MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	TTAA	2	8	211	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATAA	2	8	482	489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008564	CCAA	2	8	1320	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	117621571
5	NC_008564	AGAA	2	8	1437	1444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	ATTA	2	8	1574	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008564	ATTA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008564	ATTA	2	8	1624	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	ATTA	2	8	1657	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	TTGT	2	8	1715	1722	0 %	75 %	25 %	0 %	117621572
11	NC_008564	AAAC	2	8	2084	2091	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
12	NC_008564	AAAC	2	8	2159	2166	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
13	NC_008564	GTAT	2	8	2501	2508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	ATTA	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008564	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008564	GAAA	2	8	2874	2881	75 %	0 %	25 %	0 %	117621573
17	NC_008564	ATTT	2	8	3373	3380	25 %	75 %	0 %	0 %	117621574
18	NC_008564	AATT	2	8	3746	3753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	TAAT	2	8	3804	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008564	TAAT	2	8	3840	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	TAAT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008564	ACAA	2	8	4000	4007	75 %	0 %	0 %	25 %	117621575
23	NC_008564	TAAT	2	8	5146	5153	50 %	50 %	0 %	0 %	117621576
24	NC_008564	ATTT	2	8	5156	5163	25 %	75 %	0 %	0 %	117621576
25	NC_008564	TAAA	2	8	5778	5785	75 %	25 %	0 %	0 %	117621577
26	NC_008564	TCAA	2	8	6104	6111	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
27	NC_008564	ATCA	2	8	6166	6173	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
28	NC_008564	TAAA	2	8	6767	6774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008564	TACA	2	8	6789	6796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008564	CAAA	2	8	6898	6905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008564	ATAA	2	8	6996	7003	75 %	25 %	0 %	0 %	117621578
32	NC_008564	AGCA	2	8	7354	7361	50 %	0 %	25 %	25 %	117621579
33	NC_008564	TTCA	2	8	7378	7385	25 %	50 %	0 %	25 %	117621579
34	NC_008564	TAAA	2	8	7663	7670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008564	TTTC	2	8	8078	8085	0 %	75 %	0 %	25 %	117621580
36	NC_008564	ACAA	2	8	8274	8281	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
37	NC_008564	GCAA	2	8	8542	8549	50 %	0 %	25 %	25 %	117621581
38	NC_008564	AAAC	2	8	8608	8615	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
39	NC_008564	ACAA	2	8	8960	8967	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
40	NC_008564	CAAT	2	8	9116	9123	50 %	25 %	0 %	25 %	117621582
41	NC_008564	AAAT	2	8	10158	10165	75 %	25 %	0 %	0 %	117621583
42	NC_008564	ATTT	2	8	10487	10494	25 %	75 %	0 %	0 %	117621583
43	NC_008564	TGGT	2	8	10642	10649	0 %	50 %	50 %	0 %	117621583
44	NC_008564	AAAT	2	8	10712	10719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008564	AAAG	2	8	10849	10856	75 %	0 %	25 %	0 %	117621584
46	NC_008564	AAAT	2	8	10921	10928	75 %	25 %	0 %	0 %	117621585
47	NC_008564	ATCA	2	8	11586	11593	50 %	25 %	0 %	25 %	117621586
48	NC_008564	TTAT	2	8	11817	11824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008564	TATT	2	8	11900	11907	25 %	75 %	0 %	0 %	117621587
