MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 2555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	GCGAC	2	10	1034	1043	20 %	0 %	40 %	40 %	162228942
2	NC_008543	TCACT	2	10	2893	2902	20 %	40 %	0 %	40 %	116691276
3	NC_008543	GCAGC	2	10	3839	3848	20 %	0 %	40 %	40 %	116691277
4	NC_008543	GCGCG	2	10	4471	4480	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
5	NC_008543	CGGCG	2	10	4511	4520	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
6	NC_008543	CGGTC	2	10	5199	5208	0 %	20 %	40 %	40 %	116691278
7	NC_008543	GCGCG	2	10	5373	5382	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
8	NC_008543	GGCCG	2	10	5432	5441	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
9	NC_008543	CGATC	2	10	7405	7414	20 %	20 %	20 %	40 %	116691279
10	NC_008543	CGCGG	2	10	8900	8909	0 %	0 %	60 %	40 %	116691281
11	NC_008543	TCCGA	2	10	12124	12133	20 %	20 %	20 %	40 %	116691282
12	NC_008543	TCCGA	2	10	13021	13030	20 %	20 %	20 %	40 %	116691283
13	NC_008543	CCGAG	2	10	13075	13084	20 %	0 %	40 %	40 %	116691283
14	NC_008543	GCGCG	2	10	15592	15601	0 %	0 %	60 %	40 %	116691285
15	NC_008543	GCCGC	2	10	16435	16444	0 %	0 %	40 %	60 %	116691285
16	NC_008543	TCCGC	2	10	17121	17130	0 %	20 %	20 %	60 %	116691286
17	NC_008543	GATCG	2	10	17230	17239	20 %	20 %	40 %	20 %	116691286
18	NC_008543	CGGGC	2	10	17583	17592	0 %	0 %	60 %	40 %	116691286
19	NC_008543	ATGCG	2	10	18186	18195	20 %	20 %	40 %	20 %	116691287
20	NC_008543	GCGAC	2	10	19977	19986	20 %	0 %	40 %	40 %	116691288
21	NC_008543	GACGG	2	10	21454	21463	20 %	0 %	60 %	20 %	116691289
22	NC_008543	CGCGC	2	10	22131	22140	0 %	0 %	40 %	60 %	116691290
23	NC_008543	CGCGT	2	10	24320	24329	0 %	20 %	40 %	40 %	116691293
24	NC_008543	CGACG	2	10	24370	24379	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
25	NC_008543	GGCGC	2	10	24389	24398	0 %	0 %	60 %	40 %	116691293
26	NC_008543	AGCGC	2	10	25279	25288	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
27	NC_008543	ACCGG	2	10	25734	25743	20 %	0 %	40 %	40 %	116691293
28	NC_008543	GCGCG	2	10	26353	26362	0 %	0 %	60 %	40 %	116691293
29	NC_008543	GCGCC	2	10	26657	26666	0 %	0 %	40 %	60 %	116691293
30	NC_008543	GCAAC	2	10	27672	27681	40 %	0 %	20 %	40 %	116691294
31	NC_008543	GCGAC	2	10	29043	29052	20 %	0 %	40 %	40 %	116691295
32	NC_008543	CGCGT	2	10	29508	29517	0 %	20 %	40 %	40 %	116691296
33	NC_008543	CGACG	2	10	30325	30334	20 %	0 %	40 %	40 %	116691297
34	NC_008543	CGATG	2	10	30742	30751	20 %	20 %	40 %	20 %	116691297
35	NC_008543	TCGCC	2	10	31495	31504	0 %	20 %	20 %	60 %	116691297
36	NC_008543	CGCAG	2	10	31554	31563	20 %	0 %	40 %	40 %	116691297
