MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	TTA	2	6	83	88	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008567	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008567	TGC	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008567	TTA	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008567	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008567	AGA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008567	TTA	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008567	GAT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008567	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008567	GAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008567	ACT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008567	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008567	TAA	2	6	1388	1393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008567	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008567	ATT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	TAT	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008567	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008567	GAG	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008567	ATA	2	6	2123	2128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008567	TGT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008567	TAA	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008567	TTA	3	9	3111	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008567	ATT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008567	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008567	ATA	2	6	3154	3159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008567	TAT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008567	AAT	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008567	ATT	2	6	4141	4146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008567	ATG	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008567	TTA	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008567	TAT	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008567	AAT	2	6	5097	5102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008567	AGC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008567	AGA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008567	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008567	AGA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008567	AAT	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008567	TTA	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008567	TCA	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008567	AGA	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008567	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008567	GAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008567	ATA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008567	ACT	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008567	TAA	3	9	6965	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008567	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008567	AAT	2	6	7003	7008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008567	TAT	2	6	7162	7167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008567	TAA	2	6	7170	7175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008567	TAA	2	6	7183	7188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	TAG	2	6	8512	8517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008567	TAA	2	6	8524	8529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008567	TAA	2	6	8881	8886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008567	ATT	2	6	8921	8926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008567	AAG	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008567	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008567	AGC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008567	AAG	2	6	9547	9552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008567	AAG	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008567	TAA	2	6	9616	9621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008567	TAA	2	6	9699	9704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008567	TTA	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008567	TAA	2	6	9832	9837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008567	TAA	2	6	13144	13149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008567	ATT	2	6	13247	13252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008567	ATT	2	6	13419	13424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008567	TTA	2	6	13452	13457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008567	TAA	3	9	13659	13667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008567	TAA	2	6	13727	13732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008567	TTA	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008567	TAT	2	6	13768	13773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008567	TCA	2	6	15400	15405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008567	TAA	2	6	15489	15494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008567	CAA	2	6	15677	15682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008567	AAG	2	6	15703	15708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008567	AAT	2	6	15714	15719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008567	GAA	2	6	15901	15906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008567	CTA	2	6	15951	15956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008567	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008567	TTA	2	6	17230	17235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008567	AGA	2	6	17436	17441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008567	ATG	2	6	17540	17545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008567	TAA	2	6	17713	17718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008567	CCT	2	6	18805	18810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008567	AAC	2	6	18990	18995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008567	TAA	2	6	19081	19086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008567	AGG	2	6	19172	19177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008567	AGA	2	6	22518	22523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008567	TAA	2	6	22585	22590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008567	AGC	2	6	22666	22671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008567	TGA	2	6	22733	22738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008567	ATT	2	6	22741	22746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008567	TTA	2	6	22871	22876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008567	AAG	2	6	22886	22891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008567	ATA	2	6	22918	22923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008567	ATA	2	6	23148	23153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008567	ATA	2	6	23166	23171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008567	TTA	2	6	23180	23185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008567	TCT	2	6	23228	23233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008567	TAG	2	6	23236	23241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008567	TAA	2	6	23289	23294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008567	TAT	3	9	23323	23331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008567	TAA	2	6	23517	23522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008567	TAA	2	6	23526	23531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008567	TCT	2	6	24293	24298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008567	TTG	2	6	24729	24734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008567	GTT	2	6	24751	24756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008567	AAT	2	6	25012	25017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008567	CTA	2	6	25032	25037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008567	ATT	2	6	25137	25142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008567	TAT	2	6	25158	25163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008567	ATT	2	6	25268	25273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008567	ATT	2	6	25292	25297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008567	CTG	2	6	25453	25458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008567	TAT	2	6	25537	25542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008567	TGA	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008567	TTA	2	6	26291	26296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008567	TAA	2	6	26393	26398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008567	TGA	2	6	26402	26407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008567	TAA	2	6	26414	26419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008567	TAT	2	6	26456	26461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008567	TCT	2	6	26469	26474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008567	AAG	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008567	TAT	2	6	26519	26524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008567	ATG	2	6	26890	26895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008567	CAT	2	6	26923	26928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008567	TAA	2	6	27006	27011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008567	ATT	2	6	27128	27133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008567	AAC	2	6	27161	27166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008567	CAT	2	6	27248	27253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008567	AAT	2	6	27417	27422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008567	TAG	2	6	27477	27482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008567	AAG	2	6	27694	27699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008567	ATT	2	6	27710	27715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008567	TTG	2	6	27893	27898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008567	AGA	2	6	27918	27923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008567	ATT	3	9	28042	28050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008567	ATT	3	9	28061	28069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008567	TAA	2	6	28070	28075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008567	TGC	2	6	28957	28962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008567	TTC	2	6	28990	28995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008567	TTG	2	6	29077	29082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008567	ATT	2	6	29154	29159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008567	TTA	2	6	29170	29175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008567	TTA	2	6	29887	29892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008567	AGA	2	6	30126	30131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008567	ATT	2	6	30160	30165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008567	AGG	2	6	30482	30487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008567	TTC	2	6	30500	30505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008567	CAA	2	6	30737	30742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008567	AAG	2	6	30781	30786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008567	AAT	2	6	30793	30798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008567	TTA	2	6	31197	31202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_008567	AAT	2	6	32243	32248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008567	GTT	2	6	32254	32259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.