MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008544	A	6	6	1295	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008544	T	6	6	1506	1511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008544	A	6	6	6046	6051	100 %	0 %	0 %	0 %	116686253
4	NC_008544	A	6	6	9542	9547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008544	A	7	7	20483	20489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008544	A	7	7	29776	29782	100 %	0 %	0 %	0 %	116686277
7	NC_008544	C	6	6	30593	30598	0 %	0 %	0 %	100 %	116686278
8	NC_008544	C	6	6	37293	37298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008544	A	6	6	40135	40140	100 %	0 %	0 %	0 %	116686287
10	NC_008544	C	6	6	48150	48155	0 %	0 %	0 %	100 %	116686294
11	NC_008544	C	6	6	48248	48253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_008544	T	6	6	49528	49533	0 %	100 %	0 %	0 %	116686296
13	NC_008544	C	7	7	50149	50155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_008544	C	7	7	54401	54407	0 %	0 %	0 %	100 %	116686301
15	NC_008544	C	6	6	65573	65578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_008544	A	6	6	66536	66541	100 %	0 %	0 %	0 %	116686312
17	NC_008544	G	6	6	66657	66662	0 %	0 %	100 %	0 %	116686312
18	NC_008544	A	7	7	70090	70096	100 %	0 %	0 %	0 %	116686315
19	NC_008544	A	6	6	76559	76564	100 %	0 %	0 %	0 %	116686320
20	NC_008544	A	6	6	76602	76607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008544	T	6	6	82324	82329	0 %	100 %	0 %	0 %	116686327
22	NC_008544	G	6	6	85556	85561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008544	A	6	6	86788	86793	100 %	0 %	0 %	0 %	116686331
24	NC_008544	T	6	6	86971	86976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008544	A	7	7	95226	95232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008544	A	7	7	105156	105162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008544	T	6	6	105167	105172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008544	A	6	6	106451	106456	100 %	0 %	0 %	0 %	116686349
29	NC_008544	T	7	7	117900	117906	0 %	100 %	0 %	0 %	116686354
30	NC_008544	A	7	7	118366	118372	100 %	0 %	0 %	0 %	116686355
31	NC_008544	G	6	6	119186	119191	0 %	0 %	100 %	0 %	116686355
32	NC_008544	A	7	7	120106	120112	100 %	0 %	0 %	0 %	116686356
33	NC_008544	T	6	6	129305	129310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008544	A	6	6	129323	129328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008544	G	7	7	130926	130932	0 %	0 %	100 %	0 %	116686364
36	NC_008544	T	6	6	181208	181213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008544	T	6	6	183699	183704	0 %	100 %	0 %	0 %	116686411
38	NC_008544	A	6	6	184725	184730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008544	C	6	6	186180	186185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_008544	C	6	6	188631	188636	0 %	0 %	0 %	100 %	116686418
41	NC_008544	A	6	6	195295	195300	100 %	0 %	0 %	0 %	116686424
42	NC_008544	T	6	6	196290	196295	0 %	100 %	0 %	0 %	116686426
43	NC_008544	T	7	7	207100	207106	0 %	100 %	0 %	0 %	116686439
44	NC_008544	T	6	6	207223	207228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008544	G	6	6	221291	221296	0 %	0 %	100 %	0 %	116686451
46	NC_008544	C	6	6	240194	240199	0 %	0 %	0 %	100 %	116686465
47	NC_008544	A	6	6	251760	251765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008544	C	6	6	257820	257825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_008544	T	6	6	264020	264025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008544	C	6	6	274475	274480	0 %	0 %	0 %	100 %	116686497
51	NC_008544	C	7	7	274975	274981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_008544	A	8	8	275903	275910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008544	T	6	6	277618	277623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008544	A	6	6	277901	277906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008544	A	6	6	282681	282686	100 %	0 %	0 %	0 %	116686503
56	NC_008544	A	6	6	287802	287807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008544	A	6	6	292820	292825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008544	T	6	6	293534	293539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008544	A	6	6	301930	301935	100 %	0 %	0 %	0 %	116686523
60	NC_008544	T	6	6	309505	309510	0 %	100 %	0 %	0 %	116686529
61	NC_008544	A	6	6	313312	313317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008544	A	6	6	317757	317762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008544	C	6	6	320179	320184	0 %	0 %	0 %	100 %	116686538
64	NC_008544	A	6	6	323634	323639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008544	T	6	6	326688	326693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008544	A	7	7	341772	341778	100 %	0 %	0 %	0 %	116686557