37	NC_008543	CGACG	2	10	32046	32055	20 %	0 %	40 %	40 %	116691298
38	NC_008543	ATGCG	2	10	34144	34153	20 %	20 %	40 %	20 %	116691299
39	NC_008543	TGGTG	2	10	36980	36989	0 %	40 %	60 %	0 %	116691303
40	NC_008543	CCGGG	2	10	38975	38984	0 %	0 %	60 %	40 %	116691304
41	NC_008543	GCGCG	2	10	39485	39494	0 %	0 %	60 %	40 %	116691305
42	NC_008543	GTCGC	2	10	39756	39765	0 %	20 %	40 %	40 %	116691305
43	NC_008543	GCGCG	2	10	40621	40630	0 %	0 %	60 %	40 %	116691306
44	NC_008543	CGCTG	2	10	46408	46417	0 %	20 %	40 %	40 %	116691312
45	NC_008543	GCAAC	2	10	46969	46978	40 %	0 %	20 %	40 %	116691313
46	NC_008543	CGGCA	2	10	47891	47900	20 %	0 %	40 %	40 %	116691314
47	NC_008543	ACGCG	2	10	51869	51878	20 %	0 %	40 %	40 %	116691317
48	NC_008543	CGCGG	2	10	52606	52615	0 %	0 %	60 %	40 %	116691318
49	NC_008543	ACCGG	2	10	55134	55143	20 %	0 %	40 %	40 %	116691320
50	NC_008543	CGGCT	2	10	55479	55488	0 %	20 %	40 %	40 %	116691320
51	NC_008543	CGCGT	2	10	56279	56288	0 %	20 %	40 %	40 %	116691321
52	NC_008543	TCGGC	2	10	57149	57158	0 %	20 %	40 %	40 %	116691321
53	NC_008543	CGAAT	2	10	60302	60311	40 %	20 %	20 %	20 %	116691325
54	NC_008543	CGCTG	2	10	62388	62397	0 %	20 %	40 %	40 %	116691327
55	NC_008543	CGGCG	2	10	64424	64433	0 %	0 %	60 %	40 %	116691329
56	NC_008543	GACGC	2	10	65206	65215	20 %	0 %	40 %	40 %	116691330
57	NC_008543	CTGGT	2	10	67501	67510	0 %	40 %	40 %	20 %	116691333
58	NC_008543	CGGTC	2	10	70890	70899	0 %	20 %	40 %	40 %	116691335
59	NC_008543	CCGGC	2	10	72851	72860	0 %	0 %	40 %	60 %	116691337
60	NC_008543	ACCAC	3	15	73383	73397	40 %	0 %	0 %	60 %	116691338
61	NC_008543	TTGCC	2	10	73887	73896	0 %	40 %	20 %	40 %	116691339
62	NC_008543	GCGCC	2	10	74581	74590	0 %	0 %	40 %	60 %	116691341
63	NC_008543	GCCGA	2	10	78833	78842	20 %	0 %	40 %	40 %	116691347
64	NC_008543	CGTTA	2	10	80823	80832	20 %	40 %	20 %	20 %	116691349
65	NC_008543	GCGCT	2	10	82193	82202	0 %	20 %	40 %	40 %	116691350
66	NC_008543	GCTCG	2	10	84139	84148	0 %	20 %	40 %	40 %	116691350
67	NC_008543	GAACT	2	10	85139	85148	40 %	20 %	20 %	20 %	116691351
68	NC_008543	CACCG	2	10	86639	86648	20 %	0 %	20 %	60 %	116691352
69	NC_008543	AGCGC	2	10	87542	87551	20 %	0 %	40 %	40 %	116691352
70	NC_008543	GCGCG	3	15	89819	89833	0 %	0 %	60 %	40 %	116691354
71	NC_008543	GCACG	2	10	90440	90449	20 %	0 %	40 %	40 %	116691355
72	NC_008543	GGCGT	2	10	94442	94451	0 %	20 %	60 %	20 %	116691358
73	NC_008543	GAAAA	2	10	94855	94864	80 %	0 %	20 %	0 %	116691359
74	NC_008543	CTCCG	2	10	97902	97911	0 %	20 %	20 %	60 %	116691361
75	NC_008543	CGCGG	2	10	102392	102401	0 %	0 %	60 %	40 %	116691365
