MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 2791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008554	CGAAG	2	10	510	519	40 %	0 %	40 %	20 %	116747453
2	NC_008554	GATCG	2	10	2110	2119	20 %	20 %	40 %	20 %	116747454
3	NC_008554	AGGCA	2	10	7838	7847	40 %	0 %	40 %	20 %	116747459
4	NC_008554	ATTTC	2	10	9867	9876	20 %	60 %	0 %	20 %	116747460
5	NC_008554	GAATG	2	10	10048	10057	40 %	20 %	40 %	0 %	116747460
6	NC_008554	TCCGA	2	10	10885	10894	20 %	20 %	20 %	40 %	116747460
7	NC_008554	GGAAA	2	10	11485	11494	60 %	0 %	40 %	0 %	116747460
8	NC_008554	CCGAA	2	10	17379	17388	40 %	0 %	20 %	40 %	116747463
9	NC_008554	GCGCA	2	10	21553	21562	20 %	0 %	40 %	40 %	116747464
10	NC_008554	CCGTG	2	10	23983	23992	0 %	20 %	40 %	40 %	116747465
11	NC_008554	CAGGA	2	10	25224	25233	40 %	0 %	40 %	20 %	116747465
12	NC_008554	GTTCC	2	10	25744	25753	0 %	40 %	20 %	40 %	116747465
13	NC_008554	GTCCC	2	10	26049	26058	0 %	20 %	20 %	60 %	116747465
14	NC_008554	GCGCC	2	10	27572	27581	0 %	0 %	40 %	60 %	116747467
15	NC_008554	CCGGT	2	10	33287	33296	0 %	20 %	40 %	40 %	116747471
16	NC_008554	ATGGT	2	10	33680	33689	20 %	40 %	40 %	0 %	116747471
17	NC_008554	CCGAT	2	10	37949	37958	20 %	20 %	20 %	40 %	116747475
18	NC_008554	CACTG	2	10	38012	38021	20 %	20 %	20 %	40 %	116747475
19	NC_008554	GGTGC	2	10	39131	39140	0 %	20 %	60 %	20 %	116747478
20	NC_008554	GGGCA	2	10	39641	39650	20 %	0 %	60 %	20 %	116747478
21	NC_008554	CTTCG	2	10	41166	41175	0 %	40 %	20 %	40 %	116747480
22	NC_008554	AAGGG	2	10	42267	42276	40 %	0 %	60 %	0 %	116747481
23	NC_008554	TGGAC	2	10	44551	44560	20 %	20 %	40 %	20 %	116747482
24	NC_008554	TCGGT	2	10	47161	47170	0 %	40 %	40 %	20 %	116747483
25	NC_008554	CTGGA	2	10	50742	50751	20 %	20 %	40 %	20 %	116747487
26	NC_008554	AGAGA	2	10	53658	53667	60 %	0 %	40 %	0 %	116747489
27	NC_008554	GCACC	2	10	54600	54609	20 %	0 %	20 %	60 %	116747490
28	NC_008554	CGACG	2	10	56058	56067	20 %	0 %	40 %	40 %	116747492
29	NC_008554	GTGAG	2	10	56463	56472	20 %	20 %	60 %	0 %	116747492
30	NC_008554	GCGGA	2	10	57216	57225	20 %	0 %	60 %	20 %	116747494
31	NC_008554	CGAGG	2	10	59161	59170	20 %	0 %	60 %	20 %	116747494
32	NC_008554	CTTCC	2	10	60424	60433	0 %	40 %	0 %	60 %	116747496
33	NC_008554	CGGGA	2	10	61308	61317	20 %	0 %	60 %	20 %	116747497
34	NC_008554	CGGCC	2	10	63118	63127	0 %	0 %	40 %	60 %	116747498
35	NC_008554	CGGAA	2	10	64946	64955	40 %	0 %	40 %	20 %	116747500
36	NC_008554	AGTCC	2	10	66489	66498	20 %	20 %	20 %	40 %	116747501
37	NC_008554	GGGGT	2	10	68070	68079	0 %	20 %	80 %	0 %	116747504
38	NC_008554	ACGAT	2	10	68096	68105	40 %	20 %	20 %	20 %	116747504
39	NC_008554	GGAAT	2	10	68916	68925	40 %	20 %	40 %	0 %	116747505
40	NC_008554	CGTCT	2	10	71835	71844	0 %	40 %	20 %	40 %	116747508
41	NC_008554	CAGGC	2	10	72349	72358	20 %	0 %	40 %	40 %	116747508
42	NC_008554	CAGGT	2	10	73760	73769	20 %	20 %	40 %	20 %	116747509
