MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 37504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871423
2	NC_008555	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
3	NC_008555	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
4	NC_008555	AGA	2	6	481	486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
5	NC_008555	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
6	NC_008555	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871423
7	NC_008555	CGG	2	6	764	769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871423
8	NC_008555	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
9	NC_008555	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
10	NC_008555	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
11	NC_008555	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
12	NC_008555	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
13	NC_008555	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
14	NC_008555	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
15	NC_008555	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871423
16	NC_008555	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871423
17	NC_008555	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
18	NC_008555	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
19	NC_008555	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
20	NC_008555	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871423
21	NC_008555	ACC	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871423
22	NC_008555	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871423
23	NC_008555	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871424
24	NC_008555	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
25	NC_008555	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
26	NC_008555	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871424
27	NC_008555	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871424
28	NC_008555	AAC	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871424
29	NC_008555	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
30	NC_008555	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
31	NC_008555	GAT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
32	NC_008555	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
33	NC_008555	TTA	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
34	NC_008555	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871424
35	NC_008555	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871424
36	NC_008555	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
37	NC_008555	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
38	NC_008555	ATG	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
39	NC_008555	ACA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871425
40	NC_008555	CAA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871425
41	NC_008555	CAG	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
42	NC_008555	GAT	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
43	NC_008555	TTG	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
44	NC_008555	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
45	NC_008555	GTA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
46	NC_008555	GGT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871425
47	NC_008555	ATT	2	6	3429	3434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
48	NC_008555	GAT	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
49	NC_008555	ACT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871425
50	NC_008555	GCA	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
51	NC_008555	GTT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
52	NC_008555	GCG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871425
53	NC_008555	AGT	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
54	NC_008555	TAT	3	9	4135	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
55	NC_008555	TTA	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
56	NC_008555	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
57	NC_008555	TGG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871425
58	NC_008555	CGA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
59	NC_008555	TAT	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871426
60	NC_008555	TAT	2	6	5047	5052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871427
61	NC_008555	AGA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
62	NC_008555	AGT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
63	NC_008555	AGA	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
64	NC_008555	ACA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871427
65	NC_008555	TCA	2	6	5497	5502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871427
66	NC_008555	GTG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871427
67	NC_008555	TTG	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871427
68	NC_008555	GAT	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
69	NC_008555	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
70	NC_008555	CTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871427
71	NC_008555	GAT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
72	NC_008555	GAT	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
73	NC_008555	ACA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871427
74	NC_008555	AGA	2	6	6034	6039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
75	NC_008555	TCA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871428
76	NC_008555	TGA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
77	NC_008555	ATA	2	6	6255	6260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871428
78	NC_008555	GTC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
79	NC_008555	TGG	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
80	NC_008555	GGC	3	9	6371	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871428
81	NC_008555	AGT	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
82	NC_008555	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
83	NC_008555	ACA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
84	NC_008555	GAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
85	NC_008555	CCA	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871428
86	NC_008555	GAT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
87	NC_008555	ACA	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
88	NC_008555	AAT	2	6	6875	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871428
89	NC_008555	TTA	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
90	NC_008555	CGT	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
91	NC_008555	TGA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
92	NC_008555	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
93	NC_008555	ATG	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
94	NC_008555	GTG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
95	NC_008555	GCT	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
96	NC_008555	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871428
97	NC_008555	TGG	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
98	NC_008555	GAA	2	6	7457	7462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
99	NC_008555	TGG	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
100	NC_008555	TTA	2	6	7539	7544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
101	NC_008555	CTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871428
102	NC_008555	ACC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871428
103	NC_008555	AGA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
104	NC_008555	AAC	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
105	NC_008555	ACA	2	6	7811	7816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
106	NC_008555	ACT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871428
107	NC_008555	TGA	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
108	NC_008555	TCG	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
109	NC_008555	GAA	2	6	7931	7936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
110	NC_008555	TAA	2	6	7967	7972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871428
111	NC_008555	TTG	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871429
112	NC_008555	TCG	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871429
113	NC_008555	TTG	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871429
114	NC_008555	ACC	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871429
115	NC_008555	TAG	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871429
116	NC_008555	GGC	2	6	8414	8419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871429
117	NC_008555	ACT	2	6	8465	8470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871429
118	NC_008555	ATG	2	6	8512	8517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871429
119	NC_008555	TCA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871429
120	NC_008555	TCA	2	6	8618	8623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871429
121	NC_008555	CTG	2	6	8722	8727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871429
122	NC_008555	GAA	2	6	8811	8816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871429
123	NC_008555	TTA	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871429
124	NC_008555	TAG	2	6	8881	8886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871429
125	NC_008555	ATG	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871429
126	NC_008555	TCG	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871429
127	NC_008555	AAT	2	6	9015	9020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871429
128	NC_008555	ATC	2	6	9082	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871429
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130	NC_008555	AGT	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871429
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