76	NC_008543	CGATT	2	10	106549	106558	20 %	40 %	20 %	20 %	116691370
77	NC_008543	CGGTC	2	10	109390	109399	0 %	20 %	40 %	40 %	116691374
78	NC_008543	TGCGA	2	10	110143	110152	20 %	20 %	40 %	20 %	116691375
79	NC_008543	GACGG	2	10	110678	110687	20 %	0 %	60 %	20 %	116691375
80	NC_008543	CGGCC	2	10	117672	117681	0 %	0 %	40 %	60 %	116691381
81	NC_008543	CGACG	2	10	124693	124702	20 %	0 %	40 %	40 %	116691388
82	NC_008543	TGCGC	2	10	128622	128631	0 %	20 %	40 %	40 %	116691392
83	NC_008543	GGCCG	2	10	129510	129519	0 %	0 %	60 %	40 %	116691392
84	NC_008543	ATCGA	2	10	132796	132805	40 %	20 %	20 %	20 %	116691394
85	NC_008543	AGACG	2	10	135969	135978	40 %	0 %	40 %	20 %	116691398
86	NC_008543	CATCG	2	10	136231	136240	20 %	20 %	20 %	40 %	116691398
87	NC_008543	GCGGG	2	10	137575	137584	0 %	0 %	80 %	20 %	116691400
88	NC_008543	CGCAA	2	10	141206	141215	40 %	0 %	20 %	40 %	116691404
89	NC_008543	GCCAT	2	10	146523	146532	20 %	20 %	20 %	40 %	116691411
90	NC_008543	CGAAT	2	10	148201	148210	40 %	20 %	20 %	20 %	116691413
91	NC_008543	CCGAT	2	10	149462	149471	20 %	20 %	20 %	40 %	116691415
92	NC_008543	TTTTG	2	10	150464	150473	0 %	80 %	20 %	0 %	116691416
93	NC_008543	GTTGC	2	10	151812	151821	0 %	40 %	40 %	20 %	116691416
94	NC_008543	ATGGC	2	10	152103	152112	20 %	20 %	40 %	20 %	116691417
95	NC_008543	TCGGT	2	10	154141	154150	0 %	40 %	40 %	20 %	116691419
96	NC_008543	CGACG	2	10	160675	160684	20 %	0 %	40 %	40 %	116691425
97	NC_008543	ACGGA	2	10	160982	160991	40 %	0 %	40 %	20 %	116691425
98	NC_008543	GAATC	2	10	163275	163284	40 %	20 %	20 %	20 %	116691427
99	NC_008543	GGCGT	2	10	163546	163555	0 %	20 %	60 %	20 %	116691428
100	NC_008543	GTGCG	2	10	163664	163673	0 %	20 %	60 %	20 %	116691428
101	NC_008543	GGTGG	2	10	163781	163790	0 %	20 %	80 %	0 %	116691428
102	NC_008543	AACGC	2	10	164086	164095	40 %	0 %	20 %	40 %	116691428
103	NC_008543	CTGGC	2	10	164743	164752	0 %	20 %	40 %	40 %	116691429
104	NC_008543	ATCGG	2	10	164925	164934	20 %	20 %	40 %	20 %	116691429
105	NC_008543	GCATC	2	10	166697	166706	20 %	20 %	20 %	40 %	116691431
106	NC_008543	CGGAA	2	10	167364	167373	40 %	0 %	40 %	20 %	116691432
107	NC_008543	CCGCC	2	10	167384	167393	0 %	0 %	20 %	80 %	116691432
108	NC_008543	TCGCT	2	10	171167	171176	0 %	40 %	20 %	40 %	116691438
109	NC_008543	CGCGC	2	10	173411	173420	0 %	0 %	40 %	60 %	116691440
110	NC_008543	CGGCG	2	10	175383	175392	0 %	0 %	60 %	40 %	116691442
111	NC_008543	GCGCG	2	10	175732	175741	0 %	0 %	60 %	40 %	116691442
112	NC_008543	CGTTG	2	10	177946	177955	0 %	40 %	40 %	20 %	116691444
