MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 3

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008539	CCCGTC	2	12	1681	1692	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662342
2	NC_008539	CGATCT	2	12	5710	5721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662344
3	NC_008539	CAGGTA	2	12	8950	8961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116662346
4	NC_008539	GCTCAC	2	12	11988	11999	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662350
5	NC_008539	CTACCA	2	12	13509	13520	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116662352
6	NC_008539	CTCGAA	2	12	13560	13571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116662352
7	NC_008539	CCCGGC	2	12	14004	14015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116662352
8	NC_008539	GGCCGC	2	12	16084	16095	0 %	0 %	50 %	50 %	116662354
9	NC_008539	TCCGGC	2	12	16180	16191	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662355
10	NC_008539	TCCAGC	2	12	16934	16945	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662356
11	NC_008539	GATCCG	2	12	19267	19278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662358
12	NC_008539	CGAGGG	2	12	19857	19868	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116662358
13	NC_008539	GACCAG	2	12	20575	20586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662358
14	NC_008539	GCACCG	2	12	22098	22109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008539	GACCCT	2	12	22860	22871	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662361
16	NC_008539	ACGCCG	2	12	23405	23416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662361
17	NC_008539	CCCGTC	2	12	23595	23606	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662362
18	NC_008539	GCCGGG	2	12	25026	25037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008539	ATCTTC	2	12	25843	25854	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116662364
20	NC_008539	TCCGCC	2	12	27942	27953	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662366
21	NC_008539	CGGCGC	2	12	28889	28900	0 %	0 %	50 %	50 %	116662366
22	NC_008539	CGCTGG	2	12	30737	30748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662368
23	NC_008539	GCTCCG	2	12	32793	32804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662370
24	NC_008539	GCCACG	2	12	34184	34195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662371
25	NC_008539	GCCACC	2	12	34307	34318	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662371
26	NC_008539	AGGCGA	2	12	34584	34595	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662371
27	NC_008539	GTTCAG	2	12	35163	35174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662372
28	NC_008539	CGGGTC	2	12	35187	35198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662372
29	NC_008539	CCCGTC	2	12	35361	35372	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662372
30	NC_008539	GCCCGG	2	12	35992	36003	0 %	0 %	50 %	50 %	116662372
31	NC_008539	GTCACC	2	12	40157	40168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662376
32	NC_008539	CGCGGG	2	12	43354	43365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116662380
33	NC_008539	AGCCTC	2	12	44074	44085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662380
34	NC_008539	TCACCA	2	12	44183	44194	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116662380
35	NC_008539	CGCTGG	2	12	44786	44797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662382
36	NC_008539	GAGCAG	2	12	45416	45427	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662382
37	NC_008539	CGAAAC	2	12	48291	48302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116662384
38	NC_008539	TCATCG	2	12	52467	52478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662388
39	NC_008539	CGTCTC	2	12	53893	53904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116662388
40	NC_008539	TGCCGA	2	12	56662	56673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662391
41	NC_008539	GGCGCT	2	12	59970	59981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662394
42	NC_008539	TGGATA	2	12	61284	61295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116662396
43	NC_008539	GAACCA	2	12	62515	62526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008539	CTTCGA	2	12	64178	64189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662401
45	NC_008539	GCGGCC	2	12	65816	65827	0 %	0 %	50 %	50 %	116662404
46	NC_008539	TGCCGG	2	12	66404	66415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662405
47	NC_008539	GACAGA	2	12	70626	70637	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116662411
48	NC_008539	GACGCC	2	12	71263	71274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662412
49	NC_008539	AGCAAC	2	12	72233	72244	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116662413
50	NC_008539	TATGAA	2	12	75815	75826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304570607
51	NC_008539	TGGCGT	2	12	76306	76317	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	304570607
52	NC_008539	GGCCGC	2	12	77721	77732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008539	GCCGCG	2	12	78185	78196	0 %	0 %	50 %	50 %	116662418
54	NC_008539	CGACGG	2	12	79132	79143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662420
55	NC_008539	GTCCAG	2	12	79319	79330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662420
56	NC_008539	CCGGGA	2	12	79417	79428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662420
57	NC_008539	GCGATC	2	12	81870	81881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662423
58	NC_008539	GCCAAC	2	12	85659	85670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116662425
59	NC_008539	GGCTAC	2	12	86266	86277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662426
60	NC_008539	CGTGAT	2	12	87684	87695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662426
61	NC_008539	CTGGTC	2	12	89183	89194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662428
62	NC_008539	GTCAGC	2	12	89844	89855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662429
63	NC_008539	CATCCC	2	12	90634	90645	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	116662431
64	NC_008539	CATCCC	2	12	90682	90693	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	116662431
65	NC_008539	CTACGG	2	12	91116	91127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662431
66	NC_008539	GCGGTT	2	12	91288	91299	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116662431
67	NC_008539	TCTCCC	2	12	92985	92996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116662432
68	NC_008539	TGCGCT	2	12	93064	93075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662432
69	NC_008539	GGCTCC	2	12	94077	94088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008539	CCATCG	2	12	95431	95442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.