MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 3

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008539	CCGCG	2	10	5208	5217	0 %	0 %	40 %	60 %	116662343
2	NC_008539	GGCCC	2	10	5767	5776	0 %	0 %	40 %	60 %	116662344
3	NC_008539	CAGGG	2	10	6179	6188	20 %	0 %	60 %	20 %	116662345
4	NC_008539	TCTGC	2	10	7282	7291	0 %	40 %	20 %	40 %	116662346
5	NC_008539	AACGG	2	10	9918	9927	40 %	0 %	40 %	20 %	116662347
6	NC_008539	CCGTT	2	10	10397	10406	0 %	40 %	20 %	40 %	116662348
7	NC_008539	CGGCT	2	10	10665	10674	0 %	20 %	40 %	40 %	116662348
8	NC_008539	CAGCG	2	10	12109	12118	20 %	0 %	40 %	40 %	116662350
9	NC_008539	GGCTC	2	10	13811	13820	0 %	20 %	40 %	40 %	116662352
10	NC_008539	GGCCC	2	10	15321	15330	0 %	0 %	40 %	60 %	116662354
11	NC_008539	GGGCG	2	10	15358	15367	0 %	0 %	80 %	20 %	116662354
12	NC_008539	CTGAT	2	10	16371	16380	20 %	40 %	20 %	20 %	116662355
13	NC_008539	GGCGC	2	10	16514	16523	0 %	0 %	60 %	40 %	116662355
14	NC_008539	ACACC	2	10	16737	16746	40 %	0 %	0 %	60 %	116662355
15	NC_008539	ACCCC	2	10	16814	16823	20 %	0 %	0 %	80 %	116662356
16	NC_008539	CCCAG	2	10	18129	18138	20 %	0 %	20 %	60 %	116662358
17	NC_008539	GTCGC	2	10	18806	18815	0 %	20 %	40 %	40 %	116662358
18	NC_008539	CAGGC	2	10	22030	22039	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008539	GCACC	2	10	23694	23703	20 %	0 %	20 %	60 %	116662362
20	NC_008539	CGGCC	2	10	24542	24551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008539	GGCCG	2	10	25358	25367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008539	ATGCA	2	10	25868	25877	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008539	TCACC	2	10	26344	26353	20 %	20 %	0 %	60 %	116662365
24	NC_008539	CGGCT	2	10	26553	26562	0 %	20 %	40 %	40 %	116662365
25	NC_008539	GACCC	2	10	28860	28869	20 %	0 %	20 %	60 %	116662366
26	NC_008539	CGGCC	2	10	28919	28928	0 %	0 %	40 %	60 %	116662366
27	NC_008539	CCTGT	2	10	32929	32938	0 %	40 %	20 %	40 %	116662370
28	NC_008539	CGGCG	2	10	33091	33100	0 %	0 %	60 %	40 %	116662370
29	NC_008539	CAGCG	2	10	36253	36262	20 %	0 %	40 %	40 %	116662372
30	NC_008539	GCGTG	2	10	36494	36503	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008539	CTTGG	2	10	36626	36635	0 %	40 %	40 %	20 %	116662373
32	NC_008539	CCGTG	2	10	36851	36860	0 %	20 %	40 %	40 %	116662373
33	NC_008539	TGGAC	2	10	37111	37120	20 %	20 %	40 %	20 %	116662373
34	NC_008539	GTGGC	2	10	37621	37630	0 %	20 %	60 %	20 %	116662374
35	NC_008539	TGACC	2	10	38741	38750	20 %	20 %	20 %	40 %	116662375
36	NC_008539	GTCTC	2	10	41524	41533	0 %	40 %	20 %	40 %	116662378
37	NC_008539	TGGGC	2	10	44169	44178	0 %	20 %	60 %	20 %	116662380
38	NC_008539	CCATC	2	10	44266	44275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008539	GGTCA	2	10	44530	44539	20 %	20 %	40 %	20 %	116662381
40	NC_008539	GCCCC	2	10	44616	44625	0 %	0 %	20 %	80 %	116662381
41	NC_008539	CCCGC	2	10	47354	47363	0 %	0 %	20 %	80 %	116662384
