MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	AGAT	2	8	214	221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	AGAT	2	8	231	238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008567	ATCA	2	8	469	476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008567	ATAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008567	ATTT	2	8	1348	1355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008567	TATT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008567	TAAA	2	8	1630	1637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008567	AATT	2	8	2153	2160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008567	AGAT	2	8	2190	2197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008567	ATTA	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008567	TTTA	2	8	3200	3207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008567	AAAT	2	8	4147	4154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008567	TTAT	2	8	4455	4462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008567	TAAA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008567	AGAA	2	8	5232	5239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008567	TTTA	2	8	6344	6351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	TAAA	2	8	7143	7150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008567	TTAA	2	8	7246	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008567	ATTT	2	8	7655	7662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008567	GGGT	2	8	8677	8684	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008567	TAAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008567	ATTT	2	8	9005	9012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008567	TCTT	2	8	9119	9126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008567	ATAA	2	8	9821	9828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008567	TAAA	2	8	13213	13220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008567	TTAT	2	8	13233	13240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008567	TATT	2	8	13300	13307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008567	AATT	2	8	13350	13357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008567	ATTT	2	8	13614	13621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008567	CTAG	2	8	13750	13757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008567	ACTT	2	8	15447	15454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008567	ACCT	2	8	15692	15699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008567	AAAC	2	8	15785	15792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008567	ACTA	2	8	16456	16463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008567	CAAA	2	8	17689	17696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008567	TAAA	3	12	18824	18835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008567	ATTT	2	8	19036	19043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008567	TAAT	2	8	19068	19075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008567	ATTA	2	8	19148	19155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008567	TAAA	2	8	21601	21608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008567	AGAT	2	8	22536	22543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008567	AGAT	2	8	22557	22564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008567	AAGC	2	8	23132	23139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008567	ATTT	2	8	23314	23321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008567	AAAT	2	8	23450	23457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008567	ATAA	3	12	23504	23515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008567	ATTT	2	8	24621	24628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008567	TAAA	2	8	24637	24644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008567	AAAC	2	8	27218	27225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008567	ATTT	2	8	29065	29072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008567	ATTA	2	8	31865	31872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	ATTA	3	12	31878	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008567	TTGA	2	8	32089	32096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008567	GCAA	2	8	32228	32235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008567	TAAT	2	8	32298	32305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008567	ATAG	2	8	32319	32326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.