MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCAA	2	8	485	492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008566	ATTA	2	8	739	746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008566	ATTA	2	8	772	779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATTA	2	8	838	845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	ATTA	2	8	855	862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	ATTA	2	8	887	894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	TTGT	2	8	945	952	0 %	75 %	25 %	0 %	117621707
8	NC_008566	GTAT	2	8	1749	1756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	TAAT	2	8	1981	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	ATTA	2	8	1995	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008566	CAAA	2	8	2033	2040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008566	AATC	2	8	2081	2088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008566	ATAC	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008566	ATTT	2	8	2514	2521	25 %	75 %	0 %	0 %	117621708
15	NC_008566	ACTT	2	8	2911	2918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008566	TTTA	2	8	3203	3210	25 %	75 %	0 %	0 %	117621709
17	NC_008566	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	117621710
18	NC_008566	TTAT	2	8	3778	3785	25 %	75 %	0 %	0 %	117621710
19	NC_008566	TATT	2	8	3816	3823	25 %	75 %	0 %	0 %	117621711
20	NC_008566	TTTC	2	8	4096	4103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008566	TTAT	2	8	4221	4228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	TTAA	2	8	4241	4248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	ATTA	2	8	4385	4392	50 %	50 %	0 %	0 %	117621712
24	NC_008566	TTAC	2	8	4449	4456	25 %	50 %	0 %	25 %	117621712
25	NC_008566	ATTT	2	8	4831	4838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	ACTT	2	8	4954	4961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008566	GCTT	2	8	5193	5200	0 %	50 %	25 %	25 %	117621713
28	NC_008566	TTTA	2	8	5643	5650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	TAAA	2	8	6019	6026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	GCAA	2	8	6187	6194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008566	ATTT	2	8	6394	6401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	GAAG	2	8	6701	6708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008566	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	TTAT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	117621715
35	NC_008566	TTAA	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008566	TTTG	2	8	7880	7887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	AATT	2	8	8293	8300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008566	ATTA	2	8	8317	8324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008566	AATA	2	8	8497	8504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	TTAT	2	8	8526	8533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	TATT	2	8	8643	8650	25 %	75 %	0 %	0 %	117621716
42	NC_008566	AGAA	2	8	8843	8850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	TATT	2	8	9690	9697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008566	TGAT	2	8	9834	9841	25 %	50 %	25 %	0 %	117621718
45	NC_008566	ATCT	2	8	9849	9856	25 %	50 %	0 %	25 %	117621718
46	NC_008566	CTTT	2	8	10131	10138	0 %	75 %	0 %	25 %	117621718
47	NC_008566	AATA	2	8	10885	10892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	ATTT	2	8	10985	10992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008566	AAAT	2	8	11192	11199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008566	TAAT	2	8	11519	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
51	NC_008566	TAAA	2	8	11531	11538	75 %	25 %	0 %	0 %	117621719
52	NC_008566	AAAG	2	8	11659	11666	75 %	0 %	25 %	0 %	117621719
53	NC_008566	TCTT	2	8	12178	12185	0 %	75 %	0 %	25 %	117621719
54	NC_008566	ATAA	2	8	12307	12314	75 %	25 %	0 %	0 %	117621719
55	NC_008566	ATAA	2	8	12473	12480	75 %	25 %	0 %	0 %	117621720
56	NC_008566	ATGG	2	8	12696	12703	25 %	25 %	50 %	0 %	117621720
57	NC_008566	CTTT	2	8	12720	12727	0 %	75 %	0 %	25 %	117621720
58	NC_008566	TAAT	2	8	13611	13618	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
59	NC_008566	AAGA	2	8	14274	14281	75 %	0 %	25 %	0 %	117621722
60	NC_008566	AGTT	2	8	14394	14401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008566	TCTT	2	8	14590	14597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008566	TATT	2	8	14856	14863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008566	ATAA	2	8	14939	14946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008566	TTAA	2	8	14958	14965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	TAAT	2	8	15009	15016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008566	TTAA	2	8	15354	15361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	TTAT	2	8	15445	15452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008566	TATT	2	8	15575	15582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	AAAT	2	8	15591	15598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008566	TAAT	2	8	16584	16591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	TATT	2	8	16657	16664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	AGTA	2	8	16867	16874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008566	TTAT	2	8	16969	16976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008566	CTTA	2	8	17311	17318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008566	TATC	2	8	17362	17369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008566	CAAT	2	8	17516	17523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008566	TTAA	2	8	17570	17577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008566	ATTA	2	8	17813	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008566	AATT	2	8	17890	17897	50 %	50 %	0 %	0 %	117621724
