MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 1815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	116871424
2	NC_008555	TCATT	2	10	6861	6870	20 %	60 %	0 %	20 %	116871428
3	NC_008555	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	116871430
4	NC_008555	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	116871431
5	NC_008555	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	116871434
6	NC_008555	ATTAA	2	10	20650	20659	60 %	40 %	0 %	0 %	116871440
7	NC_008555	TGAAA	2	10	21714	21723	60 %	20 %	20 %	0 %	116871440
8	NC_008555	GAAAT	2	10	23817	23826	60 %	20 %	20 %	0 %	116871443
9	NC_008555	ATTAT	2	10	25777	25786	40 %	60 %	0 %	0 %	116871446
10	NC_008555	AAATA	2	10	32483	32492	80 %	20 %	0 %	0 %	116871453
11	NC_008555	ATTTT	2	10	33575	33584	20 %	80 %	0 %	0 %	116871455
12	NC_008555	AAATG	2	10	34704	34713	60 %	20 %	20 %	0 %	116871456
13	NC_008555	GAGTG	2	10	34791	34800	20 %	20 %	60 %	0 %	116871456
14	NC_008555	GTAGA	2	10	35791	35800	40 %	20 %	40 %	0 %	116871457
15	NC_008555	TTACT	2	10	36770	36779	20 %	60 %	0 %	20 %	116871459
16	NC_008555	ACAAA	2	10	37280	37289	80 %	0 %	0 %	20 %	116871460
17	NC_008555	ATGAA	2	10	37429	37438	60 %	20 %	20 %	0 %	116871460
18	NC_008555	TTTTA	2	10	39124	39133	20 %	80 %	0 %	0 %	116871463
19	NC_008555	GTTAA	2	10	39749	39758	40 %	40 %	20 %	0 %	116871463
20	NC_008555	ATGGT	2	10	45323	45332	20 %	40 %	40 %	0 %	116871468
21	NC_008555	ATCAA	2	10	46959	46968	60 %	20 %	0 %	20 %	116871469
22	NC_008555	TAAAT	2	10	48261	48270	60 %	40 %	0 %	0 %	116871470
23	NC_008555	TAATG	2	10	48975	48984	40 %	40 %	20 %	0 %	116871470
24	NC_008555	TTTGC	2	10	50454	50463	0 %	60 %	20 %	20 %	116871471
25	NC_008555	GAAGA	2	10	50558	50567	60 %	0 %	40 %	0 %	116871471
26	NC_008555	AACAA	2	10	52249	52258	80 %	0 %	0 %	20 %	116871473
27	NC_008555	TTAAA	2	10	56277	56286	60 %	40 %	0 %	0 %	116871474
28	NC_008555	GCGAG	2	10	58205	58214	20 %	0 %	60 %	20 %	116871477
29	NC_008555	GCATT	2	10	59778	59787	20 %	40 %	20 %	20 %	116871478
30	NC_008555	TGCAT	2	10	60753	60762	20 %	40 %	20 %	20 %	116871480
31	NC_008555	AAACC	2	10	64874	64883	60 %	0 %	0 %	40 %	116871485
32	NC_008555	ACGCA	2	10	64903	64912	40 %	0 %	20 %	40 %	116871485
33	NC_008555	TACGA	2	10	65766	65775	40 %	20 %	20 %	20 %	116871487
34	NC_008555	ATTTT	2	10	65895	65904	20 %	80 %	0 %	0 %	116871487
35	NC_008555	TGGTT	2	10	67899	67908	0 %	60 %	40 %	0 %	116871489
36	NC_008555	TGAAA	2	10	68924	68933	60 %	20 %	20 %	0 %	116871491
37	NC_008555	TGAAA	2	10	69441	69450	60 %	20 %	20 %	0 %	116871492
38	NC_008555	GAAAA	2	10	71969	71978	80 %	0 %	20 %	0 %	116871495
39	NC_008555	CAATT	2	10	72055	72064	40 %	40 %	0 %	20 %	116871495
40	NC_008555	GAATG	2	10	75375	75384	40 %	20 %	40 %	0 %	116871498
41	NC_008555	TATTT	2	10	77104	77113	20 %	80 %	0 %	0 %	116871499
42	NC_008555	ATATT	2	10	77184	77193	40 %	60 %	0 %	0 %	116871499
43	NC_008555	TAAAT	2	10	77211	77220	60 %	40 %	0 %	0 %	116871499
44	NC_008555	TTTTC	2	10	77917	77926	0 %	80 %	0 %	20 %	116871500
45	NC_008555	TGATT	2	10	78717	78726	20 %	60 %	20 %	0 %	116871501
