MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 8112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	TG	3	6	18	23	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008563	CT	3	6	425	430	0 %	50 %	0 %	50 %	229775982
3	NC_008563	GC	3	6	1313	1318	0 %	0 %	50 %	50 %	229775982
4	NC_008563	TG	3	6	1415	1420	0 %	50 %	50 %	0 %	229775982
5	NC_008563	CG	3	6	2506	2511	0 %	0 %	50 %	50 %	229775982
6	NC_008563	TG	3	6	3586	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	117622297
7	NC_008563	CG	3	6	3942	3947	0 %	0 %	50 %	50 %	117622298
8	NC_008563	GC	3	6	4422	4427	0 %	0 %	50 %	50 %	117622298
9	NC_008563	AG	3	6	4862	4867	50 %	0 %	50 %	0 %	117622298
10	NC_008563	CG	3	6	7421	7426	0 %	0 %	50 %	50 %	117622301
11	NC_008563	CG	3	6	7613	7618	0 %	0 %	50 %	50 %	117622301
12	NC_008563	TA	3	6	7892	7897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008563	TC	3	6	8213	8218	0 %	50 %	0 %	50 %	162317588
14	NC_008563	CG	3	6	8300	8305	0 %	0 %	50 %	50 %	162317588
15	NC_008563	TG	3	6	9345	9350	0 %	50 %	50 %	0 %	117622303
16	NC_008563	AT	3	6	9850	9855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008563	AC	3	6	10898	10903	50 %	0 %	0 %	50 %	117622305
18	NC_008563	AT	3	6	12174	12179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008563	CG	3	6	13591	13596	0 %	0 %	50 %	50 %	117622307
20	NC_008563	CG	3	6	14534	14539	0 %	0 %	50 %	50 %	229775981
21	NC_008563	CT	3	6	15590	15595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008563	CT	3	6	15753	15758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008563	AC	3	6	16023	16028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008563	AT	3	6	17714	17719	50 %	50 %	0 %	0 %	117622310
25	NC_008563	GC	3	6	17922	17927	0 %	0 %	50 %	50 %	117622310
26	NC_008563	CT	3	6	19135	19140	0 %	50 %	0 %	50 %	117622311
27	NC_008563	TC	3	6	19962	19967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008563	GT	3	6	20511	20516	0 %	50 %	50 %	0 %	117622312
29	NC_008563	CT	3	6	20641	20646	0 %	50 %	0 %	50 %	117622312
30	NC_008563	TG	3	6	20691	20696	0 %	50 %	50 %	0 %	117622312
31	NC_008563	GA	3	6	21315	21320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008563	GC	3	6	22555	22560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008563	GT	3	6	22965	22970	0 %	50 %	50 %	0 %	117622314
34	NC_008563	CG	3	6	23011	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	117622314
35	NC_008563	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
36	NC_008563	CG	3	6	25144	25149	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
37	NC_008563	TC	3	6	25289	25294	0 %	50 %	0 %	50 %	117622315
38	NC_008563	CG	3	6	25872	25877	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
39	NC_008563	AT	3	6	27864	27869	50 %	50 %	0 %	0 %	117622318
40	NC_008563	TG	3	6	28214	28219	0 %	50 %	50 %	0 %	117622318
41	NC_008563	GC	3	6	28487	28492	0 %	0 %	50 %	50 %	117622318
42	NC_008563	CG	3	6	29004	29009	0 %	0 %	50 %	50 %	117622319
43	NC_008563	CT	3	6	31815	31820	0 %	50 %	0 %	50 %	117622322
44	NC_008563	CG	3	6	31965	31970	0 %	0 %	50 %	50 %	117622322
45	NC_008563	CA	3	6	32504	32509	50 %	0 %	0 %	50 %	117622322
