MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 3077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	GCGAC	2	10	1034	1043	20 %	0 %	40 %	40 %	162228942
2	NC_008543	CGGCG	2	10	2475	2484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008543	TCACT	2	10	2893	2902	20 %	40 %	0 %	40 %	116691276
4	NC_008543	ACTTC	2	10	3306	3315	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008543	CGCGC	2	10	3559	3568	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_008543	GCAGC	2	10	3839	3848	20 %	0 %	40 %	40 %	116691277
7	NC_008543	GCGCG	2	10	4471	4480	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
8	NC_008543	CGGCG	2	10	4511	4520	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
9	NC_008543	CGGTC	2	10	5199	5208	0 %	20 %	40 %	40 %	116691278
10	NC_008543	GCGCG	2	10	5373	5382	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
11	NC_008543	GGCCG	2	10	5432	5441	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
12	NC_008543	CGATC	2	10	7405	7414	20 %	20 %	20 %	40 %	116691279
13	NC_008543	CGCGG	2	10	8900	8909	0 %	0 %	60 %	40 %	116691281
14	NC_008543	TCCGA	2	10	12124	12133	20 %	20 %	20 %	40 %	116691282
15	NC_008543	TCCGA	2	10	13021	13030	20 %	20 %	20 %	40 %	116691283
16	NC_008543	CCGAG	2	10	13075	13084	20 %	0 %	40 %	40 %	116691283
17	NC_008543	CGTTT	2	10	14605	14614	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008543	GCCGC	2	10	15196	15205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008543	GCGCG	2	10	15592	15601	0 %	0 %	60 %	40 %	116691285
20	NC_008543	GCCGC	2	10	16435	16444	0 %	0 %	40 %	60 %	116691285
21	NC_008543	TCCGC	2	10	17121	17130	0 %	20 %	20 %	60 %	116691286
22	NC_008543	GATCG	2	10	17230	17239	20 %	20 %	40 %	20 %	116691286
23	NC_008543	CGGGC	2	10	17583	17592	0 %	0 %	60 %	40 %	116691286
24	NC_008543	ATGCG	2	10	18186	18195	20 %	20 %	40 %	20 %	116691287
25	NC_008543	GCGAC	2	10	19977	19986	20 %	0 %	40 %	40 %	116691288
26	NC_008543	GACGG	2	10	21454	21463	20 %	0 %	60 %	20 %	116691289
27	NC_008543	CATTT	2	10	21619	21628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008543	CGCGC	2	10	22131	22140	0 %	0 %	40 %	60 %	116691290
29	NC_008543	CGCGT	2	10	24320	24329	0 %	20 %	40 %	40 %	116691293
30	NC_008543	CGACG	2	10	24370	24379	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
31	NC_008543	GGCGC	2	10	24389	24398	0 %	0 %	60 %	40 %	116691293
32	NC_008543	AGCGC	2	10	25279	25288	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
33	NC_008543	ACCGG	2	10	25734	25743	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
34	NC_008543	GCGCG	2	10	26353	26362	0 %	0 %	60 %	40 %	116691293
35	NC_008543	GCGCC	2	10	26657	26666	0 %	0 %	40 %	60 %	116691293
36	NC_008543	GCAAC	2	10	27672	27681	40 %	0 %	20 %	40 %	116691294
37	NC_008543	GCGAC	2	10	29043	29052	20 %	0 %	40 %	40 %	116691295
38	NC_008543	CGCGT	2	10	29508	29517	0 %	20 %	40 %	40 %	116691296
39	NC_008543	CGACG	2	10	30325	30334	20 %	0 %	40 %	40 %	116691297
40	NC_008543	CGATG	2	10	30742	30751	20 %	20 %	40 %	20 %	116691297
41	NC_008543	TCGCC	2	10	31495	31504	0 %	20 %	20 %	60 %	116691297
42	NC_008543	CGCAG	2	10	31554	31563	20 %	0 %	40 %	40 %	116691297
43	NC_008543	CGACG	2	10	32046	32055	20 %	0 %	40 %	40 %	116691298
44	NC_008543	ATGCG	2	10	34144	34153	20 %	20 %	40 %	20 %	116691299
45	NC_008543	TGGTG	2	10	36980	36989	0 %	40 %	60 %	0 %	116691303
46	NC_008543	CGAAC	2	10	37656	37665	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008543	GCGGT	2	10	37703	37712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008543	CCGGG	2	10	38975	38984	0 %	0 %	60 %	40 %	116691304
