MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	ATAAA	2	10	4112	4121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008566	CTATT	2	10	5006	5015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008566	ATTTT	2	10	5965	5974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	TTTAT	2	10	6262	6271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	ATTAT	2	10	6593	6602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	AATAT	2	10	7894	7903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	ATTTA	2	10	8169	8178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008566	CTTTA	2	10	9659	9668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008566	ATCTT	2	10	10903	10912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008566	AATTA	2	10	15113	15122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008566	ATAAG	2	10	15657	15666	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008566	GTTTT	2	10	17000	17009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008566	GAATT	2	10	19099	19108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008566	CTTTT	2	10	19402	19411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008566	GTTTA	2	10	19698	19707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	ATAAA	2	10	22578	22587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	AAATC	2	10	23276	23285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008566	ATAAA	2	10	27162	27171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008566	TTTTA	2	10	27354	27363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	ATTTT	2	10	28025	28034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	TATTT	2	10	28420	28429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	AAGCT	2	10	32253	32262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008566	TCAAT	2	10	33411	33420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.