43	NC_008554	GTGGC	2	10	73820	73829	0 %	20 %	60 %	20 %	116747509
44	NC_008554	GAATC	2	10	75593	75602	40 %	20 %	20 %	20 %	116747511
45	NC_008554	TCCAT	2	10	76012	76021	20 %	40 %	0 %	40 %	116747511
46	NC_008554	TTCCG	2	10	80201	80210	0 %	40 %	20 %	40 %	116747515
47	NC_008554	AAGCC	2	10	86469	86478	40 %	0 %	20 %	40 %	116747519
48	NC_008554	TCGGC	2	10	87300	87309	0 %	20 %	40 %	40 %	116747520
49	NC_008554	CGGTC	2	10	87409	87418	0 %	20 %	40 %	40 %	116747520
50	NC_008554	AGGTG	2	10	87777	87786	20 %	20 %	60 %	0 %	116747520
51	NC_008554	CATGC	2	10	88403	88412	20 %	20 %	20 %	40 %	116747521
52	NC_008554	ATCGA	2	10	88955	88964	40 %	20 %	20 %	20 %	116747522
53	NC_008554	CATTG	2	10	89012	89021	20 %	40 %	20 %	20 %	116747522
54	NC_008554	ACCAC	2	10	89568	89577	40 %	0 %	0 %	60 %	116747523
55	NC_008554	AGGCG	2	10	91233	91242	20 %	0 %	60 %	20 %	116747525
56	NC_008554	GGAGC	2	10	94667	94676	20 %	0 %	60 %	20 %	116747527
57	NC_008554	TTCCG	2	10	94707	94716	0 %	40 %	20 %	40 %	116747527
58	NC_008554	ACGGA	2	10	95773	95782	40 %	0 %	40 %	20 %	116747529
59	NC_008554	AGACC	2	10	100023	100032	40 %	0 %	20 %	40 %	116747532
60	NC_008554	CGGGG	2	10	105289	105298	0 %	0 %	80 %	20 %	116747537
61	NC_008554	CTGTC	2	10	108154	108163	0 %	40 %	20 %	40 %	116747539
62	NC_008554	CCGAG	2	10	108458	108467	20 %	0 %	40 %	40 %	116747539
63	NC_008554	TACGA	2	10	111314	111323	40 %	20 %	20 %	20 %	116747541
64	NC_008554	ATTCA	2	10	115943	115952	40 %	40 %	0 %	20 %	116747546
65	NC_008554	TGGAT	2	10	116447	116456	20 %	40 %	40 %	0 %	116747547
66	NC_008554	TCGGA	2	10	116575	116584	20 %	20 %	40 %	20 %	116747547
67	NC_008554	ATCGC	2	10	116947	116956	20 %	20 %	20 %	40 %	116747548
68	NC_008554	CCGTC	2	10	120206	120215	0 %	20 %	20 %	60 %	116747549
69	NC_008554	CGGAC	2	10	126709	126718	20 %	0 %	40 %	40 %	116747555
70	NC_008554	ACTCA	2	10	127536	127545	40 %	20 %	0 %	40 %	116747555
71	NC_008554	GTCCG	2	10	135070	135079	0 %	20 %	40 %	40 %	116747561
72	NC_008554	ACCCG	2	10	135107	135116	20 %	0 %	20 %	60 %	116747561
73	NC_008554	GATTC	2	10	135522	135531	20 %	40 %	20 %	20 %	116747562
74	NC_008554	TACGG	2	10	136278	136287	20 %	20 %	40 %	20 %	116747563
75	NC_008554	GGGCA	2	10	138465	138474	20 %	0 %	60 %	20 %	116747565
76	NC_008554	CTCCG	2	10	141015	141024	0 %	20 %	20 %	60 %	116747567
77	NC_008554	GGGAC	2	10	149967	149976	20 %	0 %	60 %	20 %	116747573
78	NC_008554	GAACG	2	10	150124	150133	40 %	0 %	40 %	20 %	116747573
79	NC_008554	GATTG	2	10	151174	151183	20 %	40 %	40 %	0 %	116747573
80	NC_008554	AAACC	2	10	154510	154519	60 %	0 %	0 %	40 %	116747576
81	NC_008554	AGCCC	2	10	155792	155801	20 %	0 %	20 %	60 %	116747577
82	NC_008554	GCCAG	2	10	156977	156986	20 %	0 %	40 %	40 %	116747578
83	NC_008554	CAAGG	2	10	159207	159216	40 %	0 %	40 %	20 %	116747579
84	NC_008554	CGTTT	2	10	159562	159571	0 %	60 %	20 %	20 %	116747580
85	NC_008554	GCCGG	2	10	161044	161053	0 %	0 %	60 %	40 %	116747581