67	NC_008544	A	6	6	353695	353700	100 %	0 %	0 %	0 %	116686569
68	NC_008544	T	7	7	354755	354761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008544	A	6	6	356370	356375	100 %	0 %	0 %	0 %	116686572
70	NC_008544	A	6	6	358666	358671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008544	T	6	6	359305	359310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008544	A	6	6	360461	360466	100 %	0 %	0 %	0 %	116686575
73	NC_008544	T	6	6	368368	368373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008544	A	6	6	368609	368614	100 %	0 %	0 %	0 %	116686582
75	NC_008544	G	7	7	372649	372655	0 %	0 %	100 %	0 %	116686583
76	NC_008544	T	6	6	376173	376178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008544	A	6	6	384051	384056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008544	T	7	7	388256	388262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008544	G	6	6	390085	390090	0 %	0 %	100 %	0 %	116686599
80	NC_008544	G	6	6	393681	393686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008544	G	6	6	396800	396805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008544	G	6	6	398607	398612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008544	G	6	6	399075	399080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008544	G	6	6	399614	399619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008544	A	6	6	401636	401641	100 %	0 %	0 %	0 %	116686604
86	NC_008544	G	6	6	408277	408282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008544	G	6	6	408333	408338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008544	A	6	6	416712	416717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008544	A	6	6	425599	425604	100 %	0 %	0 %	0 %	116686624
90	NC_008544	G	6	6	426118	426123	0 %	0 %	100 %	0 %	116686625
91	NC_008544	A	7	7	433235	433241	100 %	0 %	0 %	0 %	116686634
92	NC_008544	A	6	6	436661	436666	100 %	0 %	0 %	0 %	116686638
93	NC_008544	G	6	6	437165	437170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008544	A	6	6	441321	441326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008544	T	6	6	441934	441939	0 %	100 %	0 %	0 %	116686643
96	NC_008544	G	6	6	445384	445389	0 %	0 %	100 %	0 %	116686645
97	NC_008544	T	6	6	454194	454199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008544	A	6	6	460859	460864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008544	T	6	6	466924	466929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008544	T	6	6	467005	467010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008544	A	7	7	472498	472504	100 %	0 %	0 %	0 %	116686669
102	NC_008544	A	6	6	487005	487010	100 %	0 %	0 %	0 %	116686681
103	NC_008544	G	6	6	489741	489746	0 %	0 %	100 %	0 %	116686684
104	NC_008544	C	6	6	491245	491250	0 %	0 %	0 %	100 %	116686685
105	NC_008544	A	6	6	491609	491614	100 %	0 %	0 %	0 %	116686686
106	NC_008544	T	8	8	498444	498451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008544	A	6	6	501006	501011	100 %	0 %	0 %	0 %	116686692
108	NC_008544	A	6	6	505310	505315	100 %	0 %	0 %	0 %	116686696
109	NC_008544	C	6	6	532291	532296	0 %	0 %	0 %	100 %	116686721
110	NC_008544	C	6	6	538167	538172	0 %	0 %	0 %	100 %	116686726
111	NC_008544	C	6	6	540120	540125	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_008544	A	6	6	563169	563174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008544	A	6	6	577718	577723	100 %	0 %	0 %	0 %	116686757
114	NC_008544	G	6	6	578110	578115	0 %	0 %	100 %	0 %	116686757
115	NC_008544	C	6	6	581422	581427	0 %	0 %	0 %	100 %	116686759
116	NC_008544	A	6	6	584341	584346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008544	A	6	6	587686	587691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008544	T	6	6	598356	598361	0 %	100 %	0 %	0 %	116686773
119	NC_008544	C	6	6	603902	603907	0 %	0 %	0 %	100 %	116686778
120	NC_008544	G	6	6	607021	607026	0 %	0 %	100 %	0 %	116686781
121	NC_008544	G	6	6	612550	612555	0 %	0 %	100 %	0 %	116686786
122	NC_008544	A	6	6	617536	617541	100 %	0 %	0 %	0 %	116686789
123	NC_008544	T	7	7	620494	620500	0 %	100 %	0 %	0 %	116686789
124	NC_008544	C	6	6	621569	621574	0 %	0 %	0 %	100 %	116686789
125	NC_008544	G	6	6	625591	625596	0 %	0 %	100 %	0 %	116686793
126	NC_008544	A	6	6	630686	630691	100 %	0 %	0 %	0 %	116686795
127	NC_008544	G	6	6	632862	632867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008544	G	7	7	639640	639646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008544	C	6	6	644381	644386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_008544	C	6	6	655834	655839	0 %	0 %	0 %	100 %	116686817