46	NC_008563	GC	3	6	32778	32783	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
47	NC_008563	CG	3	6	34019	34024	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
48	NC_008563	GC	5	10	34640	34649	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
49	NC_008563	AG	3	6	36225	36230	50 %	0 %	50 %	0 %	117622324
50	NC_008563	TG	3	6	36265	36270	0 %	50 %	50 %	0 %	117622324
51	NC_008563	AG	3	6	36647	36652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008563	AT	3	6	36797	36802	50 %	50 %	0 %	0 %	117622325
53	NC_008563	TG	3	6	36884	36889	0 %	50 %	50 %	0 %	117622325
54	NC_008563	AG	3	6	36964	36969	50 %	0 %	50 %	0 %	117622325
55	NC_008563	CG	3	6	37143	37148	0 %	0 %	50 %	50 %	117622325
56	NC_008563	CT	3	6	37650	37655	0 %	50 %	0 %	50 %	117622326
57	NC_008563	CA	3	6	37718	37723	50 %	0 %	0 %	50 %	117622326
58	NC_008563	TC	3	6	38607	38612	0 %	50 %	0 %	50 %	229775980
59	NC_008563	CG	3	6	41879	41884	0 %	0 %	50 %	50 %	117622330
60	NC_008563	GC	3	6	42218	42223	0 %	0 %	50 %	50 %	117622330
61	NC_008563	CG	3	6	42490	42495	0 %	0 %	50 %	50 %	117622330
62	NC_008563	GC	4	8	43368	43375	0 %	0 %	50 %	50 %	117622331
63	NC_008563	CG	3	6	45250	45255	0 %	0 %	50 %	50 %	117622332
64	NC_008563	CA	3	6	45925	45930	50 %	0 %	0 %	50 %	117622333
65	NC_008563	GC	3	6	47159	47164	0 %	0 %	50 %	50 %	117622334
66	NC_008563	CG	3	6	48328	48333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008563	TC	3	6	49768	49773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008563	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008563	CT	3	6	49961	49966	0 %	50 %	0 %	50 %	117622336
70	NC_008563	TC	3	6	50931	50936	0 %	50 %	0 %	50 %	117622337
71	NC_008563	GA	3	6	52321	52326	50 %	0 %	50 %	0 %	117622338
72	NC_008563	CA	3	6	53022	53027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008563	GC	3	6	53501	53506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008563	CG	4	8	53990	53997	0 %	0 %	50 %	50 %	117622339
75	NC_008563	CG	4	8	54278	54285	0 %	0 %	50 %	50 %	117622339
76	NC_008563	AC	3	6	54762	54767	50 %	0 %	0 %	50 %	117622340
77	NC_008563	GA	3	6	56894	56899	50 %	0 %	50 %	0 %	117622343
78	NC_008563	AT	3	6	58298	58303	50 %	50 %	0 %	0 %	117622344
79	NC_008563	GC	3	6	58752	58757	0 %	0 %	50 %	50 %	117622344
80	NC_008563	GT	3	6	60522	60527	0 %	50 %	50 %	0 %	117622345
81	NC_008563	AT	3	6	60539	60544	50 %	50 %	0 %	0 %	117622345
82	NC_008563	GC	3	6	63414	63419	0 %	0 %	50 %	50 %	117622347
83	NC_008563	CG	3	6	63615	63620	0 %	0 %	50 %	50 %	117622347
84	NC_008563	AG	3	6	64495	64500	50 %	0 %	50 %	0 %	117622347
85	NC_008563	CG	3	6	64569	64574	0 %	0 %	50 %	50 %	117622347
86	NC_008563	CG	4	8	64688	64695	0 %	0 %	50 %	50 %	117622347
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89	NC_008563	TG	3	6	69427	69432	0 %	50 %	50 %	0 %	117622350
90	NC_008563	CG	3	6	69742	69747	0 %	0 %	50 %	50 %	117622350
91	NC_008563	CG	3	6	70481	70486	0 %	0 %	50 %	50 %	117622351
92	NC_008563	GC	3	6	71636	71641	0 %	0 %	50 %	50 %	117622351
93	NC_008563	AG	3	6	71909	71914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008563	GA	3	6	72436	72441	50 %	0 %	50 %	0 %	117622352
95	NC_008563	CG	3	6	72505	72510	0 %	0 %	50 %	50 %	117622352
