MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	TAAT	2	8	1909	1916	50 %	50 %	0 %	0 %	117621746
2	NC_008567	TTGA	2	8	1965	1972	25 %	50 %	25 %	0 %	117621746
3	NC_008567	ATTA	2	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	117621746
4	NC_008567	TTAA	2	8	2441	2448	50 %	50 %	0 %	0 %	117621748
5	NC_008567	ATTT	2	8	2719	2726	25 %	75 %	0 %	0 %	117621748
6	NC_008567	GTTA	2	8	3666	3673	25 %	50 %	25 %	0 %	117621750
7	NC_008567	TGAT	2	8	3723	3730	25 %	50 %	25 %	0 %	117621751
8	NC_008567	ATAA	2	8	4019	4026	75 %	25 %	0 %	0 %	117621751
9	NC_008567	ATAA	2	8	5773	5780	75 %	25 %	0 %	0 %	117621755
10	NC_008567	AATA	2	8	6051	6058	75 %	25 %	0 %	0 %	117621755
11	NC_008567	ATTT	2	8	6229	6236	25 %	75 %	0 %	0 %	117621755
12	NC_008567	ATAA	2	8	6730	6737	75 %	25 %	0 %	0 %	117621756
13	NC_008567	TAAA	2	8	6761	6768	75 %	25 %	0 %	0 %	117621756
14	NC_008567	TAAA	2	8	7521	7528	75 %	25 %	0 %	0 %	117621757
15	NC_008567	TAAA	2	8	9255	9262	75 %	25 %	0 %	0 %	117621761
16	NC_008567	TAAA	2	8	10132	10139	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
17	NC_008567	AAAT	2	8	10357	10364	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
18	NC_008567	CTTT	2	8	10439	10446	0 %	75 %	0 %	25 %	117621762
19	NC_008567	AATT	2	8	10471	10478	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
20	NC_008567	TATT	2	8	10624	10631	25 %	75 %	0 %	0 %	117621762
21	NC_008567	ATAC	2	8	11459	11466	50 %	25 %	0 %	25 %	117621762
22	NC_008567	CTAG	2	8	11829	11836	25 %	25 %	25 %	25 %	117621762
23	NC_008567	AAAC	2	8	12089	12096	75 %	0 %	0 %	25 %	117621762
24	NC_008567	AAAT	2	8	12134	12141	75 %	25 %	0 %	0 %	117621762
25	NC_008567	TTTA	2	8	12261	12268	25 %	75 %	0 %	0 %	117621762
26	NC_008567	AGGC	2	8	12448	12455	25 %	0 %	50 %	25 %	117621762
27	NC_008567	AAAT	2	8	14434	14441	75 %	25 %	0 %	0 %	117621764
28	NC_008567	ACTA	2	8	14796	14803	50 %	25 %	0 %	25 %	117621765
29	NC_008567	ATTT	2	8	15155	15162	25 %	75 %	0 %	0 %	117621766
30	NC_008567	TTAC	2	8	15342	15349	25 %	50 %	0 %	25 %	117621766
31	NC_008567	TAAT	2	8	15629	15636	50 %	50 %	0 %	0 %	117621767
32	NC_008567	ATTA	2	8	16067	16074	50 %	50 %	0 %	0 %	117621769
33	NC_008567	TGAA	2	8	16568	16575	50 %	25 %	25 %	0 %	117621770
34	NC_008567	TGTT	2	8	17298	17305	0 %	75 %	25 %	0 %	117621772
35	NC_008567	TAAT	2	8	18203	18210	50 %	50 %	0 %	0 %	117621775
36	NC_008567	AACC	2	8	18372	18379	50 %	0 %	0 %	50 %	117621775
37	NC_008567	AAAT	2	8	19852	19859	75 %	25 %	0 %	0 %	117621777
38	NC_008567	ATTT	2	8	20353	20360	25 %	75 %	0 %	0 %	117621778
39	NC_008567	AAAC	2	8	20592	20599	75 %	0 %	0 %	25 %	117621778
40	NC_008567	GAAT	2	8	20712	20719	50 %	25 %	25 %	0 %	117621778
41	NC_008567	GATA	2	8	20937	20944	50 %	25 %	25 %	0 %	117621779
42	NC_008567	TAAA	2	8	21113	21120	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
43	NC_008567	ATCC	2	8	21132	21139	25 %	25 %	0 %	50 %	117621779
44	NC_008567	TAAA	2	8	21464	21471	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
45	NC_008567	TATG	2	8	21552	21559	25 %	50 %	25 %	0 %	117621779
46	NC_008567	TAAA	2	8	21570	21577	75 %	25 %	0 %	0 %	117621779
47	NC_008567	AAAG	2	8	22055	22062	75 %	0 %	25 %	0 %	117621780
48	NC_008567	GAAT	2	8	22237	22244	50 %	25 %	25 %	0 %	117621781
49	NC_008567	TAAG	2	8	23047	23054	50 %	25 %	25 %	0 %	117621782
50	NC_008567	GCTC	2	8	24053	24060	0 %	25 %	25 %	50 %	117621784
51	NC_008567	ACTT	2	8	26535	26542	25 %	50 %	0 %	25 %	117621788
52	NC_008567	TTTA	2	8	26649	26656	25 %	75 %	0 %	0 %	117621789
53	NC_008567	CAAA	2	8	28196	28203	75 %	0 %	0 %	25 %	117621791
54	NC_008567	TGCT	2	8	29361	29368	0 %	50 %	25 %	25 %	117621792
55	NC_008567	AAGA	2	8	30595	30602	75 %	0 %	25 %	0 %	117621796
56	NC_008567	GCTT	2	8	30948	30955	0 %	50 %	25 %	25 %	117621797
57	NC_008567	AGAT	2	8	31432	31439	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
58	NC_008567	AGAT	2	8	31486	31493	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
59	NC_008567	AGAT	2	8	31519	31526	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
60	NC_008567	AGAT	2	8	31552	31559	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798
61	NC_008567	AGAT	2	8	31585	31592	50 %	25 %	25 %	0 %	117621798

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.