MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 3

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008539	GGGA	2	8	356	363	25 %	0 %	75 %	0 %	116662342
2	NC_008539	CTTT	2	8	973	980	0 %	75 %	0 %	25 %	116662342
3	NC_008539	GCGG	2	8	1207	1214	0 %	0 %	75 %	25 %	116662342
4	NC_008539	GCGG	2	8	2685	2692	0 %	0 %	75 %	25 %	116662342
5	NC_008539	CCCG	2	8	4396	4403	0 %	0 %	25 %	75 %	116662342
6	NC_008539	CCTC	2	8	4806	4813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008539	GCCT	2	8	5392	5399	0 %	25 %	25 %	50 %	116662343
8	NC_008539	CGGC	2	8	5756	5763	0 %	0 %	50 %	50 %	116662344
9	NC_008539	CGTG	2	8	5958	5965	0 %	25 %	50 %	25 %	116662345
10	NC_008539	CGGC	2	8	6259	6266	0 %	0 %	50 %	50 %	116662345
11	NC_008539	CGAC	2	8	6861	6868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008539	GGAG	2	8	7160	7167	25 %	0 %	75 %	0 %	116662346
13	NC_008539	CGGT	2	8	8055	8062	0 %	25 %	50 %	25 %	116662346
14	NC_008539	AGCC	2	8	8345	8352	25 %	0 %	25 %	50 %	116662346
15	NC_008539	TGCA	2	8	9174	9181	25 %	25 %	25 %	25 %	304570609
16	NC_008539	GAAG	2	8	9401	9408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008539	TCTT	2	8	9896	9903	0 %	75 %	0 %	25 %	116662347
18	NC_008539	GAAG	2	8	10033	10040	50 %	0 %	50 %	0 %	116662347
19	NC_008539	CTGG	2	8	10290	10297	0 %	25 %	50 %	25 %	116662348
20	NC_008539	GTTC	2	8	10419	10426	0 %	50 %	25 %	25 %	116662348
21	NC_008539	GTCG	2	8	10617	10624	0 %	25 %	50 %	25 %	116662348
22	NC_008539	TCTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	116662348
23	NC_008539	GCCG	2	8	10866	10873	0 %	0 %	50 %	50 %	116662348
24	NC_008539	CCGT	2	8	10904	10911	0 %	25 %	25 %	50 %	116662348
25	NC_008539	GCCG	2	8	10981	10988	0 %	0 %	50 %	50 %	116662348
26	NC_008539	TCTG	2	8	11251	11258	0 %	50 %	25 %	25 %	116662349
27	NC_008539	TTGC	2	8	11280	11287	0 %	50 %	25 %	25 %	116662349
28	NC_008539	GGCT	2	8	11541	11548	0 %	25 %	50 %	25 %	116662349
29	NC_008539	CGTT	2	8	11557	11564	0 %	50 %	25 %	25 %	116662349
30	NC_008539	CACC	2	8	12907	12914	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_008539	CAAC	2	8	13415	13422	50 %	0 %	0 %	50 %	116662352
32	NC_008539	GCAG	2	8	13582	13589	25 %	0 %	50 %	25 %	116662352
33	NC_008539	CGGA	2	8	13799	13806	25 %	0 %	50 %	25 %	116662352
34	NC_008539	CCCA	2	8	14077	14084	25 %	0 %	0 %	75 %	116662352
35	NC_008539	GGCA	2	8	14153	14160	25 %	0 %	50 %	25 %	116662353
36	NC_008539	CGCC	2	8	14345	14352	0 %	0 %	25 %	75 %	116662353
37	NC_008539	GCTG	2	8	14392	14399	0 %	25 %	50 %	25 %	116662353
38	NC_008539	CGCC	2	8	14602	14609	0 %	0 %	25 %	75 %	116662353
39	NC_008539	GCCG	2	8	14983	14990	0 %	0 %	50 %	50 %	116662354
40	NC_008539	GGAT	2	8	15258	15265	25 %	25 %	50 %	0 %	116662354
41	NC_008539	CAGC	2	8	15310	15317	25 %	0 %	25 %	50 %	116662354
42	NC_008539	CGGA	2	8	15473	15480	25 %	0 %	50 %	25 %	116662354
43	NC_008539	ACCA	2	8	15761	15768	50 %	0 %	0 %	50 %	116662354
44	NC_008539	TGGC	2	8	16076	16083	0 %	25 %	50 %	25 %	116662354
45	NC_008539	CAGC	2	8	17249	17256	25 %	0 %	25 %	50 %	116662357
46	NC_008539	CGGC	2	8	17387	17394	0 %	0 %	50 %	50 %	116662357
47	NC_008539	AAGG	2	8	17566	17573	50 %	0 %	50 %	0 %	116662357
48	NC_008539	TCCC	2	8	17744	17751	0 %	25 %	0 %	75 %	116662357
49	NC_008539	GGCC	2	8	18366	18373	0 %	0 %	50 %	50 %	116662358