50	NC_008564	GCAA	2	8	11940	11947	50 %	0 %	25 %	25 %	117621587
51	NC_008564	GTAA	2	8	12014	12021	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
52	NC_008564	AAGT	2	8	12228	12235	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
53	NC_008564	TAAG	2	8	12450	12457	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
54	NC_008564	AAAT	2	8	12707	12714	75 %	25 %	0 %	0 %	117621587
55	NC_008564	GAAG	2	8	13308	13315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621588
56	NC_008564	TGAA	2	8	13894	13901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008564	ATAA	2	8	13906	13913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008564	TAAA	2	8	13981	13988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008564	ACTT	2	8	14054	14061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008564	ATTA	2	8	14152	14159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008564	TAAA	2	8	14354	14361	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
62	NC_008564	GAAA	2	8	14368	14375	75 %	0 %	25 %	0 %	117621589
63	NC_008564	AAAT	2	8	14609	14616	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
64	NC_008564	TAAA	2	8	14726	14733	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
65	NC_008564	ATTT	2	8	15697	15704	25 %	75 %	0 %	0 %	117621590
66	NC_008564	TCAA	2	8	16100	16107	50 %	25 %	0 %	25 %	117621591
67	NC_008564	TAAA	2	8	16650	16657	75 %	25 %	0 %	0 %	117621591
68	NC_008564	TAAA	2	8	16734	16741	75 %	25 %	0 %	0 %	117621591
69	NC_008564	ATAA	2	8	16801	16808	75 %	25 %	0 %	0 %	117621592
70	NC_008564	AAAG	2	8	17131	17138	75 %	0 %	25 %	0 %	117621592
71	NC_008564	CTTT	2	8	17244	17251	0 %	75 %	0 %	25 %	117621592
72	NC_008564	ATTT	2	8	17338	17345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008564	TTAA	2	8	17644	17651	50 %	50 %	0 %	0 %	117621593
74	NC_008564	TAAA	2	8	17873	17880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008564	ATTT	2	8	18136	18143	25 %	75 %	0 %	0 %	117621594
76	NC_008564	GAAA	2	8	18426	18433	75 %	0 %	25 %	0 %	117621594
77	NC_008564	GTTT	2	8	18607	18614	0 %	75 %	25 %	0 %	117621595
78	NC_008564	GTCT	2	8	18939	18946	0 %	50 %	25 %	25 %	117621595
79	NC_008564	ATTT	2	8	19217	19224	25 %	75 %	0 %	0 %	117621596
80	NC_008564	ATAA	2	8	19803	19810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008564	AGCT	2	8	20003	20010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008564	TTTC	2	8	20516	20523	0 %	75 %	0 %	25 %	117621597
83	NC_008564	ATTT	2	8	20533	20540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008564	TTAA	2	8	20621	20628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008564	AAAT	2	8	21285	21292	75 %	25 %	0 %	0 %	117621599
86	NC_008564	CAAT	2	8	21329	21336	50 %	25 %	0 %	25 %	117621599
87	NC_008564	AGAA	2	8	21380	21387	75 %	0 %	25 %	0 %	117621599
88	NC_008564	TTTG	2	8	22398	22405	0 %	75 %	25 %	0 %	117621599
89	NC_008564	TAAA	2	8	22704	22711	75 %	25 %	0 %	0 %	117621600
90	NC_008564	TTTA	2	8	22830	22837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008564	AAAG	2	8	22970	22977	75 %	0 %	25 %	0 %	117621601
92	NC_008564	AGAT	2	8	23729	23736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008564	AAAT	2	8	23769	23776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008564	CTTT	2	8	23918	23925	0 %	75 %	0 %	25 %	117621603
95	NC_008564	TAAA	2	8	24069	24076	75 %	25 %	0 %	0 %	117621603
