MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 1788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	CAGA	2	8	137	144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008563	GGCG	2	8	7954	7961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008563	CTGT	2	8	9107	9114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008563	GAAT	2	8	10553	10560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008563	ATTC	2	8	11944	11951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008563	AGTG	2	8	12086	12093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008563	GACA	2	8	15717	15724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008563	AATC	2	8	15814	15821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008563	TCCC	2	8	30136	30143	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008563	TGGC	2	8	30177	30184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008563	CATG	2	8	31346	31353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008563	TATT	2	8	36695	36702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008563	GGGC	2	8	40473	40480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008563	TGAC	2	8	40496	40503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008563	ATTT	2	8	44572	44579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008563	GTTT	2	8	44589	44596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008563	TGTT	2	8	52283	52290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008563	TCCA	2	8	71877	71884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008563	AAGA	2	8	73054	73061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008563	TTAT	2	8	73096	73103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008563	GGCA	2	8	73319	73326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008563	ATTC	2	8	73467	73474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008563	TTTG	2	8	86026	86033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008563	ATTA	2	8	86501	86508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008563	ATTA	2	8	87834	87841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008563	CCCG	2	8	91577	91584	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_008563	TTAA	2	8	91585	91592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008563	AACA	2	8	91681	91688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008563	CCTG	2	8	92203	92210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008563	GATG	2	8	92311	92318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008563	TTGG	2	8	119871	119878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008563	CCGC	2	8	120023	120030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008563	CTGC	2	8	124140	124147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008563	AATA	2	8	124201	124208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008563	CATT	2	8	127996	128003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008563	TCAA	2	8	128193	128200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008563	GATA	2	8	129208	129215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008563	CGGC	2	8	133816	133823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008563	AAGT	2	8	140907	140914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008563	GGCG	2	8	141540	141547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008563	GCGA	2	8	143122	143129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008563	AATT	2	8	147271	147278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008563	GAAT	2	8	147336	147343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008563	AATT	2	8	162231	162238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008563	TTTG	2	8	163015	163022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008563	CATT	2	8	163040	163047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008563	TTTA	2	8	163195	163202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008563	TTAC	2	8	166792	166799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008563	CTTT	2	8	173255	173262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008563	TGGC	2	8	188261	188268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008563	GGAT	2	8	190011	190018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008563	GACT	2	8	196582	196589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008563	GAAA	2	8	196765	196772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008563	ATAA	2	8	197512	197519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008563	AGTT	2	8	202677	202684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008563	AAGG	2	8	214429	214436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008563	TTCA	2	8	218793	218800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008563	GGCT	2	8	220898	220905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008563	ATCA	2	8	227475	227482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008563	CCGG	2	8	229633	229640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008563	GTAG	2	8	229931	229938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008563	TAAA	2	8	230301	230308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008563	CTGA	2	8	230906	230913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008563	GTAC	2	8	230990	230997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008563	CGTC	2	8	231431	231438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008563	AAAG	2	8	231554	231561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008563	GCTG	2	8	232233	232240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008563	CCTG	2	8	233678	233685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008563	CCGT	2	8	233713	233720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008563	ATTT	2	8	235641	235648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008563	CCTG	2	8	241901	241908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008563	CCGT	2	8	241936	241943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008563	AAGA	2	8	243101	243108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008563	TAAT	2	8	243149	243156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008563	TTAT	2	8	243198	243205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008563	TTAA	2	8	243293	243300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008563	CCTT	2	8	263101	263108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008563	TATG	2	8	263309	263316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008563	TAAA	2	8	263323	263330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008563	TTAA	2	8	263331	263338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008563	AAGT	2	8	263405	263412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008563	TGAT	2	8	263420	263427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008563	TGAA	2	8	264432	264439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008563	GGGC	2	8	270352	270359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008563	AAAC	2	8	270435	270442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008563	AATC	2	8	276750	276757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008563	ATTT	2	8	278466	278473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008563	TTCA	2	8	278566	278573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008563	CAGG	2	8	289354	289361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008563	AGTA	2	8	289376	289383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008563	CGTT	2	8	292512	292519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008563	ATTA	2	8	296031	296038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008563	TAAA	2	8	296148	296155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008563	TAAA	2	8	296158	296165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008563	AAAT	2	8	296166	296173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008563	AAAT	2	8	296856	296863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008563	AATA	2	8	297239	297246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008563	CCTA	2	8	297300	297307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008563	TGGC	2	8	297612	297619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008563	TATC	2	8	297989	297996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008563	CTTA	2	8	298018	298025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008563	TAAT	2	8	298194	298201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008563	CAAA	2	8	299076	299083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008563	TTCT	2	8	300197	300204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008563	ATTT	2	8	303010	303017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008563	TCAA	2	8	307284	307291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008563	TCTT	2	8	308078	308085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008563	ATTT	2	8	313198	313205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008563	TAAT	2	8	313573	313580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008563	GTCA	2	8	313941	313948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008563	TGCT	2	8	314455	314462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008563	CCTT	2	8	314588	314595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008563	CGTG	2	8	314651	314658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008563	CGCA	2	8	314816	314823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008563	GATG	2	8	314841	314848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008563	CAGT	2	8	315874	315881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008563	AACT	2	8	322909	322916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008563	TGAT	2	8	325122	325129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008563	TGAT	2	8	325207	325214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008563	TTAC	2	8	325254	325261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008563	AAAT	2	8	325336	325343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008563	ATAC	2	8	325757	325764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008563	AATG	2	8	332372	332379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008563	TTAA	2	8	332444	332451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008563	ATAA	2	8	332564	332571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008563	TACC	2	8	337080	337087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008563	ATTA	2	8	341722	341729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008563	TAAA	2	8	342764	342771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008563	TAAA	2	8	342795	342802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008563	GAAA	2	8	342981	342988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008563	GCAG	2	8	347039	347046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008563	GTGG	2	8	350330	350337	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008563	TTTG	2	8	351256	351263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008563	TTTA	2	8	351397	351404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008563	TATT	2	8	352187	352194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008563	CATT	2	8	352599	352606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008563	ATTA	2	8	352743	352750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008563	ATTG	2	8	356935	356942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008563	TGTT	2	8	359332	359339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008563	CTAT	2	8	359420	359427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008563	GAGC	2	8	359774	359781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008563	AATG	2	8	369873	369880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008563	GTTA	2	8	376471	376478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008563	CTGA	2	8	377956	377963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008563	GTGG	2	8	377989	377996	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008563	TCAT	2	8	385962	385969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008563	ATTG	2	8	389392	389399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008563	TGAG	2	8	393870	393877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008563	GCGG	2	8	398469	398476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008563	CAGA	2	8	401767	401774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008563	AATT	2	8	401940	401947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_008563	TAAA	2	8	1405620	1405627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_008563	CCAT	2	8	1405787	1405794	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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492	NC_008563	TATG	2	8	1424107	1424114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_008563	ATTC	2	8	1453826	1453833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_008563	GAAG	2	8	1453852	1453859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008563	CTAA	2	8	1453872	1453879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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