46	NC_008555	TTACA	2	10	83694	83703	40 %	40 %	0 %	20 %	116871502
47	NC_008555	AAGCA	2	10	85282	85291	60 %	0 %	20 %	20 %	116871502
48	NC_008555	CCAAC	2	10	86996	87005	40 %	0 %	0 %	60 %	116871503
49	NC_008555	TAAGA	2	10	90620	90629	60 %	20 %	20 %	0 %	116871507
50	NC_008555	AAAGC	2	10	92434	92443	60 %	0 %	20 %	20 %	116871509
51	NC_008555	ATGTG	2	10	93021	93030	20 %	40 %	40 %	0 %	116871510
52	NC_008555	TTCGA	2	10	93648	93657	20 %	40 %	20 %	20 %	116871512
53	NC_008555	AATAA	2	10	95256	95265	80 %	20 %	0 %	0 %	116871514
54	NC_008555	CAATA	2	10	97183	97192	60 %	20 %	0 %	20 %	116871515
55	NC_008555	GAAAT	2	10	100894	100903	60 %	20 %	20 %	0 %	116871518
56	NC_008555	GAATT	2	10	101535	101544	40 %	40 %	20 %	0 %	116871518
57	NC_008555	CGCTG	2	10	101713	101722	0 %	20 %	40 %	40 %	116871518
58	NC_008555	AAATT	2	10	106780	106789	60 %	40 %	0 %	0 %	116871522
59	NC_008555	ACTTT	2	10	109165	109174	20 %	60 %	0 %	20 %	116871525
60	NC_008555	TCTCT	2	10	109849	109858	0 %	60 %	0 %	40 %	116871526
61	NC_008555	AATCA	2	10	109902	109911	60 %	20 %	0 %	20 %	116871526
62	NC_008555	TTTTA	2	10	110209	110218	20 %	80 %	0 %	0 %	116871527
63	NC_008555	AAAAG	2	10	110480	110489	80 %	0 %	20 %	0 %	116871528
64	NC_008555	GCGAG	2	10	115474	115483	20 %	0 %	60 %	20 %	116871533
65	NC_008555	TTTTA	2	10	115790	115799	20 %	80 %	0 %	0 %	116871533
66	NC_008555	ATTTT	2	10	115902	115911	20 %	80 %	0 %	0 %	116871534
67	NC_008555	AATTA	2	10	115917	115926	60 %	40 %	0 %	0 %	116871534
68	NC_008555	ATTTA	2	10	116835	116844	40 %	60 %	0 %	0 %	116871534
69	NC_008555	AAAAT	2	10	117405	117414	80 %	20 %	0 %	0 %	116871534
70	NC_008555	AACTT	2	10	118726	118735	40 %	40 %	0 %	20 %	116871537
71	NC_008555	ACAAA	2	10	118828	118837	80 %	0 %	0 %	20 %	116871537
72	NC_008555	TTGGT	2	10	120418	120427	0 %	60 %	40 %	0 %	116871538
73	NC_008555	TATGA	2	10	123389	123398	40 %	40 %	20 %	0 %	116871542
74	NC_008555	ATAAA	2	10	125308	125317	80 %	20 %	0 %	0 %	116871545
75	NC_008555	AATTA	2	10	126152	126161	60 %	40 %	0 %	0 %	116871547
76	NC_008555	ACGGC	2	10	127901	127910	20 %	0 %	40 %	40 %	116871548
77	NC_008555	TTTAA	2	10	127973	127982	40 %	60 %	0 %	0 %	116871548
78	NC_008555	AATTT	2	10	128159	128168	40 %	60 %	0 %	0 %	116871548
79	NC_008555	TGGAC	2	10	133048	133057	20 %	20 %	40 %	20 %	116871553
80	NC_008555	AGATG	2	10	135541	135550	40 %	20 %	40 %	0 %	116871555
81	NC_008555	CAAAA	2	10	137705	137714	80 %	0 %	0 %	20 %	116871557
82	NC_008555	GTAGA	2	10	139709	139718	40 %	20 %	40 %	0 %	116871558
83	NC_008555	TGAAA	2	10	139728	139737	60 %	20 %	20 %	0 %	116871559
84	NC_008555	ATAAA	2	10	140547	140556	80 %	20 %	0 %	0 %	116871559
85	NC_008555	AATCA	2	10	143450	143459	60 %	20 %	0 %	20 %	116871561
86	NC_008555	TCTTT	2	10	143473	143482	0 %	80 %	0 %	20 %	116871561
87	NC_008555	CGCAC	2	10	144754	144763	20 %	0 %	20 %	60 %	116871563
88	NC_008555	GGAAT	2	10	144946	144955	40 %	20 %	40 %	0 %	116871563
89	NC_008555	AAGAT	2	10	145367	145376	60 %	20 %	20 %	0 %	116871563
90	NC_008555	GAATT	2	10	145738	145747	40 %	40 %	20 %	0 %	116871564
