MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 61387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008554	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747453
2	NC_008554	AAG	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747453
3	NC_008554	CTG	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747453
4	NC_008554	CGG	2	6	705	710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747453
5	NC_008554	CAA	2	6	750	755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747453
6	NC_008554	CAG	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747453
7	NC_008554	ACC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747453
8	NC_008554	GAT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747453
9	NC_008554	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747453
10	NC_008554	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747453
11	NC_008554	CTT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747453
12	NC_008554	ATC	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747453
13	NC_008554	TGG	2	6	1298	1303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747453
14	NC_008554	ATC	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747453
15	NC_008554	GGA	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747453
16	NC_008554	GCC	2	6	1661	1666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747453
17	NC_008554	ACC	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747454
18	NC_008554	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747455
19	NC_008554	CCG	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747455
20	NC_008554	CAC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747455
21	NC_008554	CTT	2	6	3300	3305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747455
22	NC_008554	ACC	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747455
23	NC_008554	CGA	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747455
24	NC_008554	ATC	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747456
25	NC_008554	ACA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747456
26	NC_008554	CAA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747456
27	NC_008554	CAC	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747456
28	NC_008554	CCT	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
29	NC_008554	GCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747456
30	NC_008554	CCT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
31	NC_008554	GAT	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747456
32	NC_008554	TAC	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747456
33	NC_008554	TCC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747456
34	NC_008554	GAT	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747456
35	NC_008554	CGC	2	6	4608	4613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747456
36	NC_008554	CTG	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747456
37	NC_008554	CCG	2	6	4755	4760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
38	NC_008554	ATA	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116747457
39	NC_008554	GGC	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
40	NC_008554	GGC	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
41	NC_008554	GTT	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747457
42	NC_008554	AGC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
43	NC_008554	GAG	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
44	NC_008554	CCG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
45	NC_008554	CTC	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747457
46	NC_008554	GAA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
47	NC_008554	CGT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
48	NC_008554	GGA	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
49	NC_008554	TCT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747457
50	NC_008554	GGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
51	NC_008554	GAT	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747457
52	NC_008554	AGA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
53	NC_008554	CGT	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
54	NC_008554	AGA	2	6	5889	5894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
55	NC_008554	GCT	2	6	5916	5921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
56	NC_008554	AGC	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
57	NC_008554	ACC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747457
58	NC_008554	GAA	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747457
59	NC_008554	CAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
60	NC_008554	CAG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
61	NC_008554	CGT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
62	NC_008554	CGA	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
63	NC_008554	GCC	2	6	6431	6436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747457
64	NC_008554	CAG	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
65	NC_008554	CGG	3	9	6456	6464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747457
66	NC_008554	GAG	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747457
67	NC_008554	TGC	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747457
68	NC_008554	AGC	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747457
69	NC_008554	ATG	2	6	6539	6544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747457
70	NC_008554	GAA	2	6	6710	6715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747458
71	NC_008554	CCA	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747458
72	NC_008554	CGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
73	NC_008554	TCA	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747458
74	NC_008554	TCG	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
75	NC_008554	GCC	2	6	6982	6987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
76	NC_008554	GGC	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
77	NC_008554	CGG	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
78	NC_008554	TCG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
79	NC_008554	AGC	2	6	7129	7134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
80	NC_008554	GGT	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747458
81	NC_008554	CGA	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
82	NC_008554	GAT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
83	NC_008554	GAT	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
84	NC_008554	TCG	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
85	NC_008554	TGC	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747458
86	NC_008554	CGA	2	6	7475	7480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747458
87	NC_008554	GAT	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747458
88	NC_008554	GCC	2	6	7515	7520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
89	NC_008554	AGA	2	6	7573	7578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747458
90	NC_008554	GGC	2	6	7644	7649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747458
91	NC_008554	CCG	2	6	7685	7690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747458
92	NC_008554	CTC	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747458
93	NC_008554	CTC	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747459
94	NC_008554	GAT	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
95	NC_008554	CAG	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747459
96	NC_008554	GTC	2	6	8089	8094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
97	NC_008554	GAT	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
98	NC_008554	CCA	2	6	8117	8122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747459
99	NC_008554	AGC	2	6	8143	8148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747459
100	NC_008554	ATC	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747459
101	NC_008554	GGC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
102	NC_008554	CGG	2	6	8327	8332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
103	NC_008554	CTG	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
104	NC_008554	GAT	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
105	NC_008554	GGC	2	6	8703	8708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747459
106	NC_008554	AGG	2	6	8749	8754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747459
107	NC_008554	GTA	2	6	8862	8867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747459
108	NC_008554	CGC	2	6	8870	8875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747459
109	NC_008554	GAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747459
110	NC_008554	GTC	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
111	NC_008554	CGT	2	6	8993	8998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
112	NC_008554	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747459
113	NC_008554	TTC	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747459
114	NC_008554	AGG	2	6	9183	9188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747459
115	NC_008554	ATC	2	6	9360	9365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747460
116	NC_008554	GGT	2	6	9387	9392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747460
117	NC_008554	CGC	2	6	9423	9428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747460
118	NC_008554	GTG	2	6	9476	9481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747460
119	NC_008554	TGT	2	6	9492	9497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747460
120	NC_008554	ACC	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747460
121	NC_008554	ACG	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747460
122	NC_008554	CCG	2	6	9801	9806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747460
123	NC_008554	TGG	2	6	10005	10010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747460
124	NC_008554	TCA	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747460
125	NC_008554	CGA	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747460
126	NC_008554	CAG	2	6	10156	10161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747460
127	NC_008554	GCC	2	6	10170	10175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747460
128	NC_008554	GGC	2	6	10211	10216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747460
129	NC_008554	CAC	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747460
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249	NC_008554	ATC	2	6	23103	23108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747465
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253	NC_008554	GGA	2	6	23412	23417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747465
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