MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	TTAA	2	8	211	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATAA	2	8	482	489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008564	AGAA	2	8	1437	1444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008564	ATTA	2	8	1574	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	ATTA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008564	ATTA	2	8	1624	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008564	ATTA	2	8	1657	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	GTAT	2	8	2501	2508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	ATTA	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008564	AATT	2	8	3746	3753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008564	TAAT	2	8	3804	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	TAAT	2	8	3840	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008564	TAAT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008564	TAAA	2	8	6767	6774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	TACA	2	8	6789	6796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008564	CAAA	2	8	6898	6905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008564	TAAA	2	8	7663	7670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008564	AAAT	2	8	10712	10719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	TTAT	2	8	11817	11824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008564	TGAA	2	8	13894	13901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008564	ATAA	2	8	13906	13913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008564	TAAA	2	8	13981	13988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008564	ACTT	2	8	14054	14061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008564	ATTA	2	8	14152	14159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008564	ATTT	2	8	17338	17345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008564	TAAA	2	8	17873	17880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008564	ATAA	2	8	19803	19810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	AGCT	2	8	20003	20010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008564	ATTT	2	8	20533	20540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	TTAA	2	8	20621	20628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008564	TTTA	2	8	22830	22837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008564	AGAT	2	8	23729	23736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008564	AAAT	2	8	23769	23776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008564	ATTT	2	8	26051	26058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008564	GTTT	2	8	26127	26134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008564	TTAA	2	8	26169	26176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008564	ATTT	2	8	27995	28002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008564	ATTA	2	8	37714	37721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008564	TTTA	2	8	39377	39384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008564	TTAT	2	8	44020	44027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008564	TAAT	2	8	44918	44925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008564	TATT	2	8	45253	45260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008564	ATTT	2	8	48791	48798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008564	ATTA	2	8	48821	48828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008564	ATTA	2	8	48838	48845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008564	TAAT	2	8	48847	48854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008564	TAAA	2	8	49670	49677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008564	TTTA	2	8	50650	50657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008564	TATT	2	8	51464	51471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008564	TTAT	2	8	51508	51515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008564	TAAA	2	8	55609	55616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008564	GGTT	2	8	56460	56467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008564	ATTT	2	8	56506	56513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008564	TTAT	2	8	57575	57582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008564	ATTT	2	8	57621	57628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.