MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	TTGT	2	8	945	952	0 %	75 %	25 %	0 %	117621707
2	NC_008566	ATTT	2	8	2514	2521	25 %	75 %	0 %	0 %	117621708
3	NC_008566	TTTA	2	8	3203	3210	25 %	75 %	0 %	0 %	117621709
4	NC_008566	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	117621710
5	NC_008566	TTAT	2	8	3778	3785	25 %	75 %	0 %	0 %	117621710
6	NC_008566	TATT	2	8	3816	3823	25 %	75 %	0 %	0 %	117621711
7	NC_008566	ATTA	2	8	4385	4392	50 %	50 %	0 %	0 %	117621712
8	NC_008566	TTAC	2	8	4449	4456	25 %	50 %	0 %	25 %	117621712
9	NC_008566	GCTT	2	8	5193	5200	0 %	50 %	25 %	25 %	117621713
10	NC_008566	TTAT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	117621715
11	NC_008566	TATT	2	8	8643	8650	25 %	75 %	0 %	0 %	117621716
12	NC_008566	TGAT	2	8	9834	9841	25 %	50 %	25 %	0 %	117621718
13	NC_008566	ATCT	2	8	9849	9856	25 %	50 %	0 %	25 %	117621718
14	NC_008566	CTTT	2	8	10131	10138	0 %	75 %	0 %	25 %	117621718
15	NC_008566	TAAT	2	8	11519	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
16	NC_008566	TAAA	2	8	11531	11538	75 %	25 %	0 %	0 %	117621719
17	NC_008566	AAAG	2	8	11659	11666	75 %	0 %	25 %	0 %	117621719
18	NC_008566	TCTT	2	8	12178	12185	0 %	75 %	0 %	25 %	117621719
19	NC_008566	ATAA	2	8	12307	12314	75 %	25 %	0 %	0 %	117621719
20	NC_008566	ATAA	2	8	12473	12480	75 %	25 %	0 %	0 %	117621720
21	NC_008566	ATGG	2	8	12696	12703	25 %	25 %	50 %	0 %	117621720
22	NC_008566	CTTT	2	8	12720	12727	0 %	75 %	0 %	25 %	117621720
23	NC_008566	TAAT	2	8	13611	13618	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
24	NC_008566	AAGA	2	8	14274	14281	75 %	0 %	25 %	0 %	117621722
25	NC_008566	AATT	2	8	17890	17897	50 %	50 %	0 %	0 %	117621724
26	NC_008566	ATCA	2	8	18267	18274	50 %	25 %	0 %	25 %	117621725
27	NC_008566	ATAA	2	8	18786	18793	75 %	25 %	0 %	0 %	117621726
28	NC_008566	ATTA	2	8	19629	19636	50 %	50 %	0 %	0 %	117621727
29	NC_008566	TTTA	2	8	19861	19868	25 %	75 %	0 %	0 %	117621728
30	NC_008566	TATT	2	8	20674	20681	25 %	75 %	0 %	0 %	117621729
31	NC_008566	TTTA	2	8	20685	20692	25 %	75 %	0 %	0 %	117621729
32	NC_008566	ATTA	2	8	20703	20710	50 %	50 %	0 %	0 %	117621729
33	NC_008566	ATTT	2	8	20888	20895	25 %	75 %	0 %	0 %	117621730
34	NC_008566	TAAT	2	8	22228	22235	50 %	50 %	0 %	0 %	117621731
35	NC_008566	TTTA	2	8	24111	24118	25 %	75 %	0 %	0 %	117621732
36	NC_008566	TTTC	2	8	24482	24489	0 %	75 %	0 %	25 %	117621732
37	NC_008566	AATT	2	8	24896	24903	50 %	50 %	0 %	0 %	117621732
38	NC_008566	TCTT	2	8	24931	24938	0 %	75 %	0 %	25 %	117621732
39	NC_008566	AAAT	2	8	25587	25594	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
40	NC_008566	AAAT	2	8	25782	25789	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
41	NC_008566	AAAT	2	8	25879	25886	75 %	25 %	0 %	0 %	117621733
42	NC_008566	TTAA	2	8	26309	26316	50 %	50 %	0 %	0 %	117621733
43	NC_008566	AATA	2	8	26628	26635	75 %	25 %	0 %	0 %	117621736
44	NC_008566	AAAT	2	8	26688	26695	75 %	25 %	0 %	0 %	117621736
45	NC_008566	TATT	2	8	28550	28557	25 %	75 %	0 %	0 %	117621738
46	NC_008566	TAAA	2	8	29174	29181	75 %	25 %	0 %	0 %	117621739
47	NC_008566	ATTT	2	8	29851	29858	25 %	75 %	0 %	0 %	117621740
48	NC_008566	ATAA	2	8	30135	30142	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
49	NC_008566	TAAT	2	8	30310	30317	50 %	50 %	0 %	0 %	117621740
50	NC_008566	TAAA	2	8	30334	30341	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
51	NC_008566	GAAG	2	8	30510	30517	50 %	0 %	50 %	0 %	117621740
52	NC_008566	TGAT	2	8	30994	31001	25 %	50 %	25 %	0 %	117621740
53	NC_008566	AAAT	2	8	31438	31445	75 %	25 %	0 %	0 %	117621740
54	NC_008566	ATAA	2	8	33033	33040	75 %	25 %	0 %	0 %	117621741
55	NC_008566	TATG	2	8	33483	33490	25 %	50 %	25 %	0 %	117621742
56	NC_008566	AAGA	2	8	33701	33708	75 %	0 %	25 %	0 %	117621742

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.