50	NC_008539	GCCG	2	8	18882	18889	0 %	0 %	50 %	50 %	116662358
51	NC_008539	TCCG	2	8	19147	19154	0 %	25 %	25 %	50 %	116662358
52	NC_008539	GATC	2	8	19299	19306	25 %	25 %	25 %	25 %	116662358
53	NC_008539	CGTT	2	8	19424	19431	0 %	50 %	25 %	25 %	116662358
54	NC_008539	GTCG	2	8	19471	19478	0 %	25 %	50 %	25 %	116662358
55	NC_008539	ACGA	2	8	19688	19695	50 %	0 %	25 %	25 %	116662358
56	NC_008539	CGGG	2	8	19882	19889	0 %	0 %	75 %	25 %	116662358
57	NC_008539	GCCG	2	8	20091	20098	0 %	0 %	50 %	50 %	116662358
58	NC_008539	TCAT	2	8	20327	20334	25 %	50 %	0 %	25 %	116662358
59	NC_008539	CCTT	2	8	20541	20548	0 %	50 %	0 %	50 %	116662358
60	NC_008539	GCCA	2	8	20762	20769	25 %	0 %	25 %	50 %	116662358
61	NC_008539	GTTC	2	8	21278	21285	0 %	50 %	25 %	25 %	116662359
62	NC_008539	CGAT	2	8	21312	21319	25 %	25 %	25 %	25 %	116662359
63	NC_008539	GCCG	2	8	21571	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	116662359
64	NC_008539	AACT	2	8	21950	21957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008539	CCCT	2	8	22126	22133	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_008539	CCGG	2	8	22174	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	116662360
67	NC_008539	GGAA	3	12	22207	22218	50 %	0 %	50 %	0 %	116662360
68	NC_008539	CCGG	2	8	22776	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008539	AAGA	2	8	23113	23120	75 %	0 %	25 %	0 %	116662361
70	NC_008539	GGCT	2	8	23197	23204	0 %	25 %	50 %	25 %	116662361
71	NC_008539	AGCC	2	8	23492	23499	25 %	0 %	25 %	50 %	116662361
72	NC_008539	CCAC	2	8	23784	23791	25 %	0 %	0 %	75 %	116662362
73	NC_008539	AGGA	2	8	24159	24166	50 %	0 %	50 %	0 %	116662362
74	NC_008539	CCGA	2	8	24248	24255	25 %	0 %	25 %	50 %	116662362
75	NC_008539	ACGG	2	8	24425	24432	25 %	0 %	50 %	25 %	116662362
76	NC_008539	CCAG	2	8	24445	24452	25 %	0 %	25 %	50 %	116662362
77	NC_008539	AACG	2	8	25962	25969	50 %	0 %	25 %	25 %	116662365
78	NC_008539	GTGC	2	8	26096	26103	0 %	25 %	50 %	25 %	116662365
79	NC_008539	CCGG	2	8	27187	27194	0 %	0 %	50 %	50 %	116662365
80	NC_008539	CCGG	2	8	27522	27529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008539	TTCA	2	8	27593	27600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008539	GACT	2	8	27911	27918	25 %	25 %	25 %	25 %	116662366
83	NC_008539	CCCT	2	8	28488	28495	0 %	25 %	0 %	75 %	116662366
84	NC_008539	TTGA	2	8	28590	28597	25 %	50 %	25 %	0 %	116662366
85	NC_008539	GAAC	2	8	29183	29190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008539	CCGG	2	8	29320	29327	0 %	0 %	50 %	50 %	116662367
87	NC_008539	CCGG	2	8	29418	29425	0 %	0 %	50 %	50 %	116662367
88	NC_008539	GTGG	2	8	29919	29926	0 %	25 %	75 %	0 %	116662368
89	NC_008539	TTCC	2	8	30835	30842	0 %	50 %	0 %	50 %	116662368
90	NC_008539	TCAA	2	8	30911	30918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008539	CCAG	2	8	30932	30939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008539	TGGG	2	8	31014	31021	0 %	25 %	75 %	0 %	116662369
93	NC_008539	GAAG	2	8	31757	31764	50 %	0 %	50 %	0 %	116662369
94	NC_008539	GCAG	2	8	32194	32201	25 %	0 %	50 %	25 %	116662369
95	NC_008539	CGTT	2	8	32605	32612	0 %	50 %	25 %	25 %	116662370
96	NC_008539	CCGG	2	8	32753	32760	0 %	0 %	50 %	50 %	116662370
