MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008544	AGCCG	2	10	23	32	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008544	CGCTG	2	10	1725	1734	0 %	20 %	40 %	40 %	116686249
3	NC_008544	CGCAT	2	10	1818	1827	20 %	20 %	20 %	40 %	116686249
4	NC_008544	GCGCG	2	10	2577	2586	0 %	0 %	60 %	40 %	116686249
5	NC_008544	GGCGC	2	10	3808	3817	0 %	0 %	60 %	40 %	116686250
6	NC_008544	ATCGA	2	10	5775	5784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008544	TCGTT	2	10	6017	6026	0 %	60 %	20 %	20 %	116686253
8	NC_008544	GCCGG	2	10	7994	8003	0 %	0 %	60 %	40 %	116686255
9	NC_008544	GCGCC	3	15	8662	8676	0 %	0 %	40 %	60 %	116686256
10	NC_008544	CCGAG	2	10	8896	8905	20 %	0 %	40 %	40 %	116686256
11	NC_008544	CATTG	2	10	9424	9433	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008544	GGCCG	2	10	10241	10250	0 %	0 %	60 %	40 %	116686257
13	NC_008544	TGGGT	2	10	10460	10469	0 %	40 %	60 %	0 %	116686257
14	NC_008544	TGCCG	2	10	13220	13229	0 %	20 %	40 %	40 %	116686259
15	NC_008544	AGCCG	2	10	13298	13307	20 %	0 %	40 %	40 %	116686259
16	NC_008544	GTTGC	2	10	15628	15637	0 %	40 %	40 %	20 %	116686261
17	NC_008544	GCGAG	2	10	16240	16249	20 %	0 %	60 %	20 %	116686262
18	NC_008544	GCGTT	2	10	17059	17068	0 %	40 %	40 %	20 %	116686263
19	NC_008544	GAGCG	2	10	21658	21667	20 %	0 %	60 %	20 %	116686268
20	NC_008544	AATTC	2	10	22827	22836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008544	CATTG	2	10	24013	24022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008544	CGATG	2	10	24181	24190	20 %	20 %	40 %	20 %	116686271
23	NC_008544	CAGGC	2	10	25351	25360	20 %	0 %	40 %	40 %	116686272
24	NC_008544	CGAAG	2	10	26305	26314	40 %	0 %	40 %	20 %	116686274
25	NC_008544	CGTCG	2	10	26782	26791	0 %	20 %	40 %	40 %	116686274
26	NC_008544	CCGGC	2	10	27527	27536	0 %	0 %	40 %	60 %	116686275
27	NC_008544	GCCGT	2	10	27910	27919	0 %	20 %	40 %	40 %	116686275
28	NC_008544	GCCGG	2	10	28674	28683	0 %	0 %	60 %	40 %	116686276
29	NC_008544	CATCG	2	10	30123	30132	20 %	20 %	20 %	40 %	116686277
30	NC_008544	CACGA	2	10	32528	32537	40 %	0 %	20 %	40 %	116686279
31	NC_008544	CACGG	2	10	33092	33101	20 %	0 %	40 %	40 %	116686280
32	NC_008544	CCGCA	2	10	34481	34490	20 %	0 %	20 %	60 %	116686282
33	NC_008544	CGCGT	2	10	39685	39694	0 %	20 %	40 %	40 %	116686286
34	NC_008544	CAAAA	2	10	39841	39850	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008544	AAGGA	2	10	40927	40936	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008544	CGCTG	2	10	41970	41979	0 %	20 %	40 %	40 %	116686288
37	NC_008544	CATCG	2	10	42769	42778	20 %	20 %	20 %	40 %	116686289
38	NC_008544	GCGCG	2	10	44890	44899	0 %	0 %	60 %	40 %	116686291
39	NC_008544	CCGTG	2	10	45912	45921	0 %	20 %	40 %	40 %	116686292
40	NC_008544	GTTGC	2	10	46339	46348	0 %	40 %	40 %	20 %	116686292
41	NC_008544	CATCG	2	10	46559	46568	20 %	20 %	20 %	40 %	116686293
42	NC_008544	GCGCC	2	10	48351	48360	0 %	0 %	40 %	60 %	116686295
43	NC_008544	GCCCG	2	10	52194	52203	0 %	0 %	40 %	60 %	116686299
44	NC_008544	GATCG	2	10	54246	54255	20 %	20 %	40 %	20 %	116686301
45	NC_008544	GCGCC	2	10	54581	54590	0 %	0 %	40 %	60 %	116686301
46	NC_008544	CGCGC	2	10	58067	58076	0 %	0 %	40 %	60 %	116686302
47	NC_008544	TCGCG	2	10	59774	59783	0 %	20 %	40 %	40 %	116686303
48	NC_008544	GCGCC	2	10	59902	59911	0 %	0 %	40 %	60 %	116686304
49	NC_008544	TTGCG	2	10	60196	60205	0 %	40 %	40 %	20 %	116686304
50	NC_008544	TCGAT	2	10	62370	62379	20 %	40 %	20 %	20 %	116686306