49	NC_008543	GCGCG	2	10	39485	39494	0 %	0 %	60 %	40 %	116691305
50	NC_008543	GTCGC	2	10	39756	39765	0 %	20 %	40 %	40 %	116691305
51	NC_008543	GCGCG	2	10	40621	40630	0 %	0 %	60 %	40 %	116691306
52	NC_008543	CGCTG	2	10	46408	46417	0 %	20 %	40 %	40 %	116691312
53	NC_008543	GCAAC	2	10	46969	46978	40 %	0 %	20 %	40 %	116691313
54	NC_008543	CGGCA	2	10	47891	47900	20 %	0 %	40 %	40 %	116691314
55	NC_008543	ACGCG	2	10	51869	51878	20 %	0 %	40 %	40 %	116691317
56	NC_008543	CGCGG	2	10	52606	52615	0 %	0 %	60 %	40 %	116691318
57	NC_008543	CGGCA	2	10	53137	53146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008543	ACCGG	2	10	55134	55143	20 %	0 %	40 %	40 %	116691320
59	NC_008543	CGGCT	2	10	55479	55488	0 %	20 %	40 %	40 %	116691320
60	NC_008543	CGCGT	2	10	56279	56288	0 %	20 %	40 %	40 %	116691321
61	NC_008543	TCGGC	2	10	57149	57158	0 %	20 %	40 %	40 %	116691321
62	NC_008543	CGGTT	2	10	58570	58579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008543	CGAAT	2	10	60302	60311	40 %	20 %	20 %	20 %	116691325
64	NC_008543	CGCTG	2	10	62388	62397	0 %	20 %	40 %	40 %	116691327
65	NC_008543	CGGCG	2	10	64424	64433	0 %	0 %	60 %	40 %	116691329
66	NC_008543	GACGC	2	10	65206	65215	20 %	0 %	40 %	40 %	116691330
67	NC_008543	CTGGT	2	10	67501	67510	0 %	40 %	40 %	20 %	116691333
68	NC_008543	CGGTC	2	10	70890	70899	0 %	20 %	40 %	40 %	116691335
69	NC_008543	CCGGC	2	10	72851	72860	0 %	0 %	40 %	60 %	116691337
70	NC_008543	ACCAC	3	15	73383	73397	40 %	0 %	0 %	60 %	116691338
71	NC_008543	TTGCC	2	10	73887	73896	0 %	40 %	20 %	40 %	116691339
72	NC_008543	GCGCC	2	10	74581	74590	0 %	0 %	40 %	60 %	116691341
73	NC_008543	GCCGA	2	10	78833	78842	20 %	0 %	40 %	40 %	116691347
74	NC_008543	AAAAG	2	10	80029	80038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008543	CCGTC	2	10	80221	80230	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_008543	CGTTA	2	10	80823	80832	20 %	40 %	20 %	20 %	116691349
77	NC_008543	GCGCT	2	10	82193	82202	0 %	20 %	40 %	40 %	116691350
78	NC_008543	GCTCG	2	10	84139	84148	0 %	20 %	40 %	40 %	116691350
79	NC_008543	GAACT	2	10	85139	85148	40 %	20 %	20 %	20 %	116691351
80	NC_008543	CACCG	2	10	86639	86648	20 %	0 %	20 %	60 %	116691352
81	NC_008543	AGCGC	2	10	87542	87551	20 %	0 %	40 %	40 %	116691352
82	NC_008543	GCGCG	3	15	89819	89833	0 %	0 %	60 %	40 %	116691354
83	NC_008543	GCACG	2	10	90440	90449	20 %	0 %	40 %	40 %	116691355
84	NC_008543	AAATT	2	10	92966	92975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008543	GGCGT	2	10	94442	94451	0 %	20 %	60 %	20 %	116691358
86	NC_008543	GAAAA	2	10	94855	94864	80 %	0 %	20 %	0 %	116691359
87	NC_008543	CTCCG	2	10	97902	97911	0 %	20 %	20 %	60 %	116691361
88	NC_008543	AGGCC	2	10	99417	99426	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008543	CGCGG	2	10	102392	102401	0 %	0 %	60 %	40 %	116691365
90	NC_008543	CGATT	2	10	106549	106558	20 %	40 %	20 %	20 %	116691370
91	NC_008543	CGGTC	2	10	109390	109399	0 %	20 %	40 %	40 %	116691374
92	NC_008543	TGCGA	2	10	110143	110152	20 %	20 %	40 %	20 %	116691375
93	NC_008543	GACGG	2	10	110678	110687	20 %	0 %	60 %	20 %	116691375
94	NC_008543	CGGCC	2	10	117672	117681	0 %	0 %	40 %	60 %	116691381
95	NC_008543	CGTTG	2	10	120010	120019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008543	CAGGT	2	10	122831	122840	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008543	TCCGA	2	10	124161	124170	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008543	CGACG	2	10	124693	124702	20 %	0 %	40 %	40 %	116691388
