MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 72783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	AGC	2	6	46	51	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008563	ACA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008563	CAC	2	6	185	190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008563	ACC	3	9	195	203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008563	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008563	CGG	2	6	334	339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229775982
7	NC_008563	GAT	2	6	463	468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
8	NC_008563	CGC	3	9	550	558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229775982
9	NC_008563	TCG	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229775982
10	NC_008563	TTG	2	6	644	649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229775982
11	NC_008563	CCG	2	6	829	834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229775982
12	NC_008563	TGG	2	6	912	917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229775982
13	NC_008563	ACT	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229775982
14	NC_008563	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229775982
15	NC_008563	TTG	2	6	979	984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229775982
16	NC_008563	GTT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229775982
17	NC_008563	TTC	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229775982
18	NC_008563	TGA	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
19	NC_008563	GGC	2	6	1309	1314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229775982
20	NC_008563	GTG	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229775982
21	NC_008563	ATC	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229775982
22	NC_008563	AAG	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229775982
23	NC_008563	GGT	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229775982
24	NC_008563	TCT	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229775982
25	NC_008563	GAT	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
26	NC_008563	TCA	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229775982
27	NC_008563	GCT	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229775982
28	NC_008563	GAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229775982
29	NC_008563	GAA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229775982
30	NC_008563	ATC	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229775982
31	NC_008563	TTG	2	6	1968	1973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229775982
32	NC_008563	GTT	2	6	2036	2041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229775982
33	NC_008563	TCG	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229775982
34	NC_008563	TAC	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229775982
35	NC_008563	GCG	2	6	2099	2104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229775982
36	NC_008563	TGA	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
37	NC_008563	TGA	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
38	NC_008563	GAT	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
39	NC_008563	TGC	2	6	2427	2432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229775982
40	NC_008563	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229775982
41	NC_008563	CGA	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229775982
42	NC_008563	TGA	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
43	NC_008563	TGA	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229775982
44	NC_008563	TAT	2	6	2666	2671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229775982
45	NC_008563	GCG	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622297
46	NC_008563	GGC	2	6	2897	2902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622297
47	NC_008563	CAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622297
48	NC_008563	GCA	2	6	3187	3192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622297
49	NC_008563	TGG	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622297
50	NC_008563	TGA	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622297
51	NC_008563	GAA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622297
52	NC_008563	CAT	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622297
53	NC_008563	TGA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622297
54	NC_008563	CGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622297
55	NC_008563	TGA	2	6	3454	3459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622297
56	NC_008563	CGG	2	6	3685	3690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622297
57	NC_008563	TGA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622298
58	NC_008563	TGA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622298
59	NC_008563	CGG	2	6	4040	4045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622298
60	NC_008563	GGC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622298
61	NC_008563	TGA	3	9	4304	4312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622298
62	NC_008563	CTA	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622298
63	NC_008563	CGG	2	6	4474	4479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622298
64	NC_008563	CTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622298
65	NC_008563	TGC	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622298
66	NC_008563	ACG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622298
67	NC_008563	AAC	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622298
68	NC_008563	GTT	2	6	4655	4660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622298
69	NC_008563	CCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622298
70	NC_008563	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622298
71	NC_008563	CCG	2	6	4954	4959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622298
72	NC_008563	TGC	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622298
73	NC_008563	TGA	3	9	4981	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622298
74	NC_008563	ATC	2	6	4990	4995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622298
75	NC_008563	GAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008563	AAC	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008563	TGG	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622299
78	NC_008563	ACA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622299
79	NC_008563	CCG	2	6	5430	5435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622299
80	NC_008563	CGC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622299
81	NC_008563	ATC	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622299
82	NC_008563	ATC	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622299
83	NC_008563	CAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622299
84	NC_008563	GCT	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622300
85	NC_008563	GGA	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622300
86	NC_008563	TCA	2	6	5602	5607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622300
87	NC_008563	AAG	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622300
88	NC_008563	AAT	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622300
89	NC_008563	TCA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622300
90	NC_008563	TTC	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622300
91	NC_008563	TTC	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622300
92	NC_008563	CAC	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622300
93	NC_008563	TGC	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622300
94	NC_008563	TTG	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622300
95	NC_008563	TGA	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622300
96	NC_008563	GCT	2	6	6227	6232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622300
97	NC_008563	GTG	2	6	6268	6273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622300
98	NC_008563	CAT	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622301
99	NC_008563	GCC	2	6	6627	6632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622301
100	NC_008563	GTT	2	6	6681	6686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622301
101	NC_008563	AGA	2	6	6698	6703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622301
102	NC_008563	ATC	2	6	6925	6930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622301
103	NC_008563	CGC	2	6	7071	7076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622301
104	NC_008563	GCC	2	6	7077	7082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622301
105	NC_008563	CAG	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622301
106	NC_008563	AAT	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622301
107	NC_008563	AGA	2	6	7547	7552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622301
108	NC_008563	CGG	2	6	7568	7573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622301
109	NC_008563	CAA	2	6	7747	7752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622301
110	NC_008563	TAA	2	6	7802	7807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622301
111	NC_008563	AAG	2	6	7886	7891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008563	CGG	2	6	8018	8023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008563	CGT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008563	ATC	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008563	ACC	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162317588
116	NC_008563	CAG	2	6	8285	8290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317588
117	NC_008563	CAG	2	6	8306	8311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317588
118	NC_008563	TGC	2	6	8527	8532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317588
119	NC_008563	AAG	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162317588
120	NC_008563	CTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317588
121	NC_008563	TTG	2	6	8637	8642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162317588
122	NC_008563	AGA	2	6	8698	8703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162317588
123	NC_008563	TAC	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162317588
124	NC_008563	CTG	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317588
125	NC_008563	GCA	2	6	8953	8958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317588
126	NC_008563	CTG	2	6	9050	9055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317588
127	NC_008563	TGA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622303
128	NC_008563	GCG	2	6	9222	9227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622303
129	NC_008563	GAA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622303
130	NC_008563	ATC	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622303
131	NC_008563	TGG	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622303
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257	NC_008563	ACT	2	6	17191	17196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622310
258	NC_008563	TTA	2	6	17235	17240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622310
259	NC_008563	ATG	2	6	17364	17369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622310
260	NC_008563	GGC	2	6	17391	17396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622310
261	NC_008563	CGG	2	6	17455	17460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622310
262	NC_008563	GTC	2	6	17598	17603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622310
263	NC_008563	TTC	2	6	17637	17642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622310
264	NC_008563	AGC	2	6	17734	17739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622310
265	NC_008563	GTG	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622310
266	NC_008563	GAA	2	6	17865	17870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622310
267	NC_008563	ATT	2	6	18018	18023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622310
268	NC_008563	ATG	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622310
269	NC_008563	GAT	2	6	18228	18233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622310
270	NC_008563	GAT	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622310
271	NC_008563	AAT	2	6	18288	18293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622310
272	NC_008563	ATA	2	6	18484	18489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_008563	TTG	2	6	18625	18630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622311
274	NC_008563	AGA	2	6	18860	18865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622311
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277	NC_008563	TGA	2	6	18945	18950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622311
278	NC_008563	CTT	2	6	18992	18997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622311
279	NC_008563	AGA	2	6	19159	19164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622311
280	NC_008563	GGT	2	6	19177	19182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622311
281	NC_008563	CAT	2	6	19277	19282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622311
282	NC_008563	GCG	2	6	19309	19314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622311
283	NC_008563	TTC	2	6	19389	19394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622311
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290	NC_008563	GTG	2	6	19605	19610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622311
291	NC_008563	AAT	2	6	19619	19624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622311
292	NC_008563	ATT	2	6	19650	19655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622311
293	NC_008563	ATT	2	6	19861	19866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622311
294	NC_008563	AAT	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_008563	TTC	2	6	19882	19887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_008563	TCA	2	6	19928	19933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_008563	GCC	2	6	19934	19939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_008563	GAT	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008563	ATT	2	6	20141	20146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622312
300	NC_008563	ATT	2	6	20150	20155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622312
301	NC_008563	GAT	2	6	20170	20175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622312
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331	NC_008563	TGA	2	6	22490	22495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
332	NC_008563	CAT	2	6	22503	22508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_008563	CTT	2	6	22650	22655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_008563	GCA	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_008563	TTC	2	6	22789	22794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
336	NC_008563	CTT	2	6	22826	22831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_008563	AAG	2	6	22958	22963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622314
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379	NC_008563	GGC	2	6	26442	26447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622315
380	NC_008563	ACG	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622315
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500	NC_008563	GTG	2	6	35366	35371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323

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