MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008555	ATGTTA	2	12	37073	37084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008555	TTTTAT	2	12	67557	67568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008555	ATAGAA	2	12	76026	76037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008555	GAAAAT	2	12	99839	99850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008555	ACATCT	2	12	100274	100285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008555	CAGGTT	2	12	120071	120082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008555	AAACAC	2	12	131669	131680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008555	TTATAT	2	12	154634	154645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008555	ATTCAA	2	12	193872	193883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008555	AAGGAA	2	12	195443	195454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008555	TAGGCG	2	12	197096	197107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008555	ATTCAA	2	12	199895	199906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008555	AAGGAA	2	12	201466	201477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008555	TAGGCG	2	12	203119	203130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008555	TTATAT	2	12	219251	219262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008555	ATATTT	2	12	331005	331016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008555	TCGAGA	2	12	349315	349326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008555	GAAAAT	2	12	377322	377333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008555	TCTCCC	2	12	389613	389624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008555	ATAATT	2	12	405903	405914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008555	AAGTCA	2	12	417751	417762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008555	TAAAAA	2	12	422298	422309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008555	AATAAA	2	12	423447	423458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008555	ATGAGG	2	12	424746	424757	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008555	ATCTAT	2	12	479621	479632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008555	AATGTA	2	12	481477	481488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008555	TAATGA	2	12	505219	505230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008555	GTTTGG	2	12	506791	506802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008555	AGATTT	2	12	532130	532141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008555	TGTCCA	2	12	542725	542736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008555	ATCATT	2	12	608214	608225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008555	AAAATG	2	12	612529	612540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008555	AGTGAA	2	12	640923	640934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008555	ATCATT	2	12	644516	644527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008555	TTTAGT	2	12	672937	672948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008555	GAAAAA	2	12	825390	825401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008555	GAAAAA	2	12	825704	825715	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008555	AGTAAA	2	12	828486	828497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008555	TAAAAA	2	12	855273	855284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008555	GAAAAA	2	12	856813	856824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008555	TGACAA	2	12	870220	870231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008555	AAAAAT	2	12	877677	877688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008555	TGTAAT	2	12	884863	884874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008555	TTACAA	2	12	884882	884893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008555	ATGAAA	2	12	893489	893500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008555	TAGTTC	2	12	896024	896035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008555	AAAAAG	2	12	898404	898415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008555	TTGTAT	2	12	910151	910162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008555	TGTTTT	2	12	917083	917094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008555	TAAAAA	2	12	963603	963614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008555	TAAAAG	2	12	985249	985260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008555	AATGAA	2	12	990129	990140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008555	TTGACT	2	12	1004171	1004182	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008555	AGGAAG	2	12	1014382	1014393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008555	TATTGA	2	12	1101117	1101128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008555	TTAATG	2	12	1101187	1101198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008555	TTTAGT	2	12	1105934	1105945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008555	TAAATA	2	12	1107057	1107068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008555	AGAAAA	2	12	1116144	1116155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008555	CTTTTT	2	12	1145193	1145204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008555	GTTAAT	2	12	1244496	1244507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008555	GTACAA	2	12	1387959	1387970	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008555	GGAAAT	2	12	1409238	1409249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008555	TTAAAA	2	12	1414472	1414483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008555	TCATTA	2	12	1465316	1465327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008555	AAAGCC	2	12	1484127	1484138	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008555	ATTTCT	2	12	1541737	1541748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008555	CTCTTC	2	12	1566532	1566543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008555	AATTAG	2	12	1602852	1602863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008555	ACAAAA	2	12	1631321	1631332	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008555	TAAAAA	2	12	1636600	1636611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008555	CGCCTA	2	12	1721150	1721161	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008555	TTTCCT	2	12	1722802	1722813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008555	TTGAAT	2	12	1724374	1724385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008555	CGCCTA	2	12	1825217	1825228	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008555	TTTCCT	2	12	1826869	1826880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008555	TTGAAT	2	12	1828441	1828452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008555	ATAAAA	2	12	1892265	1892276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008555	CTCTAT	2	12	1938153	1938164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008555	TCATTT	2	12	1939353	1939364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008555	ATTTCT	2	12	1947692	1947703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008555	AGTATA	2	12	1974198	1974209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008555	AAAAGA	2	12	1992062	1992073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008555	AGAAAA	2	12	1998917	1998928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008555	ATTTAA	2	12	2003470	2003481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008555	TCTTTT	2	12	2047311	2047322	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008555	GCTTGG	2	12	2103470	2103481	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008555	AGGAAC	2	12	2142410	2142421	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008555	ATTTTT	2	12	2187152	2187163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008555	AAAATG	2	12	2214683	2214694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008555	AATCAA	2	12	2230519	2230530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008555	AAATTG	2	12	2252107	2252118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008555	TTTTTA	2	12	2330817	2330828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008555	CTTTAA	2	12	2344571	2344582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008555	CATATC	2	12	2352803	2352814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008555	CGCCTA	2	12	2358455	2358466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008555	TTTCCT	2	12	2360360	2360371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008555	TTGAAT	2	12	2361932	2361943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008555	AGATAC	2	12	2424952	2424963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008555	TTGCAA	2	12	2454264	2454275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008555	ATAAAA	2	12	2495335	2495346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008555	ATAAAA	2	12	2500295	2500306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008555	ATTTAA	2	12	2515543	2515554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008555	CTTTAT	2	12	2531423	2531434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008555	TTTTTA	2	12	2534871	2534882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008555	ATGGGA	2	12	2565257	2565268	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008555	CGCCTA	2	12	2580673	2580684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008555	TTTCCT	2	12	2582578	2582589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008555	TTGAAT	2	12	2584150	2584161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008555	GAAAAT	2	12	2589475	2589486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008555	CTTATA	2	12	2589644	2589655	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008555	CCTCTT	2	12	2626584	2626595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008555	TAGCTG	2	12	2628722	2628733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008555	TATTTT	2	12	2631010	2631021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008555	TAAAAA	2	12	2772846	2772857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.