99	NC_008543	GCCGG	2	10	126667	126676	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008543	CCGTC	2	10	128528	128537	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008543	TGCGC	2	10	128622	128631	0 %	20 %	40 %	40 %	116691392
102	NC_008543	GGCCG	2	10	129510	129519	0 %	0 %	60 %	40 %	116691392
103	NC_008543	CGGTG	2	10	131846	131855	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008543	ATCGA	2	10	132796	132805	40 %	20 %	20 %	20 %	116691394
105	NC_008543	AGACG	2	10	135969	135978	40 %	0 %	40 %	20 %	116691398
106	NC_008543	CATCG	2	10	136231	136240	20 %	20 %	20 %	40 %	116691398
107	NC_008543	TGAGA	2	10	136404	136413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008543	GCGGG	2	10	137575	137584	0 %	0 %	80 %	20 %	116691400
109	NC_008543	CGCAA	2	10	141206	141215	40 %	0 %	20 %	40 %	116691404
110	NC_008543	GCCAT	2	10	146523	146532	20 %	20 %	20 %	40 %	116691411
111	NC_008543	GCCGA	2	10	148020	148029	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008543	CGAAT	2	10	148201	148210	40 %	20 %	20 %	20 %	116691413
113	NC_008543	CCGAT	2	10	149462	149471	20 %	20 %	20 %	40 %	116691415
114	NC_008543	TTTTG	2	10	150464	150473	0 %	80 %	20 %	0 %	116691416
115	NC_008543	GTTGC	2	10	151812	151821	0 %	40 %	40 %	20 %	116691416
116	NC_008543	ATGGC	2	10	152103	152112	20 %	20 %	40 %	20 %	116691417
117	NC_008543	GAAGC	2	10	153123	153132	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008543	GACGC	2	10	153855	153864	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008543	TCGGT	2	10	154141	154150	0 %	40 %	40 %	20 %	116691419
120	NC_008543	CGACG	2	10	160675	160684	20 %	0 %	40 %	40 %	116691425
121	NC_008543	ACGGA	2	10	160982	160991	40 %	0 %	40 %	20 %	116691425
122	NC_008543	GAATC	2	10	163275	163284	40 %	20 %	20 %	20 %	116691427
123	NC_008543	GGCGT	2	10	163546	163555	0 %	20 %	60 %	20 %	116691428
124	NC_008543	GTGCG	2	10	163664	163673	0 %	20 %	60 %	20 %	116691428
125	NC_008543	GGTGG	2	10	163781	163790	0 %	20 %	80 %	0 %	116691428
126	NC_008543	AACGC	2	10	164086	164095	40 %	0 %	20 %	40 %	116691428
127	NC_008543	CTGGC	2	10	164743	164752	0 %	20 %	40 %	40 %	116691429
128	NC_008543	ATCGG	2	10	164925	164934	20 %	20 %	40 %	20 %	116691429
129	NC_008543	TGGTG	2	10	166079	166088	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008543	GCATC	2	10	166697	166706	20 %	20 %	20 %	40 %	116691431
131	NC_008543	CGGAA	2	10	167364	167373	40 %	0 %	40 %	20 %	116691432
132	NC_008543	CCGCC	2	10	167384	167393	0 %	0 %	20 %	80 %	116691432
133	NC_008543	TCGCT	2	10	171167	171176	0 %	40 %	20 %	40 %	116691438
134	NC_008543	CGCGC	2	10	173411	173420	0 %	0 %	40 %	60 %	116691440
135	NC_008543	CGGCG	2	10	175383	175392	0 %	0 %	60 %	40 %	116691442
136	NC_008543	GCGCG	2	10	175732	175741	0 %	0 %	60 %	40 %	116691442
137	NC_008543	CGTTG	2	10	177946	177955	0 %	40 %	40 %	20 %	116691444
138	NC_008543	TCGGC	2	10	178114	178123	0 %	20 %	40 %	40 %	116691445
139	NC_008543	CGATC	2	10	179220	179229	20 %	20 %	20 %	40 %	116691446
140	NC_008543	CCGGC	2	10	179247	179256	0 %	0 %	40 %	60 %	116691446
141	NC_008543	CGCGA	2	10	179752	179761	20 %	0 %	40 %	40 %	116691446
142	NC_008543	CGTGC	2	10	180165	180174	0 %	20 %	40 %	40 %	116691446
143	NC_008543	AATGG	2	10	181085	181094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008543	ATTTG	2	10	181355	181364	20 %	60 %	20 %	0 %	116691448
