MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	AAAATT	2	12	747	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	GAGAAA	2	12	3333	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621574
3	NC_008564	TTAGCA	2	12	7271	7282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	117621579
4	NC_008564	ACAATA	2	12	8061	8072	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	117621580
5	NC_008564	ATACAA	2	12	10035	10046	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	117621583
6	NC_008564	AAAGTC	2	12	11684	11695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	117621586
7	NC_008564	AAAGAC	2	12	12026	12037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	117621587
8	NC_008564	ACACTA	2	12	12498	12509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	117621587
9	NC_008564	TAAACT	2	12	14306	14317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	117621589
10	NC_008564	GAAAAA	2	12	14512	14523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	117621589
11	NC_008564	AAAGCA	2	12	15470	15481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	117621590
12	NC_008564	AATTAA	2	12	15487	15498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621590
13	NC_008564	TAAAGA	2	12	16944	16955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	117621592
14	NC_008564	TTTTTA	2	12	17494	17505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008564	CTAATT	2	12	19192	19203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008564	TTTTAA	2	12	20022	20033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	TTCTTG	2	12	20433	20444	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	117621597
18	NC_008564	AGAAAA	2	12	21620	21631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	117621599
19	NC_008564	ATAATT	2	12	24997	25008	50 %	50 %	0 %	0 %	117621604
20	NC_008564	TTCCAA	2	12	25911	25922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621604
21	NC_008564	TTTTGA	2	12	27543	27554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117621606
22	NC_008564	GTTTTA	2	12	33375	33386	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117621614
23	NC_008564	TTCCAA	2	12	34689	34700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621616
24	NC_008564	TACAAA	2	12	37356	37367	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	117621620
25	NC_008564	TTAATT	2	12	38757	38768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621622
26	NC_008564	TTCTTG	2	12	41204	41215	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	117621626
27	NC_008564	TCTCAA	2	12	41422	41433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621626
28	NC_008564	GTCAAA	2	12	47751	47762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	117621633
29	NC_008564	TTTCTA	2	12	49314	49325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	117621634
30	NC_008564	AGTTTA	2	12	50510	50521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008564	TTCTAA	2	12	51189	51200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	117621636
32	NC_008564	TAGTTT	3	18	53561	53578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008564	GTTTTA	2	12	53813	53824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117621639
34	NC_008564	TATTTC	2	12	54075	54086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	117621639
35	NC_008564	TTTCAT	2	12	57286	57297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	117621642
36	NC_008564	GGAATT	2	12	58639	58650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.