51	NC_008544	TGCGC	2	10	62515	62524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008544	TGCCG	2	10	62585	62594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008544	ATCGG	2	10	64063	64072	20 %	20 %	40 %	20 %	116686308
54	NC_008544	CCGTC	2	10	64812	64821	0 %	20 %	20 %	60 %	116686309
55	NC_008544	GGCCG	2	10	67720	67729	0 %	0 %	60 %	40 %	116686313
56	NC_008544	CCGGT	2	10	68155	68164	0 %	20 %	40 %	40 %	116686313
57	NC_008544	GCGTG	2	10	68650	68659	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008544	GCGCC	2	10	71095	71104	0 %	0 %	40 %	60 %	116686316
59	NC_008544	GCGAC	2	10	71401	71410	20 %	0 %	40 %	40 %	116686316
60	NC_008544	CGTCG	2	10	71429	71438	0 %	20 %	40 %	40 %	116686316
61	NC_008544	CCGGC	2	10	71575	71584	0 %	0 %	40 %	60 %	116686316
62	NC_008544	TGCCC	2	10	72241	72250	0 %	20 %	20 %	60 %	116686317
63	NC_008544	ATACG	2	10	73577	73586	40 %	20 %	20 %	20 %	116686317
64	NC_008544	CCGGC	2	10	73977	73986	0 %	0 %	40 %	60 %	116686318
65	NC_008544	ATCGC	2	10	74357	74366	20 %	20 %	20 %	40 %	116686318
66	NC_008544	CGCAG	2	10	74685	74694	20 %	0 %	40 %	40 %	116686318
67	NC_008544	GTTCG	2	10	75226	75235	0 %	40 %	40 %	20 %	116686318
68	NC_008544	GCCGT	2	10	75542	75551	0 %	20 %	40 %	40 %	116686319
69	NC_008544	GCGAT	2	10	76200	76209	20 %	20 %	40 %	20 %	116686320
70	NC_008544	CGACG	2	10	76309	76318	20 %	0 %	40 %	40 %	116686320
71	NC_008544	CATCC	2	10	76649	76658	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008544	ACGCC	2	10	77144	77153	20 %	0 %	20 %	60 %	116686321
73	NC_008544	TGCGC	2	10	78496	78505	0 %	20 %	40 %	40 %	116686322
74	NC_008544	GGGTC	2	10	80599	80608	0 %	20 %	60 %	20 %	116686325
75	NC_008544	GCGAT	2	10	81356	81365	20 %	20 %	40 %	20 %	116686326
76	NC_008544	GGGCT	2	10	82851	82860	0 %	20 %	60 %	20 %	116686327
77	NC_008544	ATGCG	2	10	83800	83809	20 %	20 %	40 %	20 %	116686328
78	NC_008544	GCCTC	2	10	83953	83962	0 %	20 %	20 %	60 %	116686328
79	NC_008544	CAACG	2	10	86683	86692	40 %	0 %	20 %	40 %	116686330
80	NC_008544	CCGCG	2	10	87216	87225	0 %	0 %	40 %	60 %	116686332
81	NC_008544	GCCAC	2	10	88169	88178	20 %	0 %	20 %	60 %	116686333
82	NC_008544	CGGGA	2	10	89644	89653	20 %	0 %	60 %	20 %	116686334
83	NC_008544	CCGCG	2	10	90360	90369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_008544	CATCG	2	10	90391	90400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008544	CGGCT	2	10	91188	91197	0 %	20 %	40 %	40 %	116686337
86	NC_008544	AAGCG	2	10	91408	91417	40 %	0 %	40 %	20 %	116686338
87	NC_008544	GGGCC	2	10	95134	95143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_008544	ATGCG	2	10	97164	97173	20 %	20 %	40 %	20 %	116686343
89	NC_008544	GTTCG	2	10	98863	98872	0 %	40 %	40 %	20 %	116686343
90	NC_008544	GGCGA	2	10	99179	99188	20 %	0 %	60 %	20 %	116686343
91	NC_008544	CACGC	2	10	99660	99669	20 %	0 %	20 %	60 %	116686343
92	NC_008544	GCCCG	2	10	101484	101493	0 %	0 %	40 %	60 %	116686345
93	NC_008544	CGGCA	2	10	102305	102314	20 %	0 %	40 %	40 %	116686345
94	NC_008544	CGACG	2	10	102535	102544	20 %	0 %	40 %	40 %	116686346
95	NC_008544	CCACG	2	10	102799	102808	20 %	0 %	20 %	60 %	116686346
96	NC_008544	CGACG	2	10	104541	104550	20 %	0 %	40 %	40 %	116686347
97	NC_008544	GCTCG	2	10	105262	105271	0 %	20 %	40 %	40 %	116686348
98	NC_008544	GGCGC	2	10	106204	106213	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008544	CGCGC	2	10	108808	108817	0 %	0 %	40 %	60 %	116686351
