MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	AGA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
2	NC_008566	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
3	NC_008566	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
4	NC_008566	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
5	NC_008566	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621707
6	NC_008566	AGA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
7	NC_008566	ATA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
8	NC_008566	TGT	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
9	NC_008566	CTT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621707
10	NC_008566	GAC	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621707
11	NC_008566	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
12	NC_008566	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
13	NC_008566	TTA	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
14	NC_008566	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
15	NC_008566	AGA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
16	NC_008566	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
17	NC_008566	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621708
18	NC_008566	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621709
19	NC_008566	TAT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621709
20	NC_008566	TAA	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621709
21	NC_008566	CTG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621709
22	NC_008566	CAT	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
23	NC_008566	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
24	NC_008566	AAC	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
25	NC_008566	ACC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621710
26	NC_008566	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
27	NC_008566	TTA	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
28	NC_008566	TTA	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
29	NC_008566	TTG	2	6	4319	4324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621712
30	NC_008566	TCA	4	12	4362	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
31	NC_008566	TTA	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
32	NC_008566	TTA	2	6	4665	4670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
33	NC_008566	TCA	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
34	NC_008566	TAA	2	6	5220	5225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621713
35	NC_008566	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621713
36	NC_008566	GTG	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621713
37	NC_008566	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
38	NC_008566	AGA	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621714
39	NC_008566	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
40	NC_008566	GTA	3	9	5717	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
41	NC_008566	TTA	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
42	NC_008566	TAG	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
43	NC_008566	ATG	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
44	NC_008566	AAT	2	6	5907	5912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621714
45	NC_008566	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
46	NC_008566	TAA	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
47	NC_008566	TCA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
48	NC_008566	TCA	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
49	NC_008566	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
50	NC_008566	ATC	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
51	NC_008566	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
52	NC_008566	TTA	2	6	7538	7543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
53	NC_008566	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
54	NC_008566	CTT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
55	NC_008566	ACT	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
56	NC_008566	CTT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
57	NC_008566	TTA	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
58	NC_008566	AAT	2	6	7730	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
59	NC_008566	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621716
60	NC_008566	AGA	2	6	8698	8703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621716
61	NC_008566	ATG	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621717
62	NC_008566	GAA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621717
63	NC_008566	TCC	2	6	8941	8946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621717
64	NC_008566	AGA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621717
65	NC_008566	AAT	2	6	9048	9053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621717
66	NC_008566	TAT	2	6	9191	9196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621717
67	NC_008566	AAC	2	6	9227	9232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621717
68	NC_008566	TTA	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621717
69	NC_008566	ACA	2	6	9351	9356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621717
70	NC_008566	CAT	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621718
71	NC_008566	ATT	2	6	9928	9933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621718
72	NC_008566	TAT	2	6	9985	9990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621718
73	NC_008566	TAT	2	6	10062	10067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621718
74	NC_008566	ATA	2	6	11447	11452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
75	NC_008566	TAA	2	6	11463	11468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
76	NC_008566	TAA	2	6	11472	11477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
77	NC_008566	ACT	2	6	11478	11483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621719
78	NC_008566	GAA	2	6	11545	11550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621719
79	NC_008566	TCA	3	9	11613	11621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621719
80	NC_008566	AGA	2	6	11697	11702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621719
81	NC_008566	TAG	2	6	11838	11843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621719
82	NC_008566	AGC	2	6	11850	11855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621719
83	NC_008566	TAA	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
84	NC_008566	TAA	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
85	NC_008566	ATA	2	6	12070	12075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621719
86	NC_008566	ATA	2	6	12437	12442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621720
87	NC_008566	ATA	2	6	12462	12467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621720
88	NC_008566	GAA	2	6	12515	12520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621720
89	NC_008566	ATA	2	6	12525	12530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621720
90	NC_008566	TAT	2	6	12539	12544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621720
91	NC_008566	TAA	2	6	12564	12569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621720
92	NC_008566	TTA	2	6	12637	12642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621720
93	NC_008566	AGA	2	6	12667	12672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621720
94	NC_008566	TAA	2	6	12673	12678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621720
95	NC_008566	TAT	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621720
96	NC_008566	AGG	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621721
97	NC_008566	ATA	2	6	13143	13148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621721
98	NC_008566	TTA	2	6	13157	13162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621721
99	NC_008566	TGA	2	6	13240	13245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621721
100	NC_008566	ATA	2	6	13266	13271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621721
101	NC_008566	TTA	2	6	13280	13285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621721
102	NC_008566	TTG	2	6	13488	13493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621721
103	NC_008566	TTA	2	6	13503	13508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621721
104	NC_008566	AGG	2	6	13527	13532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621721
105	NC_008566	ATT	2	6	13584	13589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621721
106	NC_008566	ATA	2	6	13590	13595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621721
107	NC_008566	AGA	2	6	13766	13771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621722
108	NC_008566	ATT	2	6	13772	13777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621722
109	NC_008566	TAA	2	6	13840	13845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621722
110	NC_008566	GAT	2	6	13887	13892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621722
111	NC_008566	TAA	3	9	13895	13903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621722
112	NC_008566	ATG	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621722
113	NC_008566	TGA	2	6	14165	14170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621722
114	NC_008566	TAT	2	6	14249	14254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621722
115	NC_008566	ATA	2	6	15793	15798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621723
116	NC_008566	TTG	2	6	15803	15808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621723
117	NC_008566	TCA	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621723
118	NC_008566	TAA	2	6	15920	15925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621723
119	NC_008566	GTT	2	6	15928	15933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621723
120	NC_008566	ATA	2	6	15964	15969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621723
121	NC_008566	TTG	2	6	16108	16113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621723
122	NC_008566	GGA	2	6	16214	16219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621723
123	NC_008566	TTC	2	6	16283	16288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621723
124	NC_008566	CAT	2	6	16292	16297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621723
125	NC_008566	AGT	2	6	16356	16361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621723
126	NC_008566	TCT	3	9	16386	16394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621723
127	NC_008566	TTG	2	6	16434	16439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621723
128	NC_008566	TTA	2	6	16516	16521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621723
129	NC_008566	GTG	2	6	18250	18255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621725
130	NC_008566	AAG	2	6	18340	18345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621725
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.