86	NC_008554	GGGAT	2	10	161064	161073	20 %	20 %	60 %	0 %	116747581
87	NC_008554	ATTGC	2	10	162417	162426	20 %	40 %	20 %	20 %	116747582
88	NC_008554	GTTCC	2	10	165789	165798	0 %	40 %	20 %	40 %	116747584
89	NC_008554	ACGTT	2	10	168236	168245	20 %	40 %	20 %	20 %	116747587
90	NC_008554	CGTGC	2	10	169184	169193	0 %	20 %	40 %	40 %	116747587
91	NC_008554	GCGCG	2	10	170106	170115	0 %	0 %	60 %	40 %	116747588
92	NC_008554	GATCC	2	10	170749	170758	20 %	20 %	20 %	40 %	116747589
93	NC_008554	GCACG	2	10	172684	172693	20 %	0 %	40 %	40 %	116747591
94	NC_008554	GCCTC	2	10	174294	174303	0 %	20 %	20 %	60 %	116747593
95	NC_008554	AATAC	2	10	175076	175085	60 %	20 %	0 %	20 %	116747594
96	NC_008554	CTCAT	2	10	175791	175800	20 %	40 %	0 %	40 %	116747594
97	NC_008554	CGGTC	2	10	176778	176787	0 %	20 %	40 %	40 %	116747594
98	NC_008554	GAGGT	2	10	178941	178950	20 %	20 %	60 %	0 %	116747596
99	NC_008554	GAGAT	2	10	179322	179331	40 %	20 %	40 %	0 %	116747596
100	NC_008554	ATTAA	2	10	179972	179981	60 %	40 %	0 %	0 %	116747597
101	NC_008554	GTTCT	2	10	181476	181485	0 %	60 %	20 %	20 %	116747599
102	NC_008554	CAGGG	2	10	182929	182938	20 %	0 %	60 %	20 %	116747600
103	NC_008554	ATGCC	2	10	184794	184803	20 %	20 %	20 %	40 %	116747601
104	NC_008554	GGGAG	2	10	185029	185038	20 %	0 %	80 %	0 %	116747602
105	NC_008554	CATGC	2	10	185730	185739	20 %	20 %	20 %	40 %	116747602
106	NC_008554	GCGCA	2	10	187161	187170	20 %	0 %	40 %	40 %	116747604
107	NC_008554	CTTGG	2	10	189526	189535	0 %	40 %	40 %	20 %	116747605
108	NC_008554	CCGCT	2	10	190281	190290	0 %	20 %	20 %	60 %	116747606
109	NC_008554	GAACA	2	10	191722	191731	60 %	0 %	20 %	20 %	116747607
110	NC_008554	ACCGG	2	10	192213	192222	20 %	0 %	40 %	40 %	116747608
111	NC_008554	AGGAA	2	10	193798	193807	60 %	0 %	40 %	0 %	116747610
112	NC_008554	GAACA	2	10	194152	194161	60 %	0 %	20 %	20 %	116747610
113	NC_008554	TCGTC	2	10	200264	200273	0 %	40 %	20 %	40 %	116747616
114	NC_008554	GCGTT	2	10	200391	200400	0 %	40 %	40 %	20 %	116747616
115	NC_008554	CACTC	2	10	200603	200612	20 %	20 %	0 %	60 %	116747616
116	NC_008554	CCGAC	2	10	201593	201602	20 %	0 %	20 %	60 %	116747617
117	NC_008554	GCTCC	2	10	202062	202071	0 %	20 %	20 %	60 %	116747617
118	NC_008554	CGTCC	2	10	202295	202304	0 %	20 %	20 %	60 %	116747617
119	NC_008554	CGGGC	2	10	202632	202641	0 %	0 %	60 %	40 %	116747618
120	NC_008554	TGCGG	2	10	203594	203603	0 %	20 %	60 %	20 %	116747619
121	NC_008554	ACCTG	2	10	203686	203695	20 %	20 %	20 %	40 %	116747619
122	NC_008554	CCGAA	2	10	204109	204118	40 %	0 %	20 %	40 %	116747619
123	NC_008554	GTATC	2	10	210400	210409	20 %	40 %	20 %	20 %	116747624
124	NC_008554	GGTCA	2	10	211865	211874	20 %	20 %	40 %	20 %	116747625
125	NC_008554	AGGTC	2	10	212957	212966	20 %	20 %	40 %	20 %	116747627
126	NC_008554	AAAGC	2	10	216633	216642	60 %	0 %	20 %	20 %	116747629
127	NC_008554	GGAAT	2	10	218640	218649	40 %	20 %	40 %	0 %	116747633
128	NC_008554	CCTGC	2	10	225007	225016	0 %	20 %	20 %	60 %	116747639
