MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 18375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008544	CCG	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686246
2	NC_008544	GTC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686246
3	NC_008544	GTG	2	6	89	94	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686246
4	NC_008544	ATG	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686246
5	NC_008544	GCG	2	6	158	163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686246
6	NC_008544	TTG	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686246
7	NC_008544	ATG	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686246
8	NC_008544	GCT	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686247
9	NC_008544	TCG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686247
10	NC_008544	CGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686247
11	NC_008544	GCG	2	6	489	494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686247
12	NC_008544	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686247
13	NC_008544	GAT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686247
14	NC_008544	CGA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686248
15	NC_008544	GCG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686248
16	NC_008544	CTG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686248
17	NC_008544	CAT	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686249
18	NC_008544	CGG	2	6	1679	1684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686249
19	NC_008544	CAT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686249
20	NC_008544	CGT	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
21	NC_008544	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686249
22	NC_008544	ACG	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
23	NC_008544	CCG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
24	NC_008544	TGC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
25	NC_008544	TGG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686249
26	NC_008544	CGG	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686249
27	NC_008544	CCG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
28	NC_008544	GCT	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
29	NC_008544	CGC	2	6	2334	2339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
30	NC_008544	AGC	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
31	NC_008544	CGT	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
32	NC_008544	CGC	3	9	2487	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
33	NC_008544	GCC	2	6	2500	2505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
34	NC_008544	GCT	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
35	NC_008544	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
36	NC_008544	GAC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
37	NC_008544	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686249
38	NC_008544	CGA	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
39	NC_008544	GCT	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
40	NC_008544	TGA	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686249
41	NC_008544	CGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
42	NC_008544	GCT	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
43	NC_008544	TCG	3	9	2813	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
44	NC_008544	CGT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
45	NC_008544	CGC	2	6	2931	2936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
46	NC_008544	GCC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
47	NC_008544	CTG	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
48	NC_008544	CGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
49	NC_008544	CGG	2	6	3166	3171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686250
50	NC_008544	CGA	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
51	NC_008544	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
52	NC_008544	TGC	3	9	3226	3234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
53	NC_008544	TGC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
54	NC_008544	TCG	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
55	NC_008544	CGC	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
56	NC_008544	CCG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
57	NC_008544	GCT	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
58	NC_008544	CGA	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
59	NC_008544	TCG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
60	NC_008544	CGA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
61	NC_008544	TCG	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
62	NC_008544	ACT	2	6	3764	3769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686250
63	NC_008544	CGG	3	9	3772	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686250
64	NC_008544	GTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
65	NC_008544	TGC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
66	NC_008544	GCT	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
67	NC_008544	ACG	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
68	NC_008544	CAC	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686250
69	NC_008544	GCC	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
70	NC_008544	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
71	NC_008544	CTT	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686251
72	NC_008544	CGT	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
73	NC_008544	ACG	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
74	NC_008544	CGA	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
75	NC_008544	GCC	2	6	4449	4454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
76	NC_008544	GCG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
77	NC_008544	AGG	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686251
78	NC_008544	CGA	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
79	NC_008544	GCC	2	6	4530	4535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
80	NC_008544	CCG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
81	NC_008544	TGA	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686251
82	NC_008544	GTC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
83	NC_008544	GCG	2	6	4632	4637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
84	NC_008544	GCA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
85	NC_008544	CCG	3	9	4678	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
86	NC_008544	CTA	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686251
87	NC_008544	CTG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
88	NC_008544	TCG	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
89	NC_008544	TCA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686251
90	NC_008544	GCT	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
91	NC_008544	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
92	NC_008544	CGT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
93	NC_008544	ACG	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
94	NC_008544	CCG	3	9	5186	5194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
95	NC_008544	GCG	2	6	5430	5435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686252
96	NC_008544	TCG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
97	NC_008544	TCG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
98	NC_008544	CCG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686252
99	NC_008544	CGT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
100	NC_008544	GCT	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
101	NC_008544	CGA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686252
102	NC_008544	TGC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
103	NC_008544	CGG	2	6	6074	6079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686253
104	NC_008544	GGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686253
105	NC_008544	ACT	3	9	6368	6376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686253
106	NC_008544	GTC	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686253
107	NC_008544	ATC	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686253
108	NC_008544	TCG	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
109	NC_008544	GCT	2	6	6611	6616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
110	NC_008544	CGC	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686254
111	NC_008544	CGC	2	6	6875	6880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686254
112	NC_008544	CTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
113	NC_008544	CGT	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
114	NC_008544	CAC	3	9	6971	6979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686254
115	NC_008544	ACG	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686254
116	NC_008544	CGT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686255
117	NC_008544	CGG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
118	NC_008544	GCC	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686255
119	NC_008544	CGC	2	6	7394	7399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686255
120	NC_008544	ACG	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686255
121	NC_008544	TGC	2	6	7637	7642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686255
122	NC_008544	GCT	2	6	7706	7711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686255
123	NC_008544	ACC	2	6	7855	7860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686255
124	NC_008544	GCG	2	6	7889	7894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
125	NC_008544	GCG	2	6	8038	8043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
126	NC_008544	GCG	2	6	8065	8070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
127	NC_008544	GCG	2	6	8245	8250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686256
128	NC_008544	ACG	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686256
129	NC_008544	GCG	2	6	8335	8340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686256
130	NC_008544	TCG	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686256
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252	NC_008544	CGT	2	6	15084	15089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686261
253	NC_008544	GCC	3	9	15271	15279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686261
254	NC_008544	ATG	2	6	15320	15325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686261
255	NC_008544	CGA	2	6	15549	15554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686261
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273	NC_008544	GAC	2	6	16350	16355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686262
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376	NC_008544	GGC	2	6	24259	24264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686271
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498	NC_008544	GAA	2	6	31657	31662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116686279
499	NC_008544	GCC	2	6	31663	31668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686279
500	NC_008544	GCG	2	6	31752	31757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686279

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