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146	NC_008543	CGGCT	2	10	183404	183413	0 %	20 %	40 %	40 %	116691450
147	NC_008543	GCCGT	2	10	183806	183815	0 %	20 %	40 %	40 %	116691450
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151	NC_008543	ACGGT	2	10	187489	187498	20 %	20 %	40 %	20 %	116691452
152	NC_008543	GACGC	2	10	190113	190122	20 %	0 %	40 %	40 %	116691456
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159	NC_008543	CCGAG	2	10	194599	194608	20 %	0 %	40 %	40 %	116691462
160	NC_008543	TGCCG	2	10	194942	194951	0 %	20 %	40 %	40 %	116691462
161	NC_008543	TCGGT	2	10	195487	195496	0 %	40 %	40 %	20 %	116691463
162	NC_008543	GCGCC	2	10	195586	195595	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
163	NC_008543	TCGGT	2	10	196755	196764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_008543	GCCGG	2	10	196839	196848	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_008543	GCCGT	2	10	197532	197541	0 %	20 %	40 %	40 %	116691464
166	NC_008543	GTTCG	2	10	197591	197600	0 %	40 %	40 %	20 %	116691464
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172	NC_008543	GCCGG	2	10	203804	203813	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_008543	CATGC	2	10	207018	207027	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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188	NC_008543	CGGGC	2	10	221800	221809	0 %	0 %	60 %	40 %	116691491
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192	NC_008543	GCGCC	2	10	222940	222949	0 %	0 %	40 %	60 %	116691492
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232	NC_008543	AAATT	2	10	275756	275765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_008543	TCGCG	2	10	276421	276430	0 %	20 %	40 %	40 %	116691546
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250	NC_008543	TGCGC	2	10	289950	289959	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_008543	CGCGG	2	10	291517	291526	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
252	NC_008543	GTAAC	2	10	291549	291558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_008543	CGGCG	2	10	291735	291744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
254	NC_008543	GCGCG	2	10	292214	292223	0 %	0 %	60 %	40 %	116691560
255	NC_008543	TCGAG	2	10	292609	292618	20 %	20 %	40 %	20 %	116691561
256	NC_008543	CCCGA	2	10	295516	295525	20 %	0 %	20 %	60 %	116691562
257	NC_008543	ACGGT	2	10	298677	298686	20 %	20 %	40 %	20 %	116691564
258	NC_008543	GCACG	2	10	299415	299424	20 %	0 %	40 %	40 %	116691565
259	NC_008543	CGAGA	2	10	300397	300406	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_008543	GCGCG	2	10	301442	301451	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
261	NC_008543	CGCAC	2	10	301455	301464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
262	NC_008543	GATTC	2	10	302152	302161	20 %	40 %	20 %	20 %	116691568
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266	NC_008543	TGAAG	2	10	307485	307494	40 %	20 %	40 %	0 %	116691573
267	NC_008543	GCGAC	2	10	307992	308001	20 %	0 %	40 %	40 %	116691574
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269	NC_008543	TTGCG	2	10	309862	309871	0 %	40 %	40 %	20 %	116691575
270	NC_008543	ATCGA	2	10	310354	310363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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392	NC_008543	CGATG	2	10	427948	427957	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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