100	NC_008544	GCCGC	2	10	109140	109149	0 %	0 %	40 %	60 %	116686351
101	NC_008544	TGCGC	2	10	109193	109202	0 %	20 %	40 %	40 %	116686351
102	NC_008544	TGCGC	2	10	109728	109737	0 %	20 %	40 %	40 %	116686351
103	NC_008544	TGCGC	2	10	110363	110372	0 %	20 %	40 %	40 %	116686351
104	NC_008544	GCGCT	2	10	112092	112101	0 %	20 %	40 %	40 %	116686351
105	NC_008544	CCGGG	2	10	112925	112934	0 %	0 %	60 %	40 %	116686351
106	NC_008544	CGAGC	2	10	113439	113448	20 %	0 %	40 %	40 %	116686351
107	NC_008544	TTCGA	2	10	113554	113563	20 %	40 %	20 %	20 %	116686351
108	NC_008544	CCACG	2	10	113670	113679	20 %	0 %	20 %	60 %	116686351
109	NC_008544	GCGAC	2	10	114122	114131	20 %	0 %	40 %	40 %	116686351
110	NC_008544	TGGTC	2	10	114419	114428	0 %	40 %	40 %	20 %	116686351
111	NC_008544	GGCGC	2	10	114760	114769	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008544	GGAAC	2	10	115229	115238	40 %	0 %	40 %	20 %	116686352
113	NC_008544	CGCGG	2	10	115926	115935	0 %	0 %	60 %	40 %	116686352
114	NC_008544	CGGTG	2	10	118664	118673	0 %	20 %	60 %	20 %	116686355
115	NC_008544	CCTCT	2	10	120569	120578	0 %	40 %	0 %	60 %	116686356
116	NC_008544	GCCGC	2	10	120796	120805	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_008544	GCCGC	2	10	123848	123857	0 %	0 %	40 %	60 %	116686361
118	NC_008544	CGAGC	2	10	125186	125195	20 %	0 %	40 %	40 %	116686362
119	NC_008544	GCCGA	2	10	125850	125859	20 %	0 %	40 %	40 %	116686362
120	NC_008544	CGAGC	2	10	127154	127163	20 %	0 %	40 %	40 %	116686362
121	NC_008544	TGACG	2	10	129375	129384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008544	ATCGC	2	10	130436	130445	20 %	20 %	20 %	40 %	116686364
123	NC_008544	CGGCG	2	10	131839	131848	0 %	0 %	60 %	40 %	116686365
124	NC_008544	TGTCA	2	10	133593	133602	20 %	40 %	20 %	20 %	116686366
125	NC_008544	ACCGA	2	10	133909	133918	40 %	0 %	20 %	40 %	116686367
126	NC_008544	CGCGC	2	10	134322	134331	0 %	0 %	40 %	60 %	116686367
127	NC_008544	GCACG	2	10	135260	135269	20 %	0 %	40 %	40 %	116686368
128	NC_008544	GCCGC	2	10	136180	136189	0 %	0 %	40 %	60 %	116686369
129	NC_008544	CGAGC	2	10	136393	136402	20 %	0 %	40 %	40 %	116686369
130	NC_008544	CGCGC	2	10	136948	136957	0 %	0 %	40 %	60 %	116686369
131	NC_008544	ACGAC	2	10	137553	137562	40 %	0 %	20 %	40 %	116686370
132	NC_008544	CTTCG	2	10	137989	137998	0 %	40 %	20 %	40 %	116686370
133	NC_008544	ATTGG	2	10	138466	138475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008544	CGCCC	2	10	138800	138809	0 %	0 %	20 %	80 %	116686371
135	NC_008544	GTGCC	2	10	139195	139204	0 %	20 %	40 %	40 %	116686371
136	NC_008544	TGATT	2	10	140169	140178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008544	TCGCA	2	10	141169	141178	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_008544	GGTCG	2	10	142024	142033	0 %	20 %	60 %	20 %	116686374
139	NC_008544	GCCGC	3	15	145142	145156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_008544	CGCGC	2	10	146738	146747	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_008544	GCGCG	2	10	147804	147813	0 %	0 %	60 %	40 %	116686379
142	NC_008544	CGACG	2	10	150572	150581	20 %	0 %	40 %	40 %	116686380
143	NC_008544	TCGCG	2	10	150613	150622	0 %	20 %	40 %	40 %	116686380
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145	NC_008544	GCCGC	2	10	151426	151435	0 %	0 %	40 %	60 %	116686381
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147	NC_008544	CTGCG	2	10	155830	155839	0 %	20 %	40 %	40 %	116686385
148	NC_008544	CAACT	2	10	155887	155896	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_008544	GCGCG	2	10	156766	156775	0 %	0 %	60 %	40 %	116686387
150	NC_008544	TTCAC	2	10	157064	157073	20 %	40 %	0 %	40 %	116686388
151	NC_008544	GCGCG	2	10	157557	157566	0 %	0 %	60 %	40 %	116686388
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158	NC_008544	TCGCA	2	10	161380	161389	20 %	20 %	20 %	40 %	116686392
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160	NC_008544	GTTCG	2	10	164314	164323	0 %	40 %	40 %	20 %	116686394
161	NC_008544	CGGCG	2	10	165704	165713	0 %	0 %	60 %	40 %	116686395
162	NC_008544	CGCGC	2	10	166055	166064	0 %	0 %	40 %	60 %	116686395
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165	NC_008544	CGGCG	2	10	170166	170175	0 %	0 %	60 %	40 %	116686399
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172	NC_008544	TCGCG	2	10	177398	177407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_008544	CACCG	2	10	177637	177646	20 %	0 %	20 %	60 %	116686407
174	NC_008544	CGCGA	2	10	179219	179228	20 %	0 %	40 %	40 %	116686407
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177	NC_008544	CCGCG	2	10	180919	180928	0 %	0 %	40 %	60 %	116686408
178	NC_008544	GATGC	2	10	181319	181328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_008544	TGACG	2	10	181434	181443	20 %	20 %	40 %	20 %	116686409
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182	NC_008544	GCCCA	2	10	186838	186847	20 %	0 %	20 %	60 %	116686415
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191	NC_008544	TGTCG	2	10	196097	196106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_008544	CGCGG	2	10	199331	199340	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_008544	CAGTG	2	10	201428	201437	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_008544	ACGGC	2	10	202316	202325	20 %	0 %	40 %	40 %	116686433
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209	NC_008544	GTGCT	2	10	207839	207848	0 %	40 %	40 %	20 %	116686440
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213	NC_008544	TGCGC	2	10	211405	211414	0 %	20 %	40 %	40 %	116686442
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217	NC_008544	CGATG	2	10	215576	215585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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219	NC_008544	CCCGC	2	10	217176	217185	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
220	NC_008544	GCGAC	2	10	218624	218633	20 %	0 %	40 %	40 %	116686450
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238	NC_008544	CGGTT	2	10	238658	238667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_008544	CCGAG	2	10	259969	259978	20 %	0 %	40 %	40 %	116686484
264	NC_008544	AGAAA	2	10	261013	261022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008544	TGCGA	2	10	261158	261167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_008544	CGCGC	2	10	261880	261889	0 %	0 %	40 %	60 %	116686486
267	NC_008544	GGCCA	2	10	263479	263488	20 %	0 %	40 %	40 %	116686487
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401	NC_008544	GGGAG	2	10	398689	398698	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
402	NC_008544	CTCAT	2	10	400688	400697	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
403	NC_008544	CGGTG	2	10	403322	403331	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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