113	NC_008543	TCGGC	2	10	178114	178123	0 %	20 %	40 %	40 %	116691445
114	NC_008543	CGATC	2	10	179220	179229	20 %	20 %	20 %	40 %	116691446
115	NC_008543	CCGGC	2	10	179247	179256	0 %	0 %	40 %	60 %	116691446
116	NC_008543	CGCGA	2	10	179752	179761	20 %	0 %	40 %	40 %	116691446
117	NC_008543	CGTGC	2	10	180165	180174	0 %	20 %	40 %	40 %	116691446
118	NC_008543	ATTTG	2	10	181355	181364	20 %	60 %	20 %	0 %	116691448
119	NC_008543	AGCGA	2	10	182780	182789	40 %	0 %	40 %	20 %	116691450
120	NC_008543	CGGCT	2	10	183404	183413	0 %	20 %	40 %	40 %	116691450
121	NC_008543	GCCGT	2	10	183806	183815	0 %	20 %	40 %	40 %	116691450
122	NC_008543	CGGCG	2	10	183892	183901	0 %	0 %	60 %	40 %	116691450
123	NC_008543	GCGCG	2	10	185412	185421	0 %	0 %	60 %	40 %	116691451
124	NC_008543	CGAAT	2	10	186207	186216	40 %	20 %	20 %	20 %	116691451
125	NC_008543	ACGGT	2	10	187489	187498	20 %	20 %	40 %	20 %	116691452
126	NC_008543	GACGC	2	10	190113	190122	20 %	0 %	40 %	40 %	116691456
127	NC_008543	TGTCG	2	10	192425	192434	0 %	40 %	40 %	20 %	116691459
128	NC_008543	TCGCG	2	10	193076	193085	0 %	20 %	40 %	40 %	116691460
129	NC_008543	GCCGC	2	10	193413	193422	0 %	0 %	40 %	60 %	116691461
130	NC_008543	GCGAC	2	10	193710	193719	20 %	0 %	40 %	40 %	116691461
131	NC_008543	GAACG	2	10	193742	193751	40 %	0 %	40 %	20 %	116691461
132	NC_008543	AGCGC	2	10	194272	194281	20 %	0 %	40 %	40 %	116691462
133	NC_008543	CCGAG	2	10	194599	194608	20 %	0 %	40 %	40 %	116691462
134	NC_008543	TGCCG	2	10	194942	194951	0 %	20 %	40 %	40 %	116691462
135	NC_008543	TCGGT	2	10	195487	195496	0 %	40 %	40 %	20 %	116691463
136	NC_008543	GCCGT	2	10	197532	197541	0 %	20 %	40 %	40 %	116691464
137	NC_008543	GTTCG	2	10	197591	197600	0 %	40 %	40 %	20 %	116691464
138	NC_008543	GCGCC	2	10	198812	198821	0 %	0 %	40 %	60 %	116691467
139	NC_008543	CGTGC	2	10	200691	200700	0 %	20 %	40 %	40 %	116691468
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156	NC_008543	CGGGC	2	10	221800	221809	0 %	0 %	60 %	40 %	116691491
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250	NC_008543	CGCGG	2	10	343260	343269	0 %	0 %	60 %	40 %	116691603
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256	NC_008543	CGTGA	2	10	348710	348719	20 %	20 %	40 %	20 %	116691608
257	NC_008543	GCTGC	2	10	351211	351220	0 %	20 %	40 %	40 %	116691611
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259	NC_008543	GCGCG	2	10	353368	353377	0 %	0 %	60 %	40 %	116691613
260	NC_008543	AGCGA	2	10	353450	353459	40 %	0 %	40 %	20 %	116691613
261	NC_008543	CGCGG	2	10	354439	354448	0 %	0 %	60 %	40 %	116691615
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