42	NC_008539	GAGCA	2	10	50907	50916	40 %	0 %	40 %	20 %	116662386
43	NC_008539	CCGAA	2	10	52267	52276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008539	GTCCA	2	10	52598	52607	20 %	20 %	20 %	40 %	116662388
45	NC_008539	TCCTC	2	10	53190	53199	0 %	40 %	0 %	60 %	116662388
46	NC_008539	CGCTG	2	10	53418	53427	0 %	20 %	40 %	40 %	116662388
47	NC_008539	GGCGA	2	10	53771	53780	20 %	0 %	60 %	20 %	116662388
48	NC_008539	ACGGC	2	10	54284	54293	20 %	0 %	40 %	40 %	116662389
49	NC_008539	CACGA	2	10	55940	55949	40 %	0 %	20 %	40 %	116662391
50	NC_008539	GGTCG	2	10	58729	58738	0 %	20 %	60 %	20 %	116662393
51	NC_008539	GGGCT	2	10	58786	58795	0 %	20 %	60 %	20 %	116662393
52	NC_008539	CCGCT	2	10	59856	59865	0 %	20 %	20 %	60 %	116662394
53	NC_008539	CAGCG	2	10	61089	61098	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008539	CAAAG	2	10	61560	61569	60 %	0 %	20 %	20 %	116662396
55	NC_008539	GGGGT	2	10	65242	65251	0 %	20 %	80 %	0 %	116662403
56	NC_008539	TTCGG	2	10	66289	66298	0 %	40 %	40 %	20 %	116662405
57	NC_008539	CGTCC	2	10	67109	67118	0 %	20 %	20 %	60 %	116662406
58	NC_008539	CCAGG	2	10	67587	67596	20 %	0 %	40 %	40 %	116662407
59	NC_008539	AAGAC	2	10	68711	68720	60 %	0 %	20 %	20 %	116662408
60	NC_008539	CAGTC	2	10	70301	70310	20 %	20 %	20 %	40 %	116662410
61	NC_008539	AGGCC	2	10	71013	71022	20 %	0 %	40 %	40 %	116662412
62	NC_008539	ACGGA	2	10	71123	71132	40 %	0 %	40 %	20 %	116662412
63	NC_008539	CGAAC	2	10	71368	71377	40 %	0 %	20 %	40 %	116662412
64	NC_008539	GGCCG	2	10	73417	73426	0 %	0 %	60 %	40 %	116662414
65	NC_008539	GTTCC	2	10	75864	75873	0 %	40 %	20 %	40 %	304570607
66	NC_008539	GTCCT	2	10	76638	76647	0 %	40 %	20 %	40 %	304570607
67	NC_008539	ACTGG	2	10	77021	77030	20 %	20 %	40 %	20 %	304570607
68	NC_008539	CAGTC	2	10	77209	77218	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008539	GTCCG	2	10	80587	80596	0 %	20 %	40 %	40 %	116662421
70	NC_008539	GCAAC	2	10	82214	82223	40 %	0 %	20 %	40 %	116662423
71	NC_008539	GCGCT	2	10	83086	83095	0 %	20 %	40 %	40 %	116662423
72	NC_008539	CATCC	2	10	83879	83888	20 %	20 %	0 %	60 %	304570608
73	NC_008539	CTGGC	2	10	84461	84470	0 %	20 %	40 %	40 %	116662425
74	NC_008539	CCCGG	2	10	85150	85159	0 %	0 %	40 %	60 %	116662425
75	NC_008539	GAACA	2	10	85496	85505	60 %	0 %	20 %	20 %	116662425
76	NC_008539	CCCAG	2	10	88675	88684	20 %	0 %	20 %	60 %	116662428
77	NC_008539	CCCAC	2	10	90824	90833	20 %	0 %	0 %	80 %	116662431
78	NC_008539	CCGTG	2	10	92767	92776	0 %	20 %	40 %	40 %	116662432
79	NC_008539	TGGGC	2	10	93054	93063	0 %	20 %	60 %	20 %	116662432
80	NC_008539	TCCTG	2	10	93111	93120	0 %	40 %	20 %	40 %	116662432
81	NC_008539	ACCCC	2	10	93571	93580	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_008539	CTGCG	2	10	94137	94146	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008539	GGCCC	2	10	94410	94419	0 %	0 %	40 %	60 %	116662434
84	NC_008539	GCCCG	2	10	94980	94989	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.