96	NC_008564	GAAA	2	8	25148	25155	75 %	0 %	25 %	0 %	117621604
97	NC_008564	ATTT	2	8	25434	25441	25 %	75 %	0 %	0 %	117621604
98	NC_008564	ATTA	2	8	25549	25556	50 %	50 %	0 %	0 %	117621604
99	NC_008564	TATG	2	8	25672	25679	25 %	50 %	25 %	0 %	117621604
100	NC_008564	AATA	2	8	25837	25844	75 %	25 %	0 %	0 %	117621604
101	NC_008564	ATTT	2	8	26051	26058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008564	GTTT	2	8	26127	26134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008564	TTAA	2	8	26169	26176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008564	ACAA	2	8	26913	26920	75 %	0 %	0 %	25 %	117621605
105	NC_008564	TAAA	2	8	27407	27414	75 %	25 %	0 %	0 %	117621606
106	NC_008564	GCTT	2	8	27442	27449	0 %	50 %	25 %	25 %	117621606
107	NC_008564	AGCT	2	8	27491	27498	25 %	25 %	25 %	25 %	117621606
108	NC_008564	AAAG	2	8	27739	27746	75 %	0 %	25 %	0 %	117621606
109	NC_008564	TTTC	2	8	27751	27758	0 %	75 %	0 %	25 %	117621606
110	NC_008564	ATTT	2	8	27995	28002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008564	TGAT	2	8	28264	28271	25 %	50 %	25 %	0 %	117621607
112	NC_008564	AATT	2	8	28391	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	117621607
113	NC_008564	TTTC	2	8	28440	28447	0 %	75 %	0 %	25 %	117621607
114	NC_008564	ATTT	2	8	28812	28819	25 %	75 %	0 %	0 %	117621607
115	NC_008564	CAAA	2	8	28978	28985	75 %	0 %	0 %	25 %	117621607
116	NC_008564	TTAA	2	8	29421	29428	50 %	50 %	0 %	0 %	117621607
117	NC_008564	ATAA	2	8	29693	29700	75 %	25 %	0 %	0 %	117621608
118	NC_008564	ATGA	2	8	31706	31713	50 %	25 %	25 %	0 %	117621611
119	NC_008564	TGTT	2	8	31935	31942	0 %	75 %	25 %	0 %	117621611
120	NC_008564	TCTT	2	8	33307	33314	0 %	75 %	0 %	25 %	117621614
121	NC_008564	ATTA	2	8	33549	33556	50 %	50 %	0 %	0 %	117621615
122	NC_008564	CAAG	2	8	34041	34048	50 %	0 %	25 %	25 %	117621615
123	NC_008564	GAAT	2	8	34256	34263	50 %	25 %	25 %	0 %	117621615
124	NC_008564	CAAA	2	8	34391	34398	75 %	0 %	0 %	25 %	117621615
125	NC_008564	CAAT	2	8	34953	34960	50 %	25 %	0 %	25 %	117621616
126	NC_008564	ACAT	3	12	35064	35075	50 %	25 %	0 %	25 %	117621617
127	NC_008564	TATG	2	8	35091	35098	25 %	50 %	25 %	0 %	117621617
128	NC_008564	TAAA	2	8	36149	36156	75 %	25 %	0 %	0 %	117621619
129	NC_008564	TAAA	2	8	36560	36567	75 %	25 %	0 %	0 %	117621619
130	NC_008564	TTTA	2	8	37634	37641	25 %	75 %	0 %	0 %	117621620
131	NC_008564	AGTT	2	8	37653	37660	25 %	50 %	25 %	0 %	117621620
132	NC_008564	ATTA	2	8	37714	37721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008564	AGAA	2	8	38145	38152	75 %	0 %	25 %	0 %	117621621
134	NC_008564	TAAT	2	8	38923	38930	50 %	50 %	0 %	0 %	117621622
135	NC_008564	TTCA	2	8	39215	39222	25 %	50 %	0 %	25 %	117621623
136	NC_008564	TTTA	2	8	39377	39384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008564	ATGA	2	8	39874	39881	50 %	25 %	25 %	0 %	117621624
138	NC_008564	TAAT	2	8	39899	39906	50 %	50 %	0 %	0 %	117621624
139	NC_008564	ATTT	2	8	40020	40027	25 %	75 %	0 %	0 %	117621624
140	NC_008564	ATTT	2	8	40044	40051	25 %	75 %	0 %	0 %	117621624
141	NC_008564	TTTG	2	8	40086	40093	0 %	75 %	25 %	0 %	117621624
142	NC_008564	ATTT	2	8	41317	41324	25 %	75 %	0 %	0 %	117621626
143	NC_008564	TTTA	2	8	41942	41949	25 %	75 %	0 %	0 %	117621626
144	NC_008564	GTTT	2	8	43382	43389	0 %	75 %	25 %	0 %	117621628
145	NC_008564	TTTA	2	8	43405	43412	25 %	75 %	0 %	0 %	117621628
146	NC_008564	TTAT	2	8	44020	44027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.