MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	CT	3	6	608	613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008564	AT	3	6	1152	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	117621571
4	NC_008564	AT	3	6	1369	1374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008564	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	TA	3	6	2793	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	117621573
7	NC_008564	CA	3	6	3278	3283	50 %	0 %	0 %	50 %	117621574
8	NC_008564	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	CA	3	6	5048	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	117621576
10	NC_008564	TA	3	6	5533	5538	50 %	50 %	0 %	0 %	117621577
11	NC_008564	AG	3	6	6060	6065	50 %	0 %	50 %	0 %	117621577
12	NC_008564	AT	3	6	7053	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	117621578
13	NC_008564	AT	3	6	7698	7703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	GA	3	6	8296	8301	50 %	0 %	50 %	0 %	117621581
15	NC_008564	AT	3	6	9147	9152	50 %	50 %	0 %	0 %	117621582
16	NC_008564	AG	3	6	9697	9702	50 %	0 %	50 %	0 %	117621583
17	NC_008564	AT	3	6	9910	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	117621583
18	NC_008564	AC	3	6	10363	10368	50 %	0 %	0 %	50 %	117621583
19	NC_008564	AT	3	6	11016	11021	50 %	50 %	0 %	0 %	117621585
20	NC_008564	AT	3	6	11884	11889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	AC	3	6	14327	14332	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
22	NC_008564	AC	3	6	14420	14425	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
23	NC_008564	TA	4	8	14658	14665	50 %	50 %	0 %	0 %	117621589
24	NC_008564	AT	3	6	14684	14689	50 %	50 %	0 %	0 %	117621589
25	NC_008564	AC	3	6	14794	14799	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
26	NC_008564	AT	3	6	15579	15584	50 %	50 %	0 %	0 %	117621590
27	NC_008564	AT	3	6	15821	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	117621590
28	NC_008564	TA	3	6	16448	16453	50 %	50 %	0 %	0 %	117621591
29	NC_008564	AC	3	6	16575	16580	50 %	0 %	0 %	50 %	117621591
30	NC_008564	GA	4	8	16637	16644	50 %	0 %	50 %	0 %	117621591
31	NC_008564	TG	3	6	17860	17865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	TC	3	6	19249	19254	0 %	50 %	0 %	50 %	117621596
33	NC_008564	AT	3	6	20497	20502	50 %	50 %	0 %	0 %	117621597
34	NC_008564	AT	3	6	20664	20669	50 %	50 %	0 %	0 %	117621598
35	NC_008564	AG	3	6	21122	21127	50 %	0 %	50 %	0 %	117621598
36	NC_008564	GA	3	6	21162	21167	50 %	0 %	50 %	0 %	117621598
37	NC_008564	AT	3	6	22161	22166	50 %	50 %	0 %	0 %	117621599
38	NC_008564	AG	3	6	22262	22267	50 %	0 %	50 %	0 %	117621599
39	NC_008564	CT	3	6	22660	22665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008564	AT	3	6	22907	22912	50 %	50 %	0 %	0 %	117621601
41	NC_008564	TA	3	6	23138	23143	50 %	50 %	0 %	0 %	117621601
42	NC_008564	AT	3	6	23316	23321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008564	GA	4	8	23433	23440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008564	AG	3	6	23606	23611	50 %	0 %	50 %	0 %	117621602
45	NC_008564	AT	3	6	23696	23701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008564	AT	3	6	23809	23814	50 %	50 %	0 %	0 %	117621603
47	NC_008564	TA	3	6	23822	23827	50 %	50 %	0 %	0 %	117621603
48	NC_008564	AG	3	6	24310	24315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621603
49	NC_008564	CT	3	6	25649	25654	0 %	50 %	0 %	50 %	117621604
50	NC_008564	AT	3	6	25746	25751	50 %	50 %	0 %	0 %	117621604
51	NC_008564	AT	3	6	26078	26083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008564	TA	3	6	26331	26336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008564	CT	3	6	27952	27957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008564	AG	3	6	29025	29030	50 %	0 %	50 %	0 %	117621607