129	NC_008554	GATCC	2	10	225623	225632	20 %	20 %	20 %	40 %	116747640
130	NC_008554	TCAGG	2	10	225940	225949	20 %	20 %	40 %	20 %	116747640
131	NC_008554	GCCGC	2	10	227067	227076	0 %	0 %	40 %	60 %	116747641
132	NC_008554	GACGC	2	10	227821	227830	20 %	0 %	40 %	40 %	116747642
133	NC_008554	CCGGA	2	10	228894	228903	20 %	0 %	40 %	40 %	116747642
134	NC_008554	ACGGA	2	10	229123	229132	40 %	0 %	40 %	20 %	116747642
135	NC_008554	ACGGG	2	10	230266	230275	20 %	0 %	60 %	20 %	116747643
136	NC_008554	GGCCT	2	10	231111	231120	0 %	20 %	40 %	40 %	116747644
137	NC_008554	GGTGA	2	10	233110	233119	20 %	20 %	60 %	0 %	116747647
138	NC_008554	ACCGG	2	10	235563	235572	20 %	0 %	40 %	40 %	116747650
139	NC_008554	TCTGG	2	10	237225	237234	0 %	40 %	40 %	20 %	116747652
140	NC_008554	GCCCA	2	10	238394	238403	20 %	0 %	20 %	60 %	116747653
141	NC_008554	GTTCT	2	10	239175	239184	0 %	60 %	20 %	20 %	116747655
142	NC_008554	CGTTC	2	10	239692	239701	0 %	40 %	20 %	40 %	116747656
143	NC_008554	TCACC	2	10	240466	240475	20 %	20 %	0 %	60 %	116747656
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145	NC_008554	GCTTG	2	10	244073	244082	0 %	40 %	40 %	20 %	116747658
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148	NC_008554	GCGCG	2	10	253283	253292	0 %	0 %	60 %	40 %	116747665
149	NC_008554	AGGGC	2	10	253610	253619	20 %	0 %	60 %	20 %	116747665
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155	NC_008554	CTCGC	2	10	259297	259306	0 %	20 %	20 %	60 %	116747668
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163	NC_008554	GCATT	2	10	270671	270680	20 %	40 %	20 %	20 %	116747679
164	NC_008554	CCGTG	2	10	274361	274370	0 %	20 %	40 %	40 %	116747681
165	NC_008554	GTGCA	2	10	274838	274847	20 %	20 %	40 %	20 %	116747682
166	NC_008554	GGTGT	2	10	277824	277833	0 %	40 %	60 %	0 %	116747686
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169	NC_008554	GGATC	2	10	282121	282130	20 %	20 %	40 %	20 %	116747690
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249	NC_008554	CCCGC	2	10	407104	407113	0 %	0 %	20 %	80 %	116747792
250	NC_008554	ATTTC	2	10	407275	407284	20 %	60 %	0 %	20 %	116747792
251	NC_008554	TTCGA	2	10	408092	408101	20 %	40 %	20 %	20 %	116747793
252	NC_008554	TGTGC	2	10	409600	409609	0 %	40 %	40 %	20 %	116747794
253	NC_008554	TACGA	2	10	411637	411646	40 %	20 %	20 %	20 %	116747795
254	NC_008554	GTCCG	2	10	415503	415512	0 %	20 %	40 %	40 %	116747801
255	NC_008554	GCAAC	2	10	417903	417912	40 %	0 %	20 %	40 %	116747803
256	NC_008554	GCAGG	2	10	422249	422258	20 %	0 %	60 %	20 %	116747805
257	NC_008554	GCCGC	2	10	426893	426902	0 %	0 %	40 %	60 %	116747807
258	NC_008554	CCGTC	2	10	428854	428863	0 %	20 %	20 %	60 %	116747809
259	NC_008554	CCGTG	2	10	429102	429111	0 %	20 %	40 %	40 %	116747809
260	NC_008554	CGATT	2	10	429282	429291	20 %	40 %	20 %	20 %	116747809
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