MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	GCAAGT	2	12	2879	2890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	AATTTT	2	12	4284	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
3	NC_008566	CATTAT	2	12	7698	7709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	117621715
4	NC_008566	TAATAT	2	12	8047	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	ATTAAT	2	12	8074	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	TTTTGT	2	12	8156	8167	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	ACTTTT	2	12	8301	8312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008566	TATATT	2	12	9727	9738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	ATTTAG	2	12	10086	10097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	117621718
10	NC_008566	ATCTTA	2	12	10770	10781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008566	TATTAA	2	12	10835	10846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008566	AAGAGA	2	12	12483	12494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621720
13	NC_008566	AATTTA	2	12	12777	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	117621720
14	NC_008566	TAGTTT	2	12	13351	13362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117621721
15	NC_008566	GATTTT	2	12	17542	17553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	TAAAAA	2	12	18290	18301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621725
17	NC_008566	TTTAAT	2	12	20381	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	ATGATA	2	12	20447	20458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008566	ATTTTT	2	12	20807	20818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	ATTTCA	2	12	22085	22096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008566	TTTATT	2	12	22536	22547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	AATTTA	2	12	23839	23850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	TTAAAT	2	12	25262	25273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	ATAAAA	2	12	26033	26044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	117621733
25	NC_008566	TGCAAT	2	12	26134	26145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	117621733
26	NC_008566	TAAAAT	2	12	27467	27478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	GAGATT	2	12	29275	29286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	CATATA	2	12	30000	30011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	117621740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.