55	NC_008564	GA	3	6	31115	31120	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
56	NC_008564	GA	3	6	31359	31364	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
57	NC_008564	AT	3	6	31536	31541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621610
58	NC_008564	GA	3	6	31568	31573	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
59	NC_008564	AG	3	6	33424	33429	50 %	0 %	50 %	0 %	117621614
60	NC_008564	TC	3	6	34208	34213	0 %	50 %	0 %	50 %	117621615
61	NC_008564	AG	3	6	35238	35243	50 %	0 %	50 %	0 %	117621617
62	NC_008564	AG	3	6	36042	36047	50 %	0 %	50 %	0 %	117621619
63	NC_008564	GA	3	6	36604	36609	50 %	0 %	50 %	0 %	117621619
64	NC_008564	TC	3	6	36669	36674	0 %	50 %	0 %	50 %	117621619
65	NC_008564	GA	3	6	39058	39063	50 %	0 %	50 %	0 %	117621623
66	NC_008564	GA	4	8	39197	39204	50 %	0 %	50 %	0 %	117621623
67	NC_008564	AG	3	6	39786	39791	50 %	0 %	50 %	0 %	117621624
68	NC_008564	GT	3	6	40269	40274	0 %	50 %	50 %	0 %	117621624
69	NC_008564	AT	3	6	40500	40505	50 %	50 %	0 %	0 %	117621625
70	NC_008564	AT	3	6	42545	42550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008564	AT	3	6	42555	42560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008564	TA	3	6	42899	42904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008564	AT	3	6	42962	42967	50 %	50 %	0 %	0 %	117621628
74	NC_008564	TA	4	8	43753	43760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008564	TA	3	6	43762	43767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008564	GT	3	6	44073	44078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008564	TA	3	6	44691	44696	50 %	50 %	0 %	0 %	117621629
78	NC_008564	AT	3	6	46303	46308	50 %	50 %	0 %	0 %	117621631
79	NC_008564	CT	3	6	46471	46476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008564	TA	3	6	46594	46599	50 %	50 %	0 %	0 %	117621632
81	NC_008564	AT	3	6	46843	46848	50 %	50 %	0 %	0 %	117621632
82	NC_008564	CT	3	6	47474	47479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008564	TG	3	6	47935	47940	0 %	50 %	50 %	0 %	117621633
84	NC_008564	GT	3	6	48002	48007	0 %	50 %	50 %	0 %	117621633
85	NC_008564	AT	3	6	49005	49010	50 %	50 %	0 %	0 %	117621634
86	NC_008564	TG	3	6	50107	50112	0 %	50 %	50 %	0 %	117621635
87	NC_008564	GT	3	6	51322	51327	0 %	50 %	50 %	0 %	117621636
88	NC_008564	GC	3	6	51359	51364	0 %	0 %	50 %	50 %	117621636
89	NC_008564	GT	3	6	51840	51845	0 %	50 %	50 %	0 %	117621637
90	NC_008564	TG	3	6	51914	51919	0 %	50 %	50 %	0 %	117621637
91	NC_008564	TC	3	6	52454	52459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008564	GT	3	6	53875	53880	0 %	50 %	50 %	0 %	117621639
93	NC_008564	AT	3	6	54172	54177	50 %	50 %	0 %	0 %	117621639
94	NC_008564	GT	3	6	54283	54288	0 %	50 %	50 %	0 %	117621639
95	NC_008564	TA	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	117621640
96	NC_008564	AT	3	6	55778	55783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
97	NC_008564	AT	3	6	56015	56020	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
98	NC_008564	AT	3	6	56049	56054	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
99	NC_008564	GT	3	6	56098	56103	0 %	50 %	50 %	0 %	117621641
100	NC_008564	AC	4	8	56646	56653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008564	TG	4	8	56667	56674	0 %	50 %	50 %	0 %	117621642
102	NC_008564	TA	3	6	57602	57607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008564	AT	3	6	57611	57616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008564	TA	3	6	57996	58001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008564	TA	3	6	58884	58889	50 %	50 %	0 %	0 %	117621644
106	NC_008564	TA	3	6	59595	59600	50 %	50 %	0 %	0 %	117621645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.