80	NC_008566	AGTT	2	8	18209	18216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	ATCA	2	8	18267	18274	50 %	25 %	0 %	25 %	117621725
82	NC_008566	ATAA	2	8	18786	18793	75 %	25 %	0 %	0 %	117621726
83	NC_008566	ATAA	2	8	18908	18915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	TAAT	2	8	19059	19066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	ATCA	2	8	19067	19074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008566	ATTT	2	8	19158	19165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	TAAA	2	8	19335	19342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008566	ATTA	2	8	19629	19636	50 %	50 %	0 %	0 %	117621727
89	NC_008566	TTTA	2	8	19861	19868	25 %	75 %	0 %	0 %	117621728
90	NC_008566	ATTA	2	8	20285	20292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008566	TATT	2	8	20674	20681	25 %	75 %	0 %	0 %	117621729
92	NC_008566	TTTA	2	8	20685	20692	25 %	75 %	0 %	0 %	117621729
93	NC_008566	ATTA	2	8	20703	20710	50 %	50 %	0 %	0 %	117621729
94	NC_008566	ATTT	2	8	20888	20895	25 %	75 %	0 %	0 %	117621730
95	NC_008566	TTTA	2	8	21758	21765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008566	ATTT	2	8	21894	21901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008566	TAAT	2	8	22228	22235	50 %	50 %	0 %	0 %	117621731
98	NC_008566	AGTT	2	8	22356	22363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008566	TAGA	2	8	22635	22642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008566	TTTA	2	8	22900	22907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	AGAT	2	8	23130	23137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008566	ATTT	2	8	23203	23210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008566	AATC	2	8	23479	23486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008566	AAAT	2	8	23531	23538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	TTTG	2	8	23728	23735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008566	AAAT	2	8	24016	24023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008566	TTTA	2	8	24111	24118	25 %	75 %	0 %	0 %	117621732
108	NC_008566	TTTC	2	8	24482	24489	0 %	75 %	0 %	25 %	117621732
109	NC_008566	AATT	2	8	24896	24903	50 %	50 %	0 %	0 %	117621732
110	NC_008566	TCTT	2	8	24931	24938	0 %	75 %	0 %	25 %	117621732
111	NC_008566	CCAA	2	8	25399	25406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008566	CTTT	2	8	25503	25510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008566	AAAT	2	8	25587	25594	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
114	NC_008566	AAAT	2	8	25782	25789	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
115	NC_008566	AAAT	2	8	25879	25886	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
116	NC_008566	TTAA	2	8	26309	26316	50 %	50 %	0 %	0 %	117621733
117	NC_008566	AATA	2	8	26628	26635	75 %	25 %	0 %	0 %	117621736
118	NC_008566	AAAT	2	8	26688	26695	75 %	25 %	0 %	0 %	117621736
119	NC_008566	TCTT	2	8	27396	27403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008566	GAAA	2	8	27454	27461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008566	AATA	2	8	27543	27550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008566	TAAA	2	8	27763	27770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008566	ATTT	2	8	27987	27994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008566	TTAT	2	8	28141	28148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008566	TATT	2	8	28550	28557	25 %	75 %	0 %	0 %	117621738
126	NC_008566	TAAA	2	8	29174	29181	75 %	25 %	0 %	0 %	117621739
127	NC_008566	TTAA	2	8	29387	29394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008566	TTTG	2	8	29414	29421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008566	TGTA	2	8	29723	29730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008566	ATTT	2	8	29851	29858	25 %	75 %	0 %	0 %	117621740
131	NC_008566	ATAA	2	8	30135	30142	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
132	NC_008566	TAAT	2	8	30310	30317	50 %	50 %	0 %	0 %	117621740
133	NC_008566	TAAA	2	8	30334	30341	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
134	NC_008566	GAAG	2	8	30510	30517	50 %	0 %	50 %	0 %	117621740
135	NC_008566	TGAT	2	8	30994	31001	25 %	50 %	25 %	0 %	117621740
136	NC_008566	AAAT	2	8	31438	31445	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
137	NC_008566	TATT	2	8	31798	31805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008566	TTTA	2	8	31887	31894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008566	GATT	2	8	32090	32097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008566	TAAG	2	8	32112	32119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008566	TTTA	2	8	32351	32358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008566	ATAA	2	8	33033	33040	75 %	25 %	0 %	0 %	117621741
143	NC_008566	ATTT	2	8	33131	33138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008566	ATTT	2	8	33141	33148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008566	AAAT	2	8	33175	33182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008566	ATTT	2	8	33230	33237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008566	ATCT	2	8	33265	33272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008566	TTAG	2	8	33288	33295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008566	CTAT	2	8	33314	33321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008566	ATTT	2	8	33333	33340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008566	TATG	2	8	33483	33490	25 %	50 %	25 %	0 %	117621742
152	NC_008566	AAGA	2	8	33701	33708	75 %	0 %	25 %	0 %	117621742
153	NC_008566	ATTT	2	8	34218	34225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.