MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	TAAAT	2	10	2728	2737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	ATTAT	2	10	3849	3858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATTAT	2	10	5432	5441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008564	ATTTT	2	10	11789	11798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008564	TAATA	2	10	11863	11872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	TACTT	2	10	14125	14134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008564	AAATA	2	10	19843	19852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008564	ATTTT	2	10	19908	19917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	ATTTT	2	10	19935	19944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	TAAAT	2	10	20566	20575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	TAATT	2	10	22809	22818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008564	ATTTT	2	10	38684	38693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008564	CTTTA	2	10	38695	38704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008564	TGATT	2	10	42615	42624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008564	AATAA	2	10	47451	47460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008564	ATTAA	2	10	51454	51463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	TAAAA	2	10	53411	53420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008564	TCCTT	2	10	54401	54410	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008564	CTTTT	2	10	54500	54509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008564	TTTTG	2	10	55562	55571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	TAAAA	2	10	57655	57664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008564	ATTAA	2	10	57668	57677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008564	AAAAT	2	10	58043	58052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.