MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATATA	2	10	1696	1705	60 %	40 %	0 %	0 %	117621572
2	NC_008564	TACAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	0 %	20 %	117621572
3	NC_008564	TAAAT	2	10	2728	2737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008564	ATTTA	2	10	3443	3452	40 %	60 %	0 %	0 %	117621574
5	NC_008564	ATTAT	2	10	3849	3858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	GAATT	2	10	4091	4100	40 %	40 %	20 %	0 %	117621575
7	NC_008564	AAATT	2	10	4135	4144	60 %	40 %	0 %	0 %	117621575
8	NC_008564	GCATA	2	10	4955	4964	40 %	20 %	20 %	20 %	117621576
9	NC_008564	ATTAT	2	10	5432	5441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	CGTCT	2	10	5842	5851	0 %	40 %	20 %	40 %	117621577
11	NC_008564	TAAAT	2	10	6735	6744	60 %	40 %	0 %	0 %	117621577
12	NC_008564	AAGAA	2	10	7575	7584	80 %	0 %	20 %	0 %	117621579
13	NC_008564	CAATT	2	10	8230	8239	40 %	40 %	0 %	20 %	117621581
14	NC_008564	TATAC	2	10	8550	8559	40 %	40 %	0 %	20 %	117621581
15	NC_008564	AACAA	2	10	9585	9594	80 %	0 %	0 %	20 %	117621582
16	NC_008564	ACAAA	2	10	11503	11512	80 %	0 %	0 %	20 %	117621586
17	NC_008564	ATTTT	2	10	11789	11798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008564	TAATA	2	10	11863	11872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	GAAGT	2	10	13135	13144	40 %	20 %	40 %	0 %	117621588
20	NC_008564	TACTT	2	10	14125	14134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008564	CAAAA	2	10	14210	14219	80 %	0 %	0 %	20 %	117621589
22	NC_008564	ATAAA	2	10	14969	14978	80 %	20 %	0 %	0 %	117621589
23	NC_008564	AAAAC	2	10	14999	15008	80 %	0 %	0 %	20 %	117621589
24	NC_008564	GAAAA	2	10	15398	15407	80 %	0 %	20 %	0 %	117621589
25	NC_008564	ATTCA	2	10	16306	16315	40 %	40 %	0 %	20 %	117621591
26	NC_008564	GATTT	2	10	16677	16686	20 %	60 %	20 %	0 %	117621591
27	NC_008564	ATTTT	2	10	19646	19655	20 %	80 %	0 %	0 %	117621596
28	NC_008564	AATAG	2	10	19724	19733	60 %	20 %	20 %	0 %	117621596
29	NC_008564	AAATA	2	10	19843	19852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	ATTTT	2	10	19908	19917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008564	ATTTT	2	10	19935	19944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	TATTT	2	10	20307	20316	20 %	80 %	0 %	0 %	117621597
33	NC_008564	TAAAT	2	10	20566	20575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008564	AATAA	2	10	20629	20638	80 %	20 %	0 %	0 %	117621598
35	NC_008564	AATGA	2	10	22033	22042	60 %	20 %	20 %	0 %	117621599
36	NC_008564	CAAAA	2	10	22482	22491	80 %	0 %	0 %	20 %	117621599
37	NC_008564	TAATT	2	10	22809	22818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008564	AATTA	2	10	23633	23642	60 %	40 %	0 %	0 %	117621602
39	NC_008564	GAAGA	2	10	26769	26778	60 %	0 %	40 %	0 %	117621605
40	NC_008564	ATTTT	2	10	27877	27886	20 %	80 %	0 %	0 %	117621606
41	NC_008564	TGCTT	2	10	29596	29605	0 %	60 %	20 %	20 %	117621608
42	NC_008564	ATTTT	2	10	30343	30352	20 %	80 %	0 %	0 %	117621609
43	NC_008564	CAAAT	2	10	31267	31276	60 %	20 %	0 %	20 %	117621610
44	NC_008564	TTTAA	2	10	31997	32006	40 %	60 %	0 %	0 %	117621611
45	NC_008564	GAAAT	2	10	32170	32179	60 %	20 %	20 %	0 %	117621612
46	NC_008564	TTAAT	2	10	34507	34516	40 %	60 %	0 %	0 %	117621615
47	NC_008564	AGTAC	2	10	34635	34644	40 %	20 %	20 %	20 %	117621616
48	NC_008564	GTTTA	2	10	35339	35348	20 %	60 %	20 %	0 %	117621617
49	NC_008564	AGCTT	2	10	36308	36317	20 %	40 %	20 %	20 %	117621619
50	NC_008564	TTTGT	2	10	37777	37786	0 %	80 %	20 %	0 %	117621621
51	NC_008564	ATTTT	2	10	38684	38693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008564	CTTTA	2	10	38695	38704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008564	TATTT	2	10	39079	39088	20 %	80 %	0 %	0 %	117621623
54	NC_008564	AAATC	2	10	39305	39314	60 %	20 %	0 %	20 %	117621623
55	NC_008564	TGGGT	2	10	40336	40345	0 %	40 %	60 %	0 %	117621625
56	NC_008564	GAATT	2	10	41558	41567	40 %	40 %	20 %	0 %	117621626
57	NC_008564	TGATT	2	10	42615	42624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008564	TTTGA	2	10	43563	43572	20 %	60 %	20 %	0 %	117621628
59	NC_008564	ATTTG	2	10	44628	44637	20 %	60 %	20 %	0 %	117621629
60	NC_008564	TTATC	2	10	46582	46591	20 %	60 %	0 %	20 %	117621632
61	NC_008564	TTTGT	2	10	47157	47166	0 %	80 %	20 %	0 %	117621632
62	NC_008564	AATAA	2	10	47451	47460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008564	ATTTT	2	10	49142	49151	20 %	80 %	0 %	0 %	117621634
64	NC_008564	TTATT	2	10	49362	49371	20 %	80 %	0 %	0 %	117621634
65	NC_008564	ATTAA	2	10	51454	51463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008564	ATTTA	2	10	52430	52439	40 %	60 %	0 %	0 %	117621637
67	NC_008564	GTTTT	2	10	53285	53294	0 %	80 %	20 %	0 %	117621638
68	NC_008564	TAAAA	2	10	53411	53420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008564	TCCTT	2	10	54401	54410	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008564	CTTTT	2	10	54500	54509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008564	TGTCT	2	10	54809	54818	0 %	60 %	20 %	20 %	117621640
72	NC_008564	TTTAG	2	10	55406	55415	20 %	60 %	20 %	0 %	117621640
73	NC_008564	TTTTG	2	10	55562	55571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008564	TTTGA	2	10	56314	56323	20 %	60 %	20 %	0 %	117621641
75	NC_008564	ATTTT	2	10	57078	57087	20 %	80 %	0 %	0 %	117621642
76	NC_008564	AATAA	2	10	57106	57115	80 %	20 %	0 %	0 %	117621642
77	NC_008564	TAAAA	2	10	57655	57664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008564	ATTAA	2	10	57668	57677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008564	ATTAT	2	10	57835	57844	40 %	60 %	0 %	0 %	117621643
80	NC_008564	AAAAT	2	10	58043	58052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008564	AAAAT	2	10	59495	59504	80 %	20 %	0 %	0 %	117621645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.