MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	GCAAGT	2	12	2879	2890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	TAATAT	2	12	8047	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008566	ATTAAT	2	12	8074	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	TTTTGT	2	12	8156	8167	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	ACTTTT	2	12	8301	8312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008566	TATATT	2	12	9727	9738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	ATCTTA	2	12	10770	10781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008566	TATTAA	2	12	10835	10846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	GATTTT	2	12	17542	17553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	TTTAAT	2	12	20381	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008566	ATGATA	2	12	20447	20458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008566	ATTTTT	2	12	20807	20818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008566	ATTTCA	2	12	22085	22096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008566	TTTATT	2	12	22536	22547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008566	AATTTA	2	12	23839	23850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	TTAAAT	2	12	25262	25273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	TAAAAT	2	12	27467	27478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	GAGATT	2	12	29275	29286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.