97	NC_008539	GCCG	2	8	33238	33245	0 %	0 %	50 %	50 %	116662370
98	NC_008539	GCCG	2	8	34378	34385	0 %	0 %	50 %	50 %	116662371
99	NC_008539	GCCG	2	8	34432	34439	0 %	0 %	50 %	50 %	116662371
100	NC_008539	GTCG	2	8	34716	34723	0 %	25 %	50 %	25 %	116662372
101	NC_008539	GCCG	2	8	35058	35065	0 %	0 %	50 %	50 %	116662372
102	NC_008539	CCAG	2	8	35594	35601	25 %	0 %	25 %	50 %	116662372
103	NC_008539	GAGG	2	8	35796	35803	25 %	0 %	75 %	0 %	116662372
104	NC_008539	GTGG	2	8	36408	36415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008539	GGGC	2	8	36804	36811	0 %	0 %	75 %	25 %	116662373
106	NC_008539	AAGG	2	8	37079	37086	50 %	0 %	50 %	0 %	116662373
107	NC_008539	GCCC	2	8	37513	37520	0 %	0 %	25 %	75 %	116662374
108	NC_008539	GCCG	2	8	37882	37889	0 %	0 %	50 %	50 %	116662374
109	NC_008539	CCCG	2	8	38688	38695	0 %	0 %	25 %	75 %	116662375
110	NC_008539	GCCT	2	8	38793	38800	0 %	25 %	25 %	50 %	116662375
111	NC_008539	CGGA	2	8	38826	38833	25 %	0 %	50 %	25 %	116662375
112	NC_008539	CGTT	2	8	39198	39205	0 %	50 %	25 %	25 %	116662376
113	NC_008539	GCAC	2	8	39362	39369	25 %	0 %	25 %	50 %	116662376
114	NC_008539	GACG	2	8	39512	39519	25 %	0 %	50 %	25 %	116662376
115	NC_008539	GGAT	2	8	40241	40248	25 %	25 %	50 %	0 %	116662376
116	NC_008539	GAAG	2	8	40264	40271	50 %	0 %	50 %	0 %	116662376
117	NC_008539	CGCC	2	8	40708	40715	0 %	0 %	25 %	75 %	116662376
118	NC_008539	AGGC	2	8	41060	41067	25 %	0 %	50 %	25 %	116662377
119	NC_008539	CTGG	2	8	41711	41718	0 %	25 %	50 %	25 %	116662378
120	NC_008539	ACCC	2	8	42194	42201	25 %	0 %	0 %	75 %	116662378
121	NC_008539	GGCC	2	8	42346	42353	0 %	0 %	50 %	50 %	116662379
122	NC_008539	GGCT	2	8	42460	42467	0 %	25 %	50 %	25 %	116662379
123	NC_008539	CACC	2	8	42723	42730	25 %	0 %	0 %	75 %	116662379
124	NC_008539	CTGG	2	8	42765	42772	0 %	25 %	50 %	25 %	116662379
125	NC_008539	TCGT	2	8	43165	43172	0 %	50 %	25 %	25 %	116662380
126	NC_008539	CTGC	2	8	43624	43631	0 %	25 %	25 %	50 %	116662380
127	NC_008539	GGCT	2	8	43729	43736	0 %	25 %	50 %	25 %	116662380
128	NC_008539	CCCG	2	8	43794	43801	0 %	0 %	25 %	75 %	116662380
129	NC_008539	ACTC	2	8	44214	44221	25 %	25 %	0 %	50 %	116662380
130	NC_008539	ATCC	2	8	44372	44379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008539	CCCG	2	8	44660	44667	0 %	0 %	25 %	75 %	116662381
132	NC_008539	GCCA	2	8	44719	44726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008539	ACCA	2	8	45022	45029	50 %	0 %	0 %	50 %	116662382
134	NC_008539	GCAG	2	8	45185	45192	25 %	0 %	50 %	25 %	116662382
135	NC_008539	CGGG	2	8	45614	45621	0 %	0 %	75 %	25 %	116662382
136	NC_008539	GCAG	2	8	45682	45689	25 %	0 %	50 %	25 %	116662382
137	NC_008539	CCGG	2	8	45727	45734	0 %	0 %	50 %	50 %	116662382
138	NC_008539	GAAC	2	8	46107	46114	50 %	0 %	25 %	25 %	116662383
139	NC_008539	GGCT	2	8	46340	46347	0 %	25 %	50 %	25 %	116662383
140	NC_008539	GCGG	2	8	46564	46571	0 %	0 %	75 %	25 %	116662383
141	NC_008539	CCGC	2	8	46721	46728	0 %	0 %	25 %	75 %	116662383
142	NC_008539	GGCG	2	8	48431	48438	0 %	0 %	75 %	25 %	116662384
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268	NC_008539	CAGG	2	8	95739	95746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
269	NC_008539	ACCA	2	8	95751	95758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.