91	NC_008555	ATCGC	2	10	147341	147350	20 %	20 %	20 %	40 %	116871566
92	NC_008555	AAATA	2	10	148793	148802	80 %	20 %	0 %	0 %	116871568
93	NC_008555	CAAAC	2	10	148970	148979	60 %	0 %	0 %	40 %	116871569
94	NC_008555	ACAAA	2	10	149851	149860	80 %	0 %	0 %	20 %	116871570
95	NC_008555	AAGAA	2	10	152445	152454	80 %	0 %	20 %	0 %	116871572
96	NC_008555	ATGAA	2	10	154204	154213	60 %	20 %	20 %	0 %	116871573
97	NC_008555	GAAAT	2	10	155470	155479	60 %	20 %	20 %	0 %	116871574
98	NC_008555	CAAAT	2	10	156493	156502	60 %	20 %	0 %	20 %	116871575
99	NC_008555	TAATT	2	10	159335	159344	40 %	60 %	0 %	0 %	116871579
100	NC_008555	CTGGA	2	10	160192	160201	20 %	20 %	40 %	20 %	116871580
101	NC_008555	TTGAT	2	10	161754	161763	20 %	60 %	20 %	0 %	116871581
102	NC_008555	AAAGT	2	10	167318	167327	60 %	20 %	20 %	0 %	116871587
103	NC_008555	CATTT	2	10	167455	167464	20 %	60 %	0 %	20 %	116871587
104	NC_008555	AAAAT	2	10	173406	173415	80 %	20 %	0 %	0 %	116871594
105	NC_008555	ATGGT	2	10	173668	173677	20 %	40 %	40 %	0 %	116871595
106	NC_008555	TAGAA	2	10	174793	174802	60 %	20 %	20 %	0 %	116871596
107	NC_008555	AGAAA	2	10	174946	174955	80 %	0 %	20 %	0 %	116871596
108	NC_008555	ATATT	2	10	177319	177328	40 %	60 %	0 %	0 %	116871596
109	NC_008555	AACAA	2	10	177519	177528	80 %	0 %	0 %	20 %	116871596
110	NC_008555	GATTC	2	10	179557	179566	20 %	40 %	20 %	20 %	116871598
111	NC_008555	ATCAA	2	10	180169	180178	60 %	20 %	0 %	20 %	116871600
112	NC_008555	ATCCG	2	10	181034	181043	20 %	20 %	20 %	40 %	116871602
113	NC_008555	GCAAA	2	10	182739	182748	60 %	0 %	20 %	20 %	116871602
114	NC_008555	AAACA	2	10	183639	183648	80 %	0 %	0 %	20 %	116871603
115	NC_008555	AAAGC	2	10	183766	183775	60 %	0 %	20 %	20 %	116871603
116	NC_008555	ACTGT	2	10	185497	185506	20 %	40 %	20 %	20 %	116871604
117	NC_008555	TGATA	2	10	189405	189414	40 %	40 %	20 %	0 %	116871608
118	NC_008555	AAGTG	2	10	190747	190756	40 %	20 %	40 %	0 %	116871610
119	NC_008555	TACTT	2	10	192356	192365	20 %	60 %	0 %	20 %	116871612
120	NC_008555	ATTCC	2	10	209142	209151	20 %	40 %	0 %	40 %	116871616
121	NC_008555	ATTAA	2	10	212855	212864	60 %	40 %	0 %	0 %	116871619
122	NC_008555	ACGTA	2	10	213093	213102	40 %	20 %	20 %	20 %	116871620
123	NC_008555	GGCTT	2	10	213253	213262	0 %	40 %	40 %	20 %	116871620
124	NC_008555	AAAAG	2	10	215413	215422	80 %	0 %	20 %	0 %	116871621
125	NC_008555	CAAAA	2	10	220566	220575	80 %	0 %	0 %	20 %	116871630
126	NC_008555	GGAAT	2	10	220627	220636	40 %	20 %	40 %	0 %	116871630
127	NC_008555	TCACT	2	10	223926	223935	20 %	40 %	0 %	40 %	116871636
128	NC_008555	TTCAC	2	10	224728	224737	20 %	40 %	0 %	40 %	116871636
129	NC_008555	TGTAG	2	10	224840	224849	20 %	40 %	40 %	0 %	116871636
130	NC_008555	AAAGA	2	10	224888	224897	80 %	0 %	20 %	0 %	116871636
131	NC_008555	GAAAA	2	10	226866	226875	80 %	0 %	20 %	0 %	116871639
132	NC_008555	GAATT	2	10	228751	228760	40 %	40 %	20 %	0 %	116871641
133	NC_008555	ATTGG	2	10	230413	230422	20 %	40 %	40 %	0 %	116871642
134	NC_008555	GATAC	2	10	232809	232818	40 %	20 %	20 %	20 %	116871644
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