	0 %	0 %	117621769
66	NC_008567	ACTA	2	8	16456	16463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008567	TGAA	2	8	16568	16575	50 %	25 %	25 %	0 %	117621770
68	NC_008567	TGTT	2	8	17298	17305	0 %	75 %	25 %	0 %	117621772
69	NC_008567	CAAA	2	8	17689	17696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008567	TAAT	2	8	18203	18210	50 %	50 %	0 %	0 %	117621775
71	NC_008567	AACC	2	8	18372	18379	50 %	0 %	0 %	50 %	117621775
72	NC_008567	TAAA	3	12	18824	18835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008567	ATTT	2	8	19036	19043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008567	TAAT	2	8	19068	19075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008567	ATTA	2	8	19148	19155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008567	AAAT	2	8	19852	19859	75 %	25 %	0 %	0 %	117621777
77	NC_008567	ATTT	2	8	20353	20360	25 %	75 %	0 %	0 %	117621778
78	NC_008567	AAAC	2	8	20592	20599	75 %	0 %	0 %	25 %	117621778
79	NC_008567	GAAT	2	8	20712	20719	50 %	25 %	25 %	0 %	117621778
80	NC_008567	GATA	2	8	20937	20944	50 %	25 %	25 %	0 %	117621779
81	NC_008567	TAAA	2	8	21113	21120	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
82	NC_008567	ATCC	2	8	21132	21139	25 %	25 %	0 %	50 %	117621779
83	NC_008567	TAAA	2	8	21464	21471	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
84	NC_008567	TATG	2	8	21552	21559	25 %	50 %	25 %	0 %	117621779
85	NC_008567	TAAA	2	8	21570	21577	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
86	NC_008567	TAAA	2	8	21601	21608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008567	AAAG	2	8	22055	22062	75 %	0 %	25 %	0 %	117621780
88	NC_008567	GAAT	2	8	22237	22244	50 %	25 %	25 %	0 %	117621781
89	NC_008567	AGAT	2	8	22536	22543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008567	AGAT	2	8	22557	22564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008567	TAAG	2	8	23047	23054	50 %	25 %	25 %	0 %	117621782
92	NC_008567	AAGC	2	8	23132	23139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008567	ATTT	2	8	23314	23321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008567	AAAT	2	8	23450	23457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008567	ATAA	3	12	23504	23515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008567	GCTC	2	8	24053	24060	0 %	25 %	25 %	50 %	117621784
97	NC_008567	ATTT	2	8	24621	24628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008567	TAAA	2	8	24637	24644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008567	ACTT	2	8	26535	26542	25 %	50 %	0 %	25 %	117621788
100	NC_008567	TTTA	2	8	26649	26656	25 %	75 %	0 %	0 %	117621789
101	NC_008567	AAAC	2	8	27218	27225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008567	CAAA	2	8	28196	28203	75 %	0 %	0 %	25 %	117621791
103	NC_008567	ATTT	2	8	29065	29072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008567	TGCT	2	8	29361	29368	0 %	50 %	25 %	25 %	117621792
105	NC_008567	AAGA	2	8	30595	30602	75 %	0 %	25 %	0 %	117621796
106	NC_008567	GCTT	2	8	30948	30955	0 %	50 %	25 %	25 %	117621797
107	NC_008567	AGAT	2	8	31432	31439	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
108	NC_008567	AGAT	2	8	31486	31493	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
109	NC_008567	AGAT	2	8	31519	31526	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
110	NC_008567	AGAT	2	8	31552	31559	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
111	NC_008567	AGAT	2	8	31585	31592	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
112	NC_008567	ATTA	2	8	31865	31872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008567	ATTA	3	12	31878	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008567	TTGA	2	8	32089	32096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008567	GCAA	2	8	32228	32235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008567	TAAT	2	8	32298	32305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008567	ATAG	2	8	32319	32326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.