96	NC_008563	AT	3	6	73102	73107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008563	AT	3	6	73270	73275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008563	TA	3	6	74205	74210	50 %	50 %	0 %	0 %	117622353
99	NC_008563	TA	3	6	74242	74247	50 %	50 %	0 %	0 %	117622353
100	NC_008563	AT	3	6	74429	74434	50 %	50 %	0 %	0 %	117622354
101	NC_008563	AG	3	6	74555	74560	50 %	0 %	50 %	0 %	117622354
102	NC_008563	CA	3	6	76756	76761	50 %	0 %	0 %	50 %	117622357
103	NC_008563	GC	3	6	76799	76804	0 %	0 %	50 %	50 %	117622357
104	NC_008563	CG	3	6	77440	77445	0 %	0 %	50 %	50 %	117622357
105	NC_008563	AG	3	6	77959	77964	50 %	0 %	50 %	0 %	117622357
106	NC_008563	GA	3	6	77972	77977	50 %	0 %	50 %	0 %	117622357
107	NC_008563	TC	3	6	79605	79610	0 %	50 %	0 %	50 %	117622359
108	NC_008563	CG	3	6	80187	80192	0 %	0 %	50 %	50 %	117622359
109	NC_008563	TC	3	6	81408	81413	0 %	50 %	0 %	50 %	117622360
110	NC_008563	GC	3	6	81756	81761	0 %	0 %	50 %	50 %	117622360
111	NC_008563	TG	3	6	81853	81858	0 %	50 %	50 %	0 %	117622360
112	NC_008563	CG	3	6	82220	82225	0 %	0 %	50 %	50 %	117622361
113	NC_008563	CG	3	6	82340	82345	0 %	0 %	50 %	50 %	117622361
114	NC_008563	GC	3	6	83051	83056	0 %	0 %	50 %	50 %	117622361
115	NC_008563	GC	3	6	83154	83159	0 %	0 %	50 %	50 %	117622361
116	NC_008563	AT	3	6	83211	83216	50 %	50 %	0 %	0 %	117622361
117	NC_008563	CA	4	8	83974	83981	50 %	0 %	0 %	50 %	117622362
118	NC_008563	TC	3	6	87654	87659	0 %	50 %	0 %	50 %	117622364
119	NC_008563	CT	3	6	87820	87825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008563	GC	4	8	88236	88243	0 %	0 %	50 %	50 %	117622365
121	NC_008563	GC	3	6	88643	88648	0 %	0 %	50 %	50 %	117622365
122	NC_008563	GC	3	6	89123	89128	0 %	0 %	50 %	50 %	117622365
123	NC_008563	TC	3	6	89605	89610	0 %	50 %	0 %	50 %	117622365
124	NC_008563	GA	3	6	89766	89771	50 %	0 %	50 %	0 %	117622365
125	NC_008563	GC	3	6	90015	90020	0 %	0 %	50 %	50 %	117622366
126	NC_008563	CG	3	6	90246	90251	0 %	0 %	50 %	50 %	117622366
127	NC_008563	GC	3	6	91007	91012	0 %	0 %	50 %	50 %	117622367
128	NC_008563	CG	3	6	91076	91081	0 %	0 %	50 %	50 %	117622367
129	NC_008563	TC	3	6	91487	91492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008563	CA	3	6	91729	91734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008563	AG	3	6	93440	93445	50 %	0 %	50 %	0 %	117622368
132	NC_008563	GC	3	6	94868	94873	0 %	0 %	50 %	50 %	117622370
133	NC_008563	AG	3	6	95065	95070	50 %	0 %	50 %	0 %	117622370
134	NC_008563	GA	3	6	95656	95661	50 %	0 %	50 %	0 %	117622371
135	NC_008563	AT	3	6	95738	95743	50 %	50 %	0 %	0 %	117622371
136	NC_008563	CG	3	6	96587	96592	0 %	0 %	50 %	50 %	117622371
137	NC_008563	GC	3	6	96702	96707	0 %	0 %	50 %	50 %	117622371
138	NC_008563	GC	3	6	97370	97375	0 %	0 %	50 %	50 %	117622372
139	NC_008563	AC	3	6	97452	97457	50 %	0 %	0 %	50 %	117622372
140	NC_008563	CG	3	6	98314	98319	0 %	0 %	50 %	50 %	117622372
141	NC_008563	CG	3	6	99431	99436	0 %	0 %	50 %	50 %	117622373
142	NC_008563	GC	3	6	100630	100635	0 %	0 %	50 %	50 %	117622374
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144	NC_008563	CG	3	6	101798	101803	0 %	0 %	50 %	50 %	117622375
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