MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	AT	3	6	157	162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008567	AT	3	6	237	242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008567	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	117621744
5	NC_008567	TA	3	6	1284	1289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008567	CT	3	6	2133	2138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008567	AG	3	6	2832	2837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008567	TA	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008567	AT	3	6	3541	3546	50 %	50 %	0 %	0 %	117621750
10	NC_008567	AG	3	6	3805	3810	50 %	0 %	50 %	0 %	117621751
11	NC_008567	TA	3	6	3974	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	117621751
12	NC_008567	TA	3	6	4206	4211	50 %	50 %	0 %	0 %	117621752
13	NC_008567	TA	3	6	4536	4541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
14	NC_008567	AT	3	6	4545	4550	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
15	NC_008567	TA	3	6	4652	4657	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
16	NC_008567	AT	3	6	4859	4864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	AT	3	6	4893	4898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008567	AT	3	6	5125	5130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008567	AT	3	6	5444	5449	50 %	50 %	0 %	0 %	117621754
20	NC_008567	AT	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	117621754
21	NC_008567	TA	3	6	5542	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008567	AT	3	6	5637	5642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008567	AT	3	6	6458	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	117621756
24	NC_008567	AT	3	6	6680	6685	50 %	50 %	0 %	0 %	117621756
25	NC_008567	TA	4	8	7024	7031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008567	AT	3	6	7221	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008567	AT	3	6	7540	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	117621757
28	NC_008567	AT	3	6	7694	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008567	AT	3	6	8413	8418	50 %	50 %	0 %	0 %	117621760
30	NC_008567	TA	3	6	9127	9132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008567	TA	3	6	9226	9231	50 %	50 %	0 %	0 %	117621761
32	NC_008567	CT	3	6	9273	9278	0 %	50 %	0 %	50 %	117621761
33	NC_008567	AT	3	6	9682	9687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008567	TA	3	6	9712	9717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008567	TA	3	6	9782	9787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008567	AT	3	6	9847	9852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008567	TA	3	6	9900	9905	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
38	NC_008567	AT	3	6	9962	9967	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
39	NC_008567	AT	3	6	10717	10722	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
40	NC_008567	AT	3	6	11158	11163	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
41	NC_008567	AC	3	6	11299	11304	50 %	0 %	0 %	50 %	117621762
42	NC_008567	TA	3	6	12471	12476	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
43	NC_008567	TA	3	6	12847	12852	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
44	NC_008567	AT	3	6	13262	13267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008567	GT	3	6	13291	13296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008567	AC	3	6	13879	13884	50 %	0 %	0 %	50 %	117621763
47	NC_008567	AT	3	6	14409	14414	50 %	50 %	0 %	0 %	117621764
48	NC_008567	TA	3	6	15219	15224	50 %	50 %	0 %	0 %	117621766
49	NC_008567	AT	3	6	15849	15854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008567	AT	3	6	16250	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	117621769
51	NC_008567	AT	3	6	16544	16549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	AT	3	6	17144	17149	50 %	50 %	0 %	0 %	117621771
53	NC_008567	AT	3	6	17287	17292	50 %	50 %	0 %	0 %	117621772
54	NC_008567	GC	3	6	17561	17566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008567	AT	3	6	17767	17772	50 %	50 %	0 %	0 %	117621774
56	NC_008567	TA	4	8	21511	21518	50 %	50 %	0 %	0 %	117621779
57	NC_008567	AT	3	6	21887	21892	50 %	50 %	0 %	0 %	117621780
58	NC_008567	TA	3	6	21938	21943	50 %	50 %	0 %	0 %	117621780
59	NC_008567	AT	3	6	22362	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	117621781
60	NC_008567	AT	3	6	22449	22454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008567	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	117621782
62	NC_008567	TC	4	8	24611	24618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008567	AT	3	6	24669	24674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008567	AT	3	6	26283	26288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008567	TG	3	6	26445	26450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008567	AG	3	6	26463	26468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008567	AT	3	6	26497	26502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008567	TG	3	6	26856	26861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008567	TA	4	8	27188	27195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008567	AT	3	6	27719	27724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008567	TA	3	6	30059	30064	50 %	50 %	0 %	0 %	117621793
72	NC_008567	GT	3	6	30899	30904	0 %	50 %	50 %	0 %	117621797
73	NC_008567	TA	3	6	30969	30974	50 %	50 %	0 %	0 %	117621797
74	NC_008567	AG	3	6	31203	31208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008567	AT	3	6	31465	31470	50 %	50 %	0 %	0 %	117621798
76	NC_008567	TA	3	6	31901	31906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008567	AT	3	6	32281	32286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.