MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	AT	3	6	317	322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008566	AT	3	6	534	539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008566	AG	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621707
4	NC_008566	TA	3	6	2049	2054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	TA	3	6	2276	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	TA	3	6	2460	2465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	AT	3	6	2536	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
8	NC_008566	AC	3	6	2565	2570	50 %	0 %	0 %	50 %	117621708
9	NC_008566	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
10	NC_008566	AT	4	8	3044	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008566	TA	3	6	3103	3108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008566	AT	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	117621709
13	NC_008566	TA	3	6	4144	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008566	TA	3	6	5134	5139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008566	AT	3	6	6065	6070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	AT	3	6	6205	6210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	GT	3	6	6688	6693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	CA	3	6	6749	6754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008566	TA	3	6	6903	6908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	CT	3	6	7037	7042	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
21	NC_008566	CT	3	6	7097	7102	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
22	NC_008566	CT	3	6	7118	7123	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
23	NC_008566	AT	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
24	NC_008566	AC	4	8	7370	7377	50 %	0 %	0 %	50 %	117621715
25	NC_008566	AT	4	8	7776	7783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
26	NC_008566	AT	4	8	7833	7840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	TA	3	6	7870	7875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	AT	4	8	7900	7907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	TA	3	6	7917	7922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	TA	3	6	8191	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008566	TA	3	6	8407	8412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	AT	3	6	8448	8453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008566	TA	3	6	8520	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	TA	3	6	8555	8560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008566	AC	3	6	8837	8842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008566	TA	3	6	8854	8859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	AC	3	6	9302	9307	50 %	0 %	0 %	50 %	117621717
38	NC_008566	TA	3	6	9430	9435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008566	AG	3	6	10523	10528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	TA	3	6	10669	10674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	AT	3	6	10713	10718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008566	AT	4	8	10929	10936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	TA	4	8	11790	11797	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
44	NC_008566	TA	4	8	11924	11931	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
45	NC_008566	TA	4	8	11946	11953	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
46	NC_008566	AC	3	6	12110	12115	50 %	0 %	0 %	50 %	117621719
47	NC_008566	AT	3	6	12948	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	TA	3	6	13545	13550	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
49	NC_008566	TA	3	6	13565	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
50	NC_008566	TA	3	6	13948	13953	50 %	50 %	0 %	0 %	117621722
51	NC_008566	AT	3	6	14208	14213	50 %	50 %	0 %	0 %	117621722
52	NC_008566	GA	3	6	14639	14644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008566	AG	3	6	14702	14707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008566	TC	3	6	14714	14719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008566	AT	3	6	14990	14995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008566	AT	3	6	15393	15398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008566	TA	3	6	15583	15588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008566	TA	3	6	15635	15640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008566	GT	3	6	15853	15858	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
60	NC_008566	TA	3	6	16093	16098	50 %	50 %	0 %	0 %	117621723
61	NC_008566	GT	3	6	16179	16184	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
62	NC_008566	TA	3	6	16301	16306	50 %	50 %	0 %	0 %	117621723
63	NC_008566	TG	3	6	16317	16322	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
64	NC_008566	AT	3	6	16600	16605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	AT	3	6	16629	16634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008566	AT	3	6	17287	17292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	AC	3	6	17610	17615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008566	TA	4	8	17680	17687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	AT	3	6	17692	17697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008566	AT	3	6	17742	17747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	TA	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	TA	3	6	17907	17912	50 %	50 %	0 %	0 %	117621724
73	NC_008566	TA	3	6	18037	18042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008566	GA	3	6	18261	18266	50 %	0 %	50 %	0 %	117621725
75	NC_008566	TA	4	8	18897	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	117621726
76	NC_008566	TA	3	6	19183	19188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008566	AT	3	6	19373	19378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008566	CT	3	6	19832	19837	0 %	50 %	0 %	50 %	117621728
79	NC_008566	CA	3	6	19997	20002	50 %	0 %	0 %	50 %	117621728
80	NC_008566	AT	3	6	20079	20084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	AT	3	6	20473	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008566	TA	3	6	20594	20599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008566	AT	3	6	20932	20937	50 %	50 %	0 %	0 %	117621730
84	NC_008566	AT	5	10	21204	21213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	TA	3	6	21371	21376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008566	AT	4	8	21560	21567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	AT	3	6	21570	21575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008566	AT	3	6	21751	21756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	TA	3	6	22033	22038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008566	CT	3	6	22192	22197	0 %	50 %	0 %	50 %	117621731
91	NC_008566	TA	3	6	22643	22648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008566	AT	3	6	23101	23106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008566	CA	3	6	23334	23339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008566	AT	4	8	23613	23620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008566	AC	3	6	23742	23747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008566	TA	3	6	24320	24325	50 %	50 %	0 %	0 %	117621732
97	NC_008566	AT	3	6	25493	25498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008566	AT	3	6	26327	26332	50 %	50 %	0 %	0 %	117621734
99	NC_008566	GA	3	6	26928	26933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008566	AT	3	6	27729	27734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	TA	3	6	27932	27937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008566	TA	3	6	27965	27970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008566	AT	3	6	29770	29775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008566	TA	4	8	29786	29793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	AT	3	6	32215	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008566	CT	3	6	32445	32450	0 %	50 %	0 %	50 %	117621741
107	NC_008566	AT	4	8	32734	32741	50 %	50 %	0 %	0 %	117621741
108	NC_008566	AT	3	6	33377	33382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008566	TA	3	6	33505	33510	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
110	NC_008566	AT	3	6	33636	33641	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
111	NC_008566	AT	3	6	33892	33897	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
112	NC_008566	AT	3	6	33900	33905	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
113	NC_008566	TA	3	6	34001	34006	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.