131	NC_008544	A	6	6	659095	659100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008544	T	8	8	660261	660268	0 %	100 %	0 %	0 %	116686820
133	NC_008544	A	6	6	667694	667699	100 %	0 %	0 %	0 %	116686826
134	NC_008544	A	6	6	675897	675902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008544	C	6	6	676061	676066	0 %	0 %	0 %	100 %	116686833
136	NC_008544	A	6	6	689597	689602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008544	G	6	6	701863	701868	0 %	0 %	100 %	0 %	116686864
138	NC_008544	T	6	6	703922	703927	0 %	100 %	0 %	0 %	116686867
139	NC_008544	T	6	6	727378	727383	0 %	100 %	0 %	0 %	116686881
140	NC_008544	A	6	6	733184	733189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008544	A	7	7	736282	736288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008544	T	6	6	741440	741445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008544	A	6	6	742670	742675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008544	T	6	6	742962	742967	0 %	100 %	0 %	0 %	116686896
145	NC_008544	A	6	6	750653	750658	100 %	0 %	0 %	0 %	116686904
146	NC_008544	T	7	7	758866	758872	0 %	100 %	0 %	0 %	116686909
147	NC_008544	C	6	6	760928	760933	0 %	0 %	0 %	100 %	116686912
148	NC_008544	A	7	7	768827	768833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008544	G	6	6	771650	771655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008544	C	6	6	771754	771759	0 %	0 %	0 %	100 %	116686921
151	NC_008544	G	6	6	780521	780526	0 %	0 %	100 %	0 %	116686929
152	NC_008544	G	6	6	782872	782877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008544	G	6	6	792103	792108	0 %	0 %	100 %	0 %	116686944
154	NC_008544	C	6	6	814264	814269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_008544	T	7	7	819902	819908	0 %	100 %	0 %	0 %	116686971
156	NC_008544	A	6	6	825440	825445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008544	A	7	7	825481	825487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008544	A	8	8	831140	831147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008544	G	6	6	831455	831460	0 %	0 %	100 %	0 %	116686981
160	NC_008544	C	6	6	837840	837845	0 %	0 %	0 %	100 %	116686984
161	NC_008544	A	6	6	839634	839639	100 %	0 %	0 %	0 %	116686986
162	NC_008544	T	7	7	841685	841691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008544	C	6	6	846229	846234	0 %	0 %	0 %	100 %	116686993
164	NC_008544	C	6	6	847771	847776	0 %	0 %	0 %	100 %	116686995
165	NC_008544	A	6	6	849543	849548	100 %	0 %	0 %	0 %	116686995
166	NC_008544	A	6	6	857629	857634	100 %	0 %	0 %	0 %	116687003
167	NC_008544	G	6	6	869900	869905	0 %	0 %	100 %	0 %	116687015
168	NC_008544	T	6	6	871601	871606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008544	T	6	6	893428	893433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008544	C	6	6	899285	899290	0 %	0 %	0 %	100 %	116687045
171	NC_008544	A	6	6	909022	909027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008544	G	6	6	918213	918218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008544	T	6	6	920475	920480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008544	C	6	6	921944	921949	0 %	0 %	0 %	100 %	116687064
175	NC_008544	C	6	6	924540	924545	0 %	0 %	0 %	100 %	116687067
176	NC_008544	A	8	8	926826	926833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008544	A	6	6	928183	928188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008544	G	6	6	929787	929792	0 %	0 %	100 %	0 %	116687071
179	NC_008544	C	6	6	933205	933210	0 %	0 %	0 %	100 %	116687073
180	NC_008544	T	7	7	933518	933524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008544	A	6	6	949583	949588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008544	T	7	7	949725	949731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008544	T	6	6	950867	950872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008544	A	6	6	989925	989930	100 %	0 %	0 %	0 %	116687119
185	NC_008544	A	6	6	1010046	1010051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008544	A	7	7	1013718	1013724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008544	T	6	6	1014097	1014102	0 %	100 %	0 %	0 %	116687139
188	NC_008544	C	6	6	1016706	1016711	0 %	0 %	0 %	100 %	116687141
189	NC_008544	C	6	6	1018494	1018499	0 %	0 %	0 %	100 %	116687141
190	NC_008544	C	6	6	1026318	1026323	0 %	0 %	0 %	100 %	116687142
191	NC_008544	C	6	6	1031447	1031452	0 %	0 %	0 %	100 %	116687142
192	NC_008544	T	6	6	1032744	1032749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_008544	T	7	7	1033164	1033170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_008544	A	7	7	1033267	1033273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_008544	C	6	6	1033906	1033911	0 %	0 %	0 %	100 %	116687144

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.