MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	ATATA	2	10	926	935	60 %	40 %	0 %	0 %	117621707
2	NC_008566	TTGGG	2	10	1266	1275	0 %	40 %	60 %	0 %	117621707
3	NC_008566	TACAA	2	10	1727	1736	60 %	20 %	0 %	20 %	117621707
4	NC_008566	TTTAA	2	10	3400	3409	40 %	60 %	0 %	0 %	117621710
5	NC_008566	ATAAA	2	10	4112	4121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	CTATT	2	10	5006	5015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008566	ATTTT	2	10	5965	5974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008566	TTTAT	2	10	6262	6271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	ATTAT	2	10	6593	6602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	CTTAT	2	10	7256	7265	20 %	60 %	0 %	20 %	117621715
11	NC_008566	AATAT	2	10	7894	7903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008566	ATTTA	2	10	8169	8178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008566	CTTTA	2	10	9659	9668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008566	TCTTT	2	10	10040	10049	0 %	80 %	0 %	20 %	117621718
15	NC_008566	ATCTT	2	10	10903	10912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008566	AATTT	2	10	12868	12877	40 %	60 %	0 %	0 %	117621720
17	NC_008566	TATTT	2	10	13330	13339	20 %	80 %	0 %	0 %	117621721
18	NC_008566	TGAAA	2	10	13736	13745	60 %	20 %	20 %	0 %	117621722
19	NC_008566	ATAAA	2	10	14071	14080	80 %	20 %	0 %	0 %	117621722
20	NC_008566	AATTA	2	10	15113	15122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	ATAAG	2	10	15657	15666	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	GTTTT	2	10	17000	17009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	GAATT	2	10	19099	19108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	CTTTT	2	10	19402	19411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008566	GTTTA	2	10	19698	19707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	ATAAA	2	10	22578	22587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	AAATC	2	10	23276	23285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008566	TAGAA	2	10	24701	24710	60 %	20 %	20 %	0 %	117621732
29	NC_008566	TAATT	2	10	24810	24819	40 %	60 %	0 %	0 %	117621732
30	NC_008566	TTTTC	2	10	25084	25093	0 %	80 %	0 %	20 %	117621732
31	NC_008566	TATAT	2	10	25808	25817	40 %	60 %	0 %	0 %	117621733
32	NC_008566	TTTAA	2	10	26605	26614	40 %	60 %	0 %	0 %	117621736
33	NC_008566	ATAAA	2	10	27162	27171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	TTTTA	2	10	27354	27363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008566	ATTTT	2	10	28025	28034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008566	TATTT	2	10	28420	28429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	AATAA	2	10	28927	28936	80 %	20 %	0 %	0 %	117621739
38	NC_008566	TTCTT	2	10	30017	30026	0 %	80 %	0 %	20 %	117621740
39	NC_008566	TGTTT	2	10	30589	30598	0 %	80 %	20 %	0 %	117621740
40	NC_008566	AAGCT	2	10	32253	32262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008566